RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566515.5

CCNDBP1-208, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZFYVE9O95405 1425 aa30.8■■■□□ 2.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP30.8■■■□□ 2.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 IQGAP1P46940 1657 aa30.79■■■□□ 2.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa30.79■■■□□ 2.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP30.79■■■□□ 2.52
CCNDBP1-208ENST00000566515 HDGFP51858 240 aaKnown RBP30.75■■■□□ 2.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP30.75■■■□□ 2.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP30.73■■■□□ 2.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP30.73■■■□□ 2.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 RGL3Q3MIN7 710 aa30.7■■■□□ 2.51
CCNDBP1-208ENST00000566515 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa30.69■■■□□ 2.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa30.69■■■□□ 2.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 BCANQ96GW7 911 aa30.69■■■□□ 2.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP30.67■■■□□ 2.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa30.66■■■□□ 2.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP30.65■■■□□ 2.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC26A8Q96RN1 970 aa30.64■■■□□ 2.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 PPLO60437 1756 aa30.64■■■□□ 2.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa30.62■■■□□ 2.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 IFT172Q9UG01 1749 aa30.58■■■□□ 2.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 VGFO15240 615 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 LTBP4Q8N2S1 1624 aa30.57■■■□□ 2.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa30.55■■■□□ 2.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa30.54■■■□□ 2.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 STRCP1A6NGW2 1772 aa30.53■■■□□ 2.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa30.53■■■□□ 2.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 SIN3AQ96ST3 1273 aa30.51■■■□□ 2.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 TBX22Q9Y458 520 aa30.51■■■□□ 2.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa30.5■■■□□ 2.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 DIP2AQ14689 1571 aa30.48■■■□□ 2.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 CERKQ8TCT0 537 aa30.47■■■□□ 2.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 NEUROD1Q13562 356 aa30.45■■■□□ 2.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 DCAF11Q8TEB1 546 aa30.44■■■□□ 2.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 CPS1P31327 1500 aa30.43■■■□□ 2.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 KCNA6P17658 529 aa30.43■■■□□ 2.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa30.43■■■□□ 2.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 MYOM2P54296 1465 aa30.41■■■□□ 2.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 ALKQ9UM73 1620 aa30.41■■■□□ 2.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 METP08581 1390 aa30.4■■■□□ 2.46
CCNDBP1-208ENST00000566515 NWD1Q149M9 1564 aa30.39■■■□□ 2.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 PIK3C2GO75747 1445 aa30.38■■■□□ 2.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 PIK3R4Q99570 1358 aa30.38■■■□□ 2.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 NRXN1Q9ULB1 1477 aa30.37■■■□□ 2.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 PTPRUQ92729 1446 aa30.36■■■□□ 2.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 LRRC7Q96NW7 1537 aa30.35■■■□□ 2.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa30.33■■■□□ 2.45
CCNDBP1-208ENST00000566515 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP30.31■■■□□ 2.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP30.31■■■□□ 2.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 L3MBTL2Q969R5 705 aa30.31■■■□□ 2.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 STAC3Q96MF2 364 aa30.31■■■□□ 2.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 CFAP70Q5T0N1 1121 aa30.29■■■□□ 2.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 IQSEC2Q5JU85 1478 aa30.28■■■□□ 2.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM132EQ6IEE7 984 aa30.26■■■□□ 2.44
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM94Q12767 1356 aa30.26■■■□□ 2.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 LAMC1P11047 1609 aa30.25■■■□□ 2.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa30.25■■■□□ 2.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 STK26Q9P289 416 aa30.2■■■□□ 2.43
CCNDBP1-208ENST00000566515 TONSLQ96HA7 1378 aa30.19■■■□□ 2.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 PRAG1Q86YV5 1406 aa30.18■■■□□ 2.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 CLSPNQ9HAW4 1339 aa30.17■■■□□ 2.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 ROBO2Q9HCK4 1378 aa30.16■■■□□ 2.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 UBAP1LF5GYI3 381 aa30.14■■■□□ 2.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 FBXO41Q8TF61 875 aa30.14■■■□□ 2.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 ADGRB1O14514 1584 aa30.14■■■□□ 2.42
CCNDBP1-208ENST00000566515 PTCH1Q13635 1447 aa30.13■■■□□ 2.41
CCNDBP1-208ENST00000566515 C14orf37Q86TY3 774 aa30.13■■■□□ 2.41
CCNDBP1-208ENST00000566515 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa30.12■■■□□ 2.41
CCNDBP1-208ENST00000566515 ABCC11Q96J66 1382 aa30.11■■■□□ 2.41
CCNDBP1-208ENST00000566515 KNDC1Q76NI1 1749 aa30.11■■■□□ 2.41
CCNDBP1-208ENST00000566515 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa30.1■■■□□ 2.41
CCNDBP1-208ENST00000566515 MSH6P52701 1360 aa30.09■■■□□ 2.41
CCNDBP1-208ENST00000566515 TECPR2O15040 1411 aa30.09■■■□□ 2.41
CCNDBP1-208ENST00000566515 TOM1O60784 492 aa30.07■■■□□ 2.4
CCNDBP1-208ENST00000566515 NBPF1Q3BBV0 1214 aa30.07■■■□□ 2.4
CCNDBP1-208ENST00000566515 WAPLQ7Z5K2 1190 aa30.07■■■□□ 2.4
CCNDBP1-208ENST00000566515 NBPF8Q3BBV2 869 aa30.06■■■□□ 2.4
CCNDBP1-208ENST00000566515 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
CCNDBP1-208ENST00000566515 C19orf44Q9H6X5 657 aa30.05■■■□□ 2.4
CCNDBP1-208ENST00000566515 NALCNQ8IZF0 1738 aa30.05■■■□□ 2.4
CCNDBP1-208ENST00000566515 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRAK1Q9UPV9 953 aa30.04■■■□□ 2.4
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa30.04■■■□□ 2.4
CCNDBP1-208ENST00000566515 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa30.03■■■□□ 2.4
CCNDBP1-208ENST00000566515 PIP4K2BP78356 416 aa30.02■■■□□ 2.4
CCNDBP1-208ENST00000566515 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa30■■■□□ 2.39
CCNDBP1-208ENST00000566515 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
CCNDBP1-208ENST00000566515 SIRT1Q96EB6 747 aa30■■■□□ 2.39
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM135BQ49AJ0 1406 aa29.99■■■□□ 2.39
CCNDBP1-208ENST00000566515 PRAM1Q96QH2 718 aa29.99■■■□□ 2.39
CCNDBP1-208ENST00000566515 DLC1Q96QB1 1528 aa29.99■■■□□ 2.39
CCNDBP1-208ENST00000566515 ATF3P18847 181 aa29.98■■■□□ 2.39
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