RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583658.1

LLGL2-222, Transcript of LLGL2, scribble cell polarity complex component, human

TSL 3

Gene LLGL2, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LLGL2-222	ENST00000583658	KCNA6	P17658	529 aa		28.36	■■■□□ 2.13
LLGL2-222	ENST00000583658	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		28.35	■■■□□ 2.13
LLGL2-222	ENST00000583658	ALK	Q9UM73	1620 aa		28.33	■■■□□ 2.13
LLGL2-222	ENST00000583658	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	28.33	■■■□□ 2.13
LLGL2-222	ENST00000583658	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	28.32	■■■□□ 2.12
LLGL2-222	ENST00000583658	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		28.32	■■■□□ 2.12
LLGL2-222	ENST00000583658	NWD1	Q149M9	1564 aa		28.32	■■■□□ 2.12
LLGL2-222	ENST00000583658	PIP4K2B	P78356	416 aa		28.31	■■■□□ 2.12
LLGL2-222	ENST00000583658	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	28.31	■■■□□ 2.12
LLGL2-222	ENST00000583658	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	28.31	■■■□□ 2.12
LLGL2-222	ENST00000583658	BCAN	Q96GW7	911 aa		28.3	■■■□□ 2.12
LLGL2-222	ENST00000583658	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	28.29	■■■□□ 2.12
LLGL2-222	ENST00000583658	TBX22	Q9Y458	520 aa		28.27	■■■□□ 2.12
LLGL2-222	ENST00000583658	DIP2A	Q14689	1571 aa		28.27	■■■□□ 2.12
LLGL2-222	ENST00000583658	TRPM2	O94759	1503 aa		28.25	■■■□□ 2.11
LLGL2-222	ENST00000583658	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	28.24	■■■□□ 2.11
LLGL2-222	ENST00000583658	TMEM94	Q12767	1356 aa		28.24	■■■□□ 2.11
LLGL2-222	ENST00000583658	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		28.24	■■■□□ 2.11
LLGL2-222	ENST00000583658	HSPA1L	P34931	641 aa		28.23	■■■□□ 2.11
LLGL2-222	ENST00000583658	PIK3R4	Q99570	1358 aa		28.23	■■■□□ 2.11
LLGL2-222	ENST00000583658	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	28.22	■■■□□ 2.11
LLGL2-222	ENST00000583658	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		28.2	■■■□□ 2.11
LLGL2-222	ENST00000583658	TRIM52	Q96A61	297 aa		28.2	■■■□□ 2.1
LLGL2-222	ENST00000583658	CLTCL1	P53675	1640 aa		28.18	■■■□□ 2.1
LLGL2-222	ENST00000583658	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		28.17	■■■□□ 2.1
LLGL2-222	ENST00000583658	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	28.17	■■■□□ 2.1
LLGL2-222	ENST00000583658	KIF1B	O60333	1816 aa		28.15	■■■□□ 2.1
LLGL2-222	ENST00000583658	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	28.15	■■■□□ 2.1
LLGL2-222	ENST00000583658	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	28.14	■■■□□ 2.1
LLGL2-222	ENST00000583658	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		28.13	■■■□□ 2.09
LLGL2-222	ENST00000583658	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		28.13	■■■□□ 2.09
LLGL2-222	ENST00000583658	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	28.13	■■■□□ 2.09
LLGL2-222	ENST00000583658	MSH6	P52701	1360 aa		28.12	■■■□□ 2.09
LLGL2-222	ENST00000583658	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	28.09	■■■□□ 2.09
LLGL2-222	ENST00000583658	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		28.08	■■■□□ 2.09
LLGL2-222	ENST00000583658	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		28.08	■■■□□ 2.09
LLGL2-222	ENST00000583658	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		28.04	■■■□□ 2.08
LLGL2-222	ENST00000583658	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	28.04	■■■□□ 2.08
LLGL2-222	ENST00000583658	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	28.02	■■■□□ 2.08
LLGL2-222	ENST00000583658	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		28.01	■■■□□ 2.07
LLGL2-222	ENST00000583658	PTPRU	Q92729	1446 aa		28.01	■■■□□ 2.07
LLGL2-222	ENST00000583658	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	28	■■■□□ 2.07
LLGL2-222	ENST00000583658	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		28	■■■□□ 2.07
LLGL2-222	ENST00000583658	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	27.99	■■■□□ 2.07
LLGL2-222	ENST00000583658	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		27.98	■■■□□ 2.07
LLGL2-222	ENST00000583658	SLAIN2	Q9P270	581 aa		27.98	■■■□□ 2.07
LLGL2-222	ENST00000583658	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		27.98	■■■□□ 2.07
LLGL2-222	ENST00000583658	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		27.97	■■■□□ 2.07
LLGL2-222	ENST00000583658	ILDR2	Q71H61	639 aa		27.96	■■■□□ 2.07
LLGL2-222	ENST00000583658	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		27.95	■■■□□ 2.07
LLGL2-222	ENST00000583658	C14orf37	Q86TY3	774 aa		27.95	■■■□□ 2.06
LLGL2-222	ENST00000583658	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		27.95	■■■□□ 2.06
LLGL2-222	ENST00000583658	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	27.94	■■■□□ 2.06
LLGL2-222	ENST00000583658	MET	P08581	1390 aa		27.94	■■■□□ 2.06
LLGL2-222	ENST00000583658	PPL	O60437	1756 aa		27.93	■■■□□ 2.06
LLGL2-222	ENST00000583658	DCC	P43146	1447 aa		27.92	■■■□□ 2.06
LLGL2-222	ENST00000583658	ATF3	P18847	181 aa		27.91	■■■□□ 2.06
LLGL2-222	ENST00000583658	FOXD1	Q16676	465 aa		27.9	■■■□□ 2.06
LLGL2-222	ENST00000583658	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
LLGL2-222	ENST00000583658	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		27.86	■■■□□ 2.05
LLGL2-222	ENST00000583658	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		27.86	■■■□□ 2.05
LLGL2-222	ENST00000583658	PTCH1	Q13635	1447 aa		27.84	■■■□□ 2.05
LLGL2-222	ENST00000583658	SOCS7	O14512	581 aa		27.84	■■■□□ 2.05
LLGL2-222	ENST00000583658	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		27.84	■■■□□ 2.05
LLGL2-222	ENST00000583658	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		27.84	■■■□□ 2.05
LLGL2-222	ENST00000583658	PHLPP1	O60346	1717 aa		27.84	■■■□□ 2.05
LLGL2-222	ENST00000583658	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
LLGL2-222	ENST00000583658	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		27.82	■■■□□ 2.04
LLGL2-222	ENST00000583658	IFT172	Q9UG01	1749 aa		27.8	■■■□□ 2.04
LLGL2-222	ENST00000583658	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
LLGL2-222	ENST00000583658	HRC	P23327	699 aa		27.79	■■■□□ 2.04
LLGL2-222	ENST00000583658	JCAD	Q9P266	1359 aa		27.77	■■■□□ 2.04
LLGL2-222	ENST00000583658	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
LLGL2-222	ENST00000583658	RGL3	Q3MIN7	710 aa		27.75	■■■□□ 2.03
LLGL2-222	ENST00000583658	MST1R	Q04912	1400 aa		27.75	■■■□□ 2.03
LLGL2-222	ENST00000583658	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		27.74	■■■□□ 2.03
LLGL2-222	ENST00000583658	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		27.73	■■■□□ 2.03
LLGL2-222	ENST00000583658	BRINP3	Q76B58	766 aa		27.73	■■■□□ 2.03
LLGL2-222	ENST00000583658	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		27.72	■■■□□ 2.03
LLGL2-222	ENST00000583658	PIK3C2G	O75747	1445 aa		27.7	■■■□□ 2.03
LLGL2-222	ENST00000583658	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		27.7	■■■□□ 2.02
LLGL2-222	ENST00000583658	TECPR2	O15040	1411 aa		27.67	■■■□□ 2.02
LLGL2-222	ENST00000583658	MYOM2	P54296	1465 aa		27.66	■■■□□ 2.02
LLGL2-222	ENST00000583658	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		27.66	■■■□□ 2.02
LLGL2-222	ENST00000583658	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		27.65	■■■□□ 2.02
LLGL2-222	ENST00000583658	SHPRH	Q149N8	1683 aa		27.65	■■■□□ 2.02
LLGL2-222	ENST00000583658	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		27.64	■■■□□ 2.02
LLGL2-222	ENST00000583658	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	27.64	■■■□□ 2.02
LLGL2-222	ENST00000583658	ABCC11	Q96J66	1382 aa		27.63	■■■□□ 2.01
LLGL2-222	ENST00000583658	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		27.63	■■■□□ 2.01
LLGL2-222	ENST00000583658	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		27.63	■■■□□ 2.01
LLGL2-222	ENST00000583658	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	27.62	■■■□□ 2.01
LLGL2-222	ENST00000583658	LAMC1	P11047	1609 aa		27.61	■■■□□ 2.01
LLGL2-222	ENST00000583658	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		27.6	■■■□□ 2.01
LLGL2-222	ENST00000583658	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
LLGL2-222	ENST00000583658	SIRT1	Q96EB6	747 aa		27.57	■■■□□ 2
LLGL2-222	ENST00000583658	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
LLGL2-222	ENST00000583658	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
LLGL2-222	ENST00000583658	STAC3	Q96MF2	364 aa		27.56	■■■□□ 2
LLGL2-222	ENST00000583658	STK26	Q9P289	416 aa		27.54	■■■□□ 2

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