RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568388.5

SPNS1-210, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 759 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-210ENST00000568388 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
SPNS1-210ENST00000568388 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.93■■□□□ 1.9
SPNS1-210ENST00000568388 PPLO60437 1756 aa26.93■■□□□ 1.9
SPNS1-210ENST00000568388 FBXO41Q8TF61 875 aa26.92■■□□□ 1.9
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
SPNS1-210ENST00000568388 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.9■■□□□ 1.9
SPNS1-210ENST00000568388 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.88■■□□□ 1.89
SPNS1-210ENST00000568388 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa26.88■■□□□ 1.89
SPNS1-210ENST00000568388 MYOM2P54296 1465 aa26.86■■□□□ 1.89
SPNS1-210ENST00000568388 ZFYVE9O95405 1425 aa26.85■■□□□ 1.89
SPNS1-210ENST00000568388 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
SPNS1-210ENST00000568388 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.83■■□□□ 1.89
SPNS1-210ENST00000568388 SLIT1O75093 1534 aa26.82■■□□□ 1.88
SPNS1-210ENST00000568388 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.82■■□□□ 1.88
SPNS1-210ENST00000568388 RIMS2Q9UQ26 1411 aa26.82■■□□□ 1.88
SPNS1-210ENST00000568388 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.81■■□□□ 1.88
SPNS1-210ENST00000568388 VGFO15240 615 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
SPNS1-210ENST00000568388 HDGFP51858 240 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
SPNS1-210ENST00000568388 CERKQ8TCT0 537 aa26.81■■□□□ 1.88
SPNS1-210ENST00000568388 NRXN1Q9ULB1 1477 aa26.81■■□□□ 1.88
SPNS1-210ENST00000568388 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP26.8■■□□□ 1.88
SPNS1-210ENST00000568388 PRAG1Q86YV5 1406 aa26.79■■□□□ 1.88
SPNS1-210ENST00000568388 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.78■■□□□ 1.88
SPNS1-210ENST00000568388 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa26.75■■□□□ 1.87
SPNS1-210ENST00000568388 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.75■■□□□ 1.87
SPNS1-210ENST00000568388 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa26.74■■□□□ 1.87
SPNS1-210ENST00000568388 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.74■■□□□ 1.87
SPNS1-210ENST00000568388 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
SPNS1-210ENST00000568388 PIK3C2GO75747 1445 aa26.72■■□□□ 1.87
SPNS1-210ENST00000568388 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa26.72■■□□□ 1.87
SPNS1-210ENST00000568388 EID1Q9Y6B2 187 aa26.71■■□□□ 1.87
SPNS1-210ENST00000568388 LTKP29376 864 aa26.69■■□□□ 1.86
SPNS1-210ENST00000568388 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
SPNS1-210ENST00000568388 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.69■■□□□ 1.86
SPNS1-210ENST00000568388 RALGAPBQ86X10 1494 aa26.68■■□□□ 1.86
SPNS1-210ENST00000568388 LAMC1P11047 1609 aa26.66■■□□□ 1.86
SPNS1-210ENST00000568388 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
SPNS1-210ENST00000568388 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.65■■□□□ 1.86
SPNS1-210ENST00000568388 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
SPNS1-210ENST00000568388 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa26.65■■□□□ 1.86
SPNS1-210ENST00000568388 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa26.64■■□□□ 1.86
SPNS1-210ENST00000568388 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa26.62■■□□□ 1.85
SPNS1-210ENST00000568388 GPRASP1Q5JY77 1395 aa26.61■■□□□ 1.85
SPNS1-210ENST00000568388 CFAP70Q5T0N1 1121 aa26.61■■□□□ 1.85
SPNS1-210ENST00000568388 ALKQ9UM73 1620 aa26.6■■□□□ 1.85
SPNS1-210ENST00000568388 IQGAP1P46940 1657 aa26.6■■□□□ 1.85
SPNS1-210ENST00000568388 MED14O60244 1454 aa26.59■■□□□ 1.85
SPNS1-210ENST00000568388 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.59■■□□□ 1.85
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
SPNS1-210ENST00000568388 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
SPNS1-210ENST00000568388 NBPF1Q3BBV0 1214 aa26.58■■□□□ 1.85
SPNS1-210ENST00000568388 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.84
SPNS1-210ENST00000568388 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa26.56■■□□□ 1.84
SPNS1-210ENST00000568388 ADGRB1O14514 1584 aa26.54■■□□□ 1.84
SPNS1-210ENST00000568388 DIP2AQ14689 1571 aa26.54■■□□□ 1.84
SPNS1-210ENST00000568388 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.53■■□□□ 1.84
SPNS1-210ENST00000568388 TBX22Q9Y458 520 aa26.53■■□□□ 1.84
SPNS1-210ENST00000568388 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
SPNS1-210ENST00000568388 BCANQ96GW7 911 aa26.51■■□□□ 1.83
SPNS1-210ENST00000568388 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa26.49■■□□□ 1.83
SPNS1-210ENST00000568388 TMEM132EQ6IEE7 984 aa26.46■■□□□ 1.83
SPNS1-210ENST00000568388 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
SPNS1-210ENST00000568388 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.45■■□□□ 1.82
SPNS1-210ENST00000568388 METP08581 1390 aa26.45■■□□□ 1.82
SPNS1-210ENST00000568388 SLC26A8Q96RN1 970 aa26.44■■□□□ 1.82
SPNS1-210ENST00000568388 PIK3R4Q99570 1358 aa26.44■■□□□ 1.82
SPNS1-210ENST00000568388 USP47Q96K76 1375 aa26.43■■□□□ 1.82
SPNS1-210ENST00000568388 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
SPNS1-210ENST00000568388 CPS1P31327 1500 aa26.42■■□□□ 1.82
SPNS1-210ENST00000568388 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
SPNS1-210ENST00000568388 KNDC1Q76NI1 1749 aa26.4■■□□□ 1.82
SPNS1-210ENST00000568388 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
SPNS1-210ENST00000568388 ABCC11Q96J66 1382 aa26.4■■□□□ 1.82
SPNS1-210ENST00000568388 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
SPNS1-210ENST00000568388 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
SPNS1-210ENST00000568388 DLC1Q96QB1 1528 aa26.38■■□□□ 1.81
SPNS1-210ENST00000568388 STRCP1A6NGW2 1772 aa26.38■■□□□ 1.81
SPNS1-210ENST00000568388 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
SPNS1-210ENST00000568388 SIRT1Q96EB6 747 aa26.37■■□□□ 1.81
SPNS1-210ENST00000568388 TECPR2O15040 1411 aa26.37■■□□□ 1.81
SPNS1-210ENST00000568388 PTPRUQ92729 1446 aa26.35■■□□□ 1.81
SPNS1-210ENST00000568388 TRAK1Q9UPV9 953 aa26.35■■□□□ 1.81
SPNS1-210ENST00000568388 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
SPNS1-210ENST00000568388 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.32■■□□□ 1.8
SPNS1-210ENST00000568388 STK26Q9P289 416 aa26.32■■□□□ 1.8
SPNS1-210ENST00000568388 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa26.31■■□□□ 1.8
SPNS1-210ENST00000568388 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.3■■□□□ 1.8
SPNS1-210ENST00000568388 FAM135BQ49AJ0 1406 aa26.3■■□□□ 1.8
SPNS1-210ENST00000568388 NWD1Q149M9 1564 aa26.29■■□□□ 1.8
SPNS1-210ENST00000568388 KCNA6P17658 529 aa26.28■■□□□ 1.8
SPNS1-210ENST00000568388 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
SPNS1-210ENST00000568388 SLC24A1O60721 1099 aa26.27■■□□□ 1.8
SPNS1-210ENST00000568388 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa26.27■■□□□ 1.8
SPNS1-210ENST00000568388 PTCH1Q13635 1447 aa26.27■■□□□ 1.8
SPNS1-210ENST00000568388 QRICH2Q9H0J4 1663 aa26.26■■□□□ 1.79
SPNS1-210ENST00000568388 TESK2Q96S53 571 aa26.26■■□□□ 1.79
SPNS1-210ENST00000568388 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
SPNS1-210ENST00000568388 LRRC7Q96NW7 1537 aa26.24■■□□□ 1.79
SPNS1-210ENST00000568388 ROBO2Q9HCK4 1378 aa26.23■■□□□ 1.79
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