RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570600.5

TMEM256-PLSCR3-202, Transcript of TMEM256-PLSCR3 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2

Gene TMEM256-PLSCR3, Length 1,526 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 CCDC144AA2RUR9 1427 aa28.82■■■□□ 2.2
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.82■■■□□ 2.2
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 PCGF6Q9BYE7 350 aa28.8■■■□□ 2.2
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 KIF1BO60333 1816 aa28.79■■■□□ 2.2
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 IQGAP1P46940 1657 aa28.78■■■□□ 2.2
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa28.73■■■□□ 2.19
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 RGL3Q3MIN7 710 aa28.73■■■□□ 2.19
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP28.73■■■□□ 2.19
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.72■■■□□ 2.19
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa28.72■■■□□ 2.19
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 HDGFP51858 240 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa28.7■■■□□ 2.18
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 BCANQ96GW7 911 aa28.69■■■□□ 2.18
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 LTBP4Q8N2S1 1624 aa28.67■■■□□ 2.18
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa28.63■■■□□ 2.17
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa28.62■■■□□ 2.17
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 PPLO60437 1756 aa28.6■■■□□ 2.17
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.59■■■□□ 2.17
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa28.58■■■□□ 2.17
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 VGFO15240 615 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 CERKQ8TCT0 537 aa28.58■■■□□ 2.17
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa28.58■■■□□ 2.17
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 SIN3AQ96ST3 1273 aa28.57■■■□□ 2.16
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 TBX22Q9Y458 520 aa28.56■■■□□ 2.16
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa28.55■■■□□ 2.16
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 IFT172Q9UG01 1749 aa28.54■■■□□ 2.16
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 KCNA6P17658 529 aa28.5■■■□□ 2.15
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 METP08581 1390 aa28.49■■■□□ 2.15
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 DIP2AQ14689 1571 aa28.48■■■□□ 2.15
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 PTPRUQ92729 1446 aa28.47■■■□□ 2.15
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 CPS1P31327 1500 aa28.47■■■□□ 2.15
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 NEUROD1Q13562 356 aa28.47■■■□□ 2.15
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.46■■■□□ 2.15
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.46■■■□□ 2.15
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 LRRC7Q96NW7 1537 aa28.45■■■□□ 2.14
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 ALKQ9UM73 1620 aa28.44■■■□□ 2.14
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 NWD1Q149M9 1564 aa28.43■■■□□ 2.14
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 PIK3C2GO75747 1445 aa28.43■■■□□ 2.14
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 MYOM2P54296 1465 aa28.42■■■□□ 2.14
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa28.42■■■□□ 2.14
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 NRXN1Q9ULB1 1477 aa28.42■■■□□ 2.14
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 PIK3R4Q99570 1358 aa28.41■■■□□ 2.14
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 CFAP70Q5T0N1 1121 aa28.38■■■□□ 2.13
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 L3MBTL2Q969R5 705 aa28.37■■■□□ 2.13
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 TMEM94Q12767 1356 aa28.37■■■□□ 2.13
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 TMEM132EQ6IEE7 984 aa28.36■■■□□ 2.13
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa28.34■■■□□ 2.13
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.34■■■□□ 2.13
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 FBXO41Q8TF61 875 aa28.28■■■□□ 2.12
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 STAC3Q96MF2 364 aa28.28■■■□□ 2.12
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 STK26Q9P289 416 aa28.28■■■□□ 2.12
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 UBAP1LF5GYI3 381 aa28.26■■■□□ 2.11
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 ROBO2Q9HCK4 1378 aa28.26■■■□□ 2.11
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 PRAG1Q86YV5 1406 aa28.23■■■□□ 2.11
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 ADGRB1O14514 1584 aa28.21■■■□□ 2.11
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 LAMC1P11047 1609 aa28.21■■■□□ 2.11
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 PTCH1Q13635 1447 aa28.19■■■□□ 2.1
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 TONSLQ96HA7 1378 aa28.19■■■□□ 2.1
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 C14orf37Q86TY3 774 aa28.18■■■□□ 2.1
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 ABCC11Q96J66 1382 aa28.18■■■□□ 2.1
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 NBPF1Q3BBV0 1214 aa28.18■■■□□ 2.1
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 WAPLQ7Z5K2 1190 aa28.17■■■□□ 2.1
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 TECPR2O15040 1411 aa28.16■■■□□ 2.1
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 TOM1O60784 492 aa28.16■■■□□ 2.1
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa28.16■■■□□ 2.1
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa28.16■■■□□ 2.1
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 PIP4K2BP78356 416 aa28.15■■■□□ 2.1
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 NBPF8Q3BBV2 869 aa28.15■■■□□ 2.1
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 MSH6P52701 1360 aa28.15■■■□□ 2.1
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 CLSPNQ9HAW4 1339 aa28.13■■■□□ 2.09
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 C19orf44Q9H6X5 657 aa28.13■■■□□ 2.09
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 TRAK1Q9UPV9 953 aa28.12■■■□□ 2.09
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 KNDC1Q76NI1 1749 aa28.1■■■□□ 2.09
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa28.09■■■□□ 2.09
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 NALCNQ8IZF0 1738 aa28.09■■■□□ 2.09
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa28.09■■■□□ 2.09
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP28.07■■■□□ 2.08
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 PRAM1Q96QH2 718 aa28.07■■■□□ 2.08
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 SIRT1Q96EB6 747 aa28.06■■■□□ 2.08
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 FAM135BQ49AJ0 1406 aa28.05■■■□□ 2.08
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa28.04■■■□□ 2.08
TMEM256-PLSCR3-202ENST00000570600 ATF3P18847 181 aa28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 132.6 ms