RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569223.1

EHD4-202, Transcript of EH domain containing 4, humanhuman

TSL 2

Gene EHD4, Length 2,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4-202ENST00000569223 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP31.24■■■□□ 2.59
EHD4-202ENST00000569223 ABCA6Q8N139 1617 aa31.24■■■□□ 2.59
EHD4-202ENST00000569223 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa31.23■■■□□ 2.59
EHD4-202ENST00000569223 SYNMO15061 1565 aa31.22■■■□□ 2.59
EHD4-202ENST00000569223 RNF123Q5XPI4 1314 aa31.2■■■□□ 2.59
EHD4-202ENST00000569223 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP31.19■■■□□ 2.58
EHD4-202ENST00000569223 MYOM1P52179 1685 aa31.17■■■□□ 2.58
EHD4-202ENST00000569223 CDCA8Q53HL2 280 aa31.17■■■□□ 2.58
EHD4-202ENST00000569223 ADGRB3O60242 1522 aa31.16■■■□□ 2.58
EHD4-202ENST00000569223 NRXN1Q9ULB1 1477 aa31.14■■■□□ 2.58
EHD4-202ENST00000569223 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa31.14■■■□□ 2.58
EHD4-202ENST00000569223 NEO1Q92859 1461 aa31.14■■■□□ 2.58
EHD4-202ENST00000569223 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa31.13■■■□□ 2.57
EHD4-202ENST00000569223 INSRP06213 1382 aa31.13■■■□□ 2.57
EHD4-202ENST00000569223 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP31.13■■■□□ 2.57
EHD4-202ENST00000569223 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP31.13■■■□□ 2.57
EHD4-202ENST00000569223 CFAP70Q5T0N1 1121 aa31.12■■■□□ 2.57
EHD4-202ENST00000569223 NPATQ14207 1427 aa31.11■■■□□ 2.57
EHD4-202ENST00000569223 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP31.1■■■□□ 2.57
EHD4-202ENST00000569223 ABCC3O15438 1527 aa31.08■■■□□ 2.57
EHD4-202ENST00000569223 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa31.08■■■□□ 2.57
EHD4-202ENST00000569223 KNSTRNQ9Y448 316 aa31.08■■■□□ 2.57
EHD4-202ENST00000569223 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
EHD4-202ENST00000569223 PPLO60437 1756 aa31.06■■■□□ 2.56
EHD4-202ENST00000569223 GGT6Q6P531 493 aa31.06■■■□□ 2.56
EHD4-202ENST00000569223 MYO3AQ8NEV4 1616 aa31.05■■■□□ 2.56
EHD4-202ENST00000569223 NOS1P29475 1434 aa31.05■■■□□ 2.56
EHD4-202ENST00000569223 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa31.05■■■□□ 2.56
EHD4-202ENST00000569223 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa31.04■■■□□ 2.56
EHD4-202ENST00000569223 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP31.04■■■□□ 2.56
EHD4-202ENST00000569223 ERVK-7P63135 1459 aa31.03■■■□□ 2.56
EHD4-202ENST00000569223 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa31.03■■■□□ 2.56
EHD4-202ENST00000569223 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa31.03■■■□□ 2.56
EHD4-202ENST00000569223 PDE3BQ13370 1112 aa31.02■■■□□ 2.56
EHD4-202ENST00000569223 RICTORQ6R327 1708 aa31■■■□□ 2.55
EHD4-202ENST00000569223 SLC24A1O60721 1099 aa31■■■□□ 2.55
EHD4-202ENST00000569223 RAPGEF3O95398 923 aa31■■■□□ 2.55
EHD4-202ENST00000569223 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP30.99■■■□□ 2.55
EHD4-202ENST00000569223 CHGAP10645 457 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
EHD4-202ENST00000569223 PPP2R1AP30153 589 aa30.98■■■□□ 2.55
EHD4-202ENST00000569223 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa30.98■■■□□ 2.55
EHD4-202ENST00000569223 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa30.98■■■□□ 2.55
EHD4-202ENST00000569223 PIK3C2GO75747 1445 aa30.96■■■□□ 2.55
EHD4-202ENST00000569223 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa30.94■■■□□ 2.54
EHD4-202ENST00000569223 PIK3C2BO00750 1634 aa30.93■■■□□ 2.54
EHD4-202ENST00000569223 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
EHD4-202ENST00000569223 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa30.91■■■□□ 2.54
EHD4-202ENST00000569223 ADGRB1O14514 1584 aa30.89■■■□□ 2.54
EHD4-202ENST00000569223 RRP1P56182 461 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.54
EHD4-202ENST00000569223 RCAN3Q9UKA8 241 aa30.89■■■□□ 2.54
EHD4-202ENST00000569223 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
EHD4-202ENST00000569223 ADAMTS8Q9UP79 889 aa30.88■■■□□ 2.53
EHD4-202ENST00000569223 GLI2P10070 1586 aa30.87■■■□□ 2.53
EHD4-202ENST00000569223 CDCA7LQ96GN5 454 aa30.87■■■□□ 2.53
EHD4-202ENST00000569223 QRICH2Q9H0J4 1663 aa30.87■■■□□ 2.53
EHD4-202ENST00000569223 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP30.87■■■□□ 2.53
EHD4-202ENST00000569223 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa30.84■■■□□ 2.53
EHD4-202ENST00000569223 CCDC136Q96JN2 1154 aa30.84■■■□□ 2.53
EHD4-202ENST00000569223 YEATS2Q9ULM3 1422 aa30.83■■■□□ 2.53
EHD4-202ENST00000569223 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP30.83■■■□□ 2.53
EHD4-202ENST00000569223 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa30.82■■■□□ 2.52
EHD4-202ENST00000569223 CARD14Q9BXL6 1004 aa30.8■■■□□ 2.52
EHD4-202ENST00000569223 TRAK1Q9UPV9 953 aa30.8■■■□□ 2.52
EHD4-202ENST00000569223 MYT1Q01538 1121 aa30.78■■■□□ 2.52
EHD4-202ENST00000569223 TMEM132EQ6IEE7 984 aa30.75■■■□□ 2.51
EHD4-202ENST00000569223 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.74■■■□□ 2.51
EHD4-202ENST00000569223 FANCIQ9NVI1 1328 aa30.73■■■□□ 2.51
EHD4-202ENST00000569223 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP30.73■■■□□ 2.51
EHD4-202ENST00000569223 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa30.73■■■□□ 2.51
EHD4-202ENST00000569223 PREX1Q8TCU6 1659 aa30.72■■■□□ 2.51
EHD4-202ENST00000569223 VGFO15240 615 aaPredicted RBP30.71■■■□□ 2.51
EHD4-202ENST00000569223 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.71■■■□□ 2.51
EHD4-202ENST00000569223 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.71■■■□□ 2.51
EHD4-202ENST00000569223 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.71■■■□□ 2.51
EHD4-202ENST00000569223 EXOC6Q8TAG9 804 aa30.71■■■□□ 2.51
EHD4-202ENST00000569223 MYO5BQ9ULV0 1848 aa30.69■■■□□ 2.5
EHD4-202ENST00000569223 IDI1Q13907 227 aa30.68■■■□□ 2.5
EHD4-202ENST00000569223 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP30.68■■■□□ 2.5
EHD4-202ENST00000569223 DIP2BQ9P265 1576 aa30.68■■■□□ 2.5
EHD4-202ENST00000569223 ZNF521Q96K83 1311 aa30.68■■■□□ 2.5
EHD4-202ENST00000569223 NSD3Q9BZ95 1437 aa30.66■■■□□ 2.5
EHD4-202ENST00000569223 ZFYVE9O95405 1425 aa30.66■■■□□ 2.5
EHD4-202ENST00000569223 ANP32EQ9BTT0 268 aa30.66■■■□□ 2.5
EHD4-202ENST00000569223 SLC52A1Q9NWF4 448 aa30.66■■■□□ 2.5
EHD4-202ENST00000569223 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa30.64■■■□□ 2.5
EHD4-202ENST00000569223 USP32Q8NFA0 1604 aa30.64■■■□□ 2.5
EHD4-202ENST00000569223 TULP4Q9NRJ4 1543 aa30.63■■■□□ 2.49
EHD4-202ENST00000569223 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa30.62■■■□□ 2.49
EHD4-202ENST00000569223 FAM69CQ0P6D2 419 aa30.61■■■□□ 2.49
EHD4-202ENST00000569223 DUSP27Q5VZP5 1158 aa30.59■■■□□ 2.49
EHD4-202ENST00000569223 CCDC146Q8IYE0 955 aa30.59■■■□□ 2.49
EHD4-202ENST00000569223 TSPOAP1O95153 1857 aa30.59■■■□□ 2.49
EHD4-202ENST00000569223 MSH5O43196 834 aa30.59■■■□□ 2.49
EHD4-202ENST00000569223 GOLGA2Q08379 1002 aa30.59■■■□□ 2.49
EHD4-202ENST00000569223 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP30.59■■■□□ 2.49
EHD4-202ENST00000569223 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
EHD4-202ENST00000569223 PLIN1O60240 522 aa30.57■■■□□ 2.49
EHD4-202ENST00000569223 EVC2Q86UK5 1308 aa30.57■■■□□ 2.48
EHD4-202ENST00000569223 SHPRHQ149N8 1683 aa30.55■■■□□ 2.48
EHD4-202ENST00000569223 REREQ9P2R6 1566 aa30.55■■■□□ 2.48
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