RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568043.5

INO80E-212, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 2

Gene INO80E, Length 482 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-212ENST00000568043 PHLPP1O60346 1717 aa28.56■■■□□ 2.16
INO80E-212ENST00000568043 ZFYVE9O95405 1425 aa28.55■■■□□ 2.16
INO80E-212ENST00000568043 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.55■■■□□ 2.16
INO80E-212ENST00000568043 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
INO80E-212ENST00000568043 MSH6P52701 1360 aa28.53■■■□□ 2.16
INO80E-212ENST00000568043 SLAIN2Q9P270 581 aa28.53■■■□□ 2.16
INO80E-212ENST00000568043 ADGRL2O95490 1459 aa28.53■■■□□ 2.16
INO80E-212ENST00000568043 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.52■■■□□ 2.16
INO80E-212ENST00000568043 BCANQ96GW7 911 aa28.5■■■□□ 2.15
INO80E-212ENST00000568043 APLP2Q06481 763 aa28.49■■■□□ 2.15
INO80E-212ENST00000568043 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa28.49■■■□□ 2.15
INO80E-212ENST00000568043 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa28.49■■■□□ 2.15
INO80E-212ENST00000568043 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
INO80E-212ENST00000568043 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
INO80E-212ENST00000568043 RIMS2Q9UQ26 1411 aa28.47■■■□□ 2.15
INO80E-212ENST00000568043 JCADQ9P266 1359 aa28.46■■■□□ 2.15
INO80E-212ENST00000568043 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.44■■■□□ 2.14
INO80E-212ENST00000568043 LRP6O75581 1613 aa28.4■■■□□ 2.14
INO80E-212ENST00000568043 TBX22Q9Y458 520 aa28.4■■■□□ 2.14
INO80E-212ENST00000568043 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa28.39■■■□□ 2.14
INO80E-212ENST00000568043 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
INO80E-212ENST00000568043 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
INO80E-212ENST00000568043 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
INO80E-212ENST00000568043 E9PCH4 1651 aa28.37■■■□□ 2.13
INO80E-212ENST00000568043 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa28.36■■■□□ 2.13
INO80E-212ENST00000568043 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
INO80E-212ENST00000568043 UNC13BO14795 1591 aa28.35■■■□□ 2.13
INO80E-212ENST00000568043 HDGFP51858 240 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
INO80E-212ENST00000568043 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
INO80E-212ENST00000568043 CHGAP10645 457 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
INO80E-212ENST00000568043 SHPRHQ149N8 1683 aa28.31■■■□□ 2.12
INO80E-212ENST00000568043 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa28.3■■■□□ 2.12
INO80E-212ENST00000568043 C14orf37Q86TY3 774 aa28.29■■■□□ 2.12
INO80E-212ENST00000568043 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP28.29■■■□□ 2.12
INO80E-212ENST00000568043 C19orf44Q9H6X5 657 aa28.29■■■□□ 2.12
INO80E-212ENST00000568043 DIP2AQ14689 1571 aa28.28■■■□□ 2.12
INO80E-212ENST00000568043 PTPRUQ92729 1446 aa28.27■■■□□ 2.12
INO80E-212ENST00000568043 CADPS2Q86UW7 1296 aa28.27■■■□□ 2.12
INO80E-212ENST00000568043 PIK3R4Q99570 1358 aa28.26■■■□□ 2.12
INO80E-212ENST00000568043 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.25■■■□□ 2.11
INO80E-212ENST00000568043 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP28.24■■■□□ 2.11
INO80E-212ENST00000568043 ATF3P18847 181 aa28.23■■■□□ 2.11
INO80E-212ENST00000568043 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
INO80E-212ENST00000568043 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
INO80E-212ENST00000568043 BRINP3Q76B58 766 aa28.22■■■□□ 2.11
INO80E-212ENST00000568043 TRIM52Q96A61 297 aa28.22■■■□□ 2.11
INO80E-212ENST00000568043 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa28.22■■■□□ 2.11
INO80E-212ENST00000568043 TRPM2O94759 1503 aa28.21■■■□□ 2.11
INO80E-212ENST00000568043 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa28.21■■■□□ 2.11
INO80E-212ENST00000568043 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
INO80E-212ENST00000568043 ROCK1Q13464 1354 aa28.14■■■□□ 2.1
INO80E-212ENST00000568043 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa28.13■■■□□ 2.09
INO80E-212ENST00000568043 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
INO80E-212ENST00000568043 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
INO80E-212ENST00000568043 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
INO80E-212ENST00000568043 NHSL1Q5SYE7 1610 aa28.13■■■□□ 2.09
INO80E-212ENST00000568043 DCCP43146 1447 aa28.12■■■□□ 2.09
INO80E-212ENST00000568043 NUP155O75694 1391 aa28.11■■■□□ 2.09
INO80E-212ENST00000568043 MST1RQ04912 1400 aa28.11■■■□□ 2.09
INO80E-212ENST00000568043 RXRBP28702 533 aa28.11■■■□□ 2.09
INO80E-212ENST00000568043 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa28.11■■■□□ 2.09
INO80E-212ENST00000568043 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.1■■■□□ 2.09
INO80E-212ENST00000568043 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa28.08■■■□□ 2.09
INO80E-212ENST00000568043 METP08581 1390 aa28.08■■■□□ 2.09
INO80E-212ENST00000568043 AFF2P51816 1311 aa28.07■■■□□ 2.08
INO80E-212ENST00000568043 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
INO80E-212ENST00000568043 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
INO80E-212ENST00000568043 NALCNQ8IZF0 1738 aa28.03■■■□□ 2.08
INO80E-212ENST00000568043 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
INO80E-212ENST00000568043 PNPLA6Q8IY17 1366 aa27.99■■■□□ 2.07
INO80E-212ENST00000568043 ITGAEP38570 1179 aa27.99■■■□□ 2.07
INO80E-212ENST00000568043 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa27.99■■■□□ 2.07
INO80E-212ENST00000568043 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
INO80E-212ENST00000568043 RGS12O14924 1447 aa27.97■■■□□ 2.07
INO80E-212ENST00000568043 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa27.97■■■□□ 2.07
INO80E-212ENST00000568043 CLTCL1P53675 1640 aa27.96■■■□□ 2.07
INO80E-212ENST00000568043 C8orf37Q96NL8 207 aa27.96■■■□□ 2.07
INO80E-212ENST00000568043 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
INO80E-212ENST00000568043 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
INO80E-212ENST00000568043 LAMC1P11047 1609 aa27.91■■■□□ 2.06
INO80E-212ENST00000568043 C1orf167Q5SNV9 1468 aa27.89■■■□□ 2.06
INO80E-212ENST00000568043 KIF1BO60333 1816 aa27.88■■■□□ 2.05
INO80E-212ENST00000568043 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa27.88■■■□□ 2.05
INO80E-212ENST00000568043 ADAMTS2O95450 1211 aa27.86■■■□□ 2.05
INO80E-212ENST00000568043 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
INO80E-212ENST00000568043 ORAI2Q96SN7 254 aa27.84■■■□□ 2.05
INO80E-212ENST00000568043 ROBO2Q9HCK4 1378 aa27.84■■■□□ 2.05
INO80E-212ENST00000568043 NGLY1Q96IV0 654 aa27.83■■■□□ 2.05
INO80E-212ENST00000568043 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
INO80E-212ENST00000568043 PTCH1Q13635 1447 aa27.81■■■□□ 2.04
INO80E-212ENST00000568043 USP21Q9UK80 565 aa27.76■■■□□ 2.03
INO80E-212ENST00000568043 PRAG1Q86YV5 1406 aa27.75■■■□□ 2.03
INO80E-212ENST00000568043 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
INO80E-212ENST00000568043 EP400Q96L91 3159 aa27.74■■■□□ 2.03
INO80E-212ENST00000568043 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
INO80E-212ENST00000568043 PPLO60437 1756 aa27.72■■■□□ 2.03
INO80E-212ENST00000568043 NAIPQ13075 1403 aa27.72■■■□□ 2.03
INO80E-212ENST00000568043 VGFO15240 615 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
INO80E-212ENST00000568043 ATRNO75882 1429 aa27.71■■■□□ 2.03
INO80E-212ENST00000568043 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms