RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576589.1

NOMO3-217, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

TSL 5

Gene NOMO3, Length 683 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-217ENST00000576589 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP41.99■■■■■ 4.31
NOMO3-217ENST00000576589 HSPA1LP34931 641 aa41.98■■■■■ 4.31
NOMO3-217ENST00000576589 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa41.97■■■■■ 4.31
NOMO3-217ENST00000576589 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa41.95■■■■■ 4.31
NOMO3-217ENST00000576589 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa41.95■■■■■ 4.31
NOMO3-217ENST00000576589 HDGFP51858 240 aaKnown RBP41.94■■■■■ 4.3
NOMO3-217ENST00000576589 MPHOSPH9Q99550 1183 aa41.94■■■■■ 4.3
NOMO3-217ENST00000576589 RIMS2Q9UQ26 1411 aa41.93■■■■■ 4.3
NOMO3-217ENST00000576589 ZFYVE9O95405 1425 aa41.9■■■■■ 4.3
NOMO3-217ENST00000576589 FOXD1Q16676 465 aa41.9■■■■■ 4.3
NOMO3-217ENST00000576589 TRPM2O94759 1503 aa41.9■■■■■ 4.3
NOMO3-217ENST00000576589 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP41.88■■■■■ 4.29
NOMO3-217ENST00000576589 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP41.87■■■■■ 4.29
NOMO3-217ENST00000576589 LRRC7Q96NW7 1537 aa41.85■■■■■ 4.29
NOMO3-217ENST00000576589 BCANQ96GW7 911 aa41.85■■■■■ 4.29
NOMO3-217ENST00000576589 STRCP1A6NGW2 1772 aa41.84■■■■■ 4.29
NOMO3-217ENST00000576589 MYO5BQ9ULV0 1848 aa41.83■■■■■ 4.29
NOMO3-217ENST00000576589 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP41.82■■■■■ 4.29
NOMO3-217ENST00000576589 ALKQ9UM73 1620 aa41.81■■■■■ 4.28
NOMO3-217ENST00000576589 CLTCL1P53675 1640 aa41.8■■■■■ 4.28
NOMO3-217ENST00000576589 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP41.8■■■■■ 4.28
NOMO3-217ENST00000576589 SLC26A8Q96RN1 970 aa41.8■■■■■ 4.28
NOMO3-217ENST00000576589 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP41.8■■■■■ 4.28
NOMO3-217ENST00000576589 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa41.78■■■■■ 4.28
NOMO3-217ENST00000576589 HRCP23327 699 aa41.75■■■■■ 4.27
NOMO3-217ENST00000576589 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP41.67■■■■■ 4.26
NOMO3-217ENST00000576589 CCDC144AA2RUR9 1427 aa41.66■■■■■ 4.26
NOMO3-217ENST00000576589 KCNA6P17658 529 aa41.62■■■■■ 4.25
NOMO3-217ENST00000576589 TBX22Q9Y458 520 aa41.62■■■■■ 4.25
NOMO3-217ENST00000576589 KIF1BO60333 1816 aa41.6■■■■■ 4.25
NOMO3-217ENST00000576589 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa41.58■■■■■ 4.25
NOMO3-217ENST00000576589 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa41.55■■■■■ 4.24
NOMO3-217ENST00000576589 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa41.55■■■■■ 4.24
NOMO3-217ENST00000576589 VGFO15240 615 aaPredicted RBP41.5■■■■■ 4.23
NOMO3-217ENST00000576589 RGL3Q3MIN7 710 aa41.5■■■■■ 4.23
NOMO3-217ENST00000576589 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP41.48■■■■■ 4.23
NOMO3-217ENST00000576589 DIP2AQ14689 1571 aa41.47■■■■■ 4.23
NOMO3-217ENST00000576589 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP41.47■■■■■ 4.23
NOMO3-217ENST00000576589 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa41.46■■■■■ 4.23
NOMO3-217ENST00000576589 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP41.46■■■■■ 4.23
NOMO3-217ENST00000576589 TMEM94Q12767 1356 aa41.45■■■■■ 4.23
NOMO3-217ENST00000576589 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa41.44■■■■■ 4.22
NOMO3-217ENST00000576589 NWD1Q149M9 1564 aa41.43■■■■■ 4.22
NOMO3-217ENST00000576589 PIK3R4Q99570 1358 aa41.43■■■■■ 4.22
NOMO3-217ENST00000576589 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa41.43■■■■■ 4.22
NOMO3-217ENST00000576589 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP41.41■■■■■ 4.22
NOMO3-217ENST00000576589 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa41.38■■■■■ 4.21
NOMO3-217ENST00000576589 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP41.38■■■■■ 4.21
NOMO3-217ENST00000576589 FAM135BQ49AJ0 1406 aa41.36■■■■■ 4.21
NOMO3-217ENST00000576589 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP41.36■■■■■ 4.21
NOMO3-217ENST00000576589 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa41.35■■■■■ 4.21
NOMO3-217ENST00000576589 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP41.33■■■■■ 4.21
NOMO3-217ENST00000576589 METP08581 1390 aa41.33■■■■■ 4.21
NOMO3-217ENST00000576589 PTPRUQ92729 1446 aa41.32■■■■■ 4.21
NOMO3-217ENST00000576589 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa41.3■■■■■ 4.2
NOMO3-217ENST00000576589 PPLO60437 1756 aa41.29■■■■■ 4.2
NOMO3-217ENST00000576589 MSH6P52701 1360 aa41.19■■■■■ 4.18
NOMO3-217ENST00000576589 C14orf37Q86TY3 774 aa41.18■■■■■ 4.18
NOMO3-217ENST00000576589 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa41.18■■■■■ 4.18
NOMO3-217ENST00000576589 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa41.16■■■■■ 4.18
NOMO3-217ENST00000576589 IFT172Q9UG01 1749 aa41.15■■■■■ 4.18
NOMO3-217ENST00000576589 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP41.14■■■■■ 4.18
NOMO3-217ENST00000576589 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP41.13■■■■■ 4.18
NOMO3-217ENST00000576589 SLAIN2Q9P270 581 aa41.13■■■■■ 4.17
NOMO3-217ENST00000576589 PIK3C2GO75747 1445 aa41.11■■■■■ 4.17
NOMO3-217ENST00000576589 MYOM2P54296 1465 aa41.09■■■■■ 4.17
NOMO3-217ENST00000576589 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP41.08■■■■■ 4.17
NOMO3-217ENST00000576589 C19orf44Q9H6X5 657 aa41.08■■■■■ 4.17
NOMO3-217ENST00000576589 DCAF11Q8TEB1 546 aa41.05■■■■■ 4.16
NOMO3-217ENST00000576589 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa41.05■■■■■ 4.16
NOMO3-217ENST00000576589 NRXN1Q9ULB1 1477 aa41.04■■■■■ 4.16
NOMO3-217ENST00000576589 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP41.03■■■■■ 4.16
NOMO3-217ENST00000576589 TMEM132EQ6IEE7 984 aa41.01■■■■■ 4.16
NOMO3-217ENST00000576589 ATF3P18847 181 aa41■■■■■ 4.15
NOMO3-217ENST00000576589 PTCH1Q13635 1447 aa41■■■■■ 4.15
NOMO3-217ENST00000576589 ROBO2Q9HCK4 1378 aa40.99■■■■■ 4.15
NOMO3-217ENST00000576589 CFAP70Q5T0N1 1121 aa40.99■■■■■ 4.15
NOMO3-217ENST00000576589 CADPS2Q86UW7 1296 aa40.99■■■■■ 4.15
NOMO3-217ENST00000576589 STAC3Q96MF2 364 aa40.99■■■■■ 4.15
NOMO3-217ENST00000576589 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP40.99■■■■■ 4.15
NOMO3-217ENST00000576589 STK26Q9P289 416 aa40.97■■■■■ 4.15
NOMO3-217ENST00000576589 PRAG1Q86YV5 1406 aa40.96■■■■■ 4.15
NOMO3-217ENST00000576589 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP40.94■■■■■ 4.14
NOMO3-217ENST00000576589 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa40.92■■■■■ 4.14
NOMO3-217ENST00000576589 PHLPP1O60346 1717 aa40.91■■■■■ 4.14
NOMO3-217ENST00000576589 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP40.9■■■■■ 4.14
NOMO3-217ENST00000576589 POTEAQ6S8J7 498 aa40.9■■■■■ 4.14
NOMO3-217ENST00000576589 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa40.9■■■■■ 4.14
NOMO3-217ENST00000576589 ABCC11Q96J66 1382 aa40.89■■■■■ 4.14
NOMO3-217ENST00000576589 JCADQ9P266 1359 aa40.89■■■■■ 4.14
NOMO3-217ENST00000576589 SIN3AQ96ST3 1273 aa40.89■■■■■ 4.14
NOMO3-217ENST00000576589 DCCP43146 1447 aa40.89■■■■■ 4.14
NOMO3-217ENST00000576589 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP40.87■■■■■ 4.13
NOMO3-217ENST00000576589 TECPR2O15040 1411 aa40.85■■■■■ 4.13
NOMO3-217ENST00000576589 LAMC1P11047 1609 aa40.82■■■■■ 4.13
NOMO3-217ENST00000576589 NEUROD1Q13562 356 aa40.82■■■■■ 4.13
NOMO3-217ENST00000576589 WAPLQ7Z5K2 1190 aa40.82■■■■■ 4.13
NOMO3-217ENST00000576589 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP40.78■■■■■ 4.12
NOMO3-217ENST00000576589 SIRT1Q96EB6 747 aa40.76■■■■■ 4.12
NOMO3-217ENST00000576589 NALCNQ8IZF0 1738 aa40.76■■■■■ 4.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms