RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566059.5

SPNS1-208, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 1,615 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-208ENST00000566059 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
SPNS1-208ENST00000566059 KIF1BO60333 1816 aa26.27■■□□□ 1.8
SPNS1-208ENST00000566059 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
SPNS1-208ENST00000566059 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
SPNS1-208ENST00000566059 HDGFP51858 240 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
SPNS1-208ENST00000566059 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
SPNS1-208ENST00000566059 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP26.24■■□□□ 1.79
SPNS1-208ENST00000566059 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.23■■□□□ 1.79
SPNS1-208ENST00000566059 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
SPNS1-208ENST00000566059 RGL3Q3MIN7 710 aa26.21■■□□□ 1.79
SPNS1-208ENST00000566059 IQGAP1P46940 1657 aa26.2■■□□□ 1.78
SPNS1-208ENST00000566059 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa26.19■■□□□ 1.78
SPNS1-208ENST00000566059 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa26.18■■□□□ 1.78
SPNS1-208ENST00000566059 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa26.18■■□□□ 1.78
SPNS1-208ENST00000566059 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
SPNS1-208ENST00000566059 BCANQ96GW7 911 aa26.14■■□□□ 1.77
SPNS1-208ENST00000566059 SLC26A8Q96RN1 970 aa26.14■■□□□ 1.77
SPNS1-208ENST00000566059 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
SPNS1-208ENST00000566059 VGFO15240 615 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
SPNS1-208ENST00000566059 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.1■■□□□ 1.77
SPNS1-208ENST00000566059 PPLO60437 1756 aa26.09■■□□□ 1.77
SPNS1-208ENST00000566059 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa26.07■■□□□ 1.76
SPNS1-208ENST00000566059 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa26.06■■□□□ 1.76
SPNS1-208ENST00000566059 TBX22Q9Y458 520 aa26.06■■□□□ 1.76
SPNS1-208ENST00000566059 IFT172Q9UG01 1749 aa26.04■■□□□ 1.76
SPNS1-208ENST00000566059 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa26.04■■□□□ 1.76
SPNS1-208ENST00000566059 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.03■■□□□ 1.76
SPNS1-208ENST00000566059 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa26.03■■□□□ 1.76
SPNS1-208ENST00000566059 NEUROD1Q13562 356 aa26.03■■□□□ 1.76
SPNS1-208ENST00000566059 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.01■■□□□ 1.75
SPNS1-208ENST00000566059 DIP2AQ14689 1571 aa25.99■■□□□ 1.75
SPNS1-208ENST00000566059 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.98■■□□□ 1.75
SPNS1-208ENST00000566059 MYOM2P54296 1465 aa25.98■■□□□ 1.75
SPNS1-208ENST00000566059 KCNA6P17658 529 aa25.97■■□□□ 1.75
SPNS1-208ENST00000566059 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.96■■□□□ 1.75
SPNS1-208ENST00000566059 NRXN1Q9ULB1 1477 aa25.96■■□□□ 1.75
SPNS1-208ENST00000566059 PIK3C2GO75747 1445 aa25.95■■□□□ 1.75
SPNS1-208ENST00000566059 METP08581 1390 aa25.95■■□□□ 1.75
SPNS1-208ENST00000566059 CERKQ8TCT0 537 aa25.95■■□□□ 1.74
SPNS1-208ENST00000566059 STAC3Q96MF2 364 aa25.95■■□□□ 1.74
SPNS1-208ENST00000566059 PIK3R4Q99570 1358 aa25.94■■□□□ 1.74
SPNS1-208ENST00000566059 ALKQ9UM73 1620 aa25.94■■□□□ 1.74
SPNS1-208ENST00000566059 CPS1P31327 1500 aa25.92■■□□□ 1.74
SPNS1-208ENST00000566059 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.92■■□□□ 1.74
SPNS1-208ENST00000566059 PTPRUQ92729 1446 aa25.91■■□□□ 1.74
SPNS1-208ENST00000566059 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
SPNS1-208ENST00000566059 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
SPNS1-208ENST00000566059 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
SPNS1-208ENST00000566059 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa25.89■■□□□ 1.74
SPNS1-208ENST00000566059 NWD1Q149M9 1564 aa25.89■■□□□ 1.73
SPNS1-208ENST00000566059 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.88■■□□□ 1.73
SPNS1-208ENST00000566059 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
SPNS1-208ENST00000566059 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.87■■□□□ 1.73
SPNS1-208ENST00000566059 LRRC7Q96NW7 1537 aa25.87■■□□□ 1.73
SPNS1-208ENST00000566059 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
SPNS1-208ENST00000566059 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.84■■□□□ 1.73
SPNS1-208ENST00000566059 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
SPNS1-208ENST00000566059 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
SPNS1-208ENST00000566059 TONSLQ96HA7 1378 aa25.81■■□□□ 1.72
SPNS1-208ENST00000566059 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
SPNS1-208ENST00000566059 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa25.81■■□□□ 1.72
SPNS1-208ENST00000566059 TMEM94Q12767 1356 aa25.81■■□□□ 1.72
SPNS1-208ENST00000566059 IQSEC2Q5JU85 1478 aa25.8■■□□□ 1.72
SPNS1-208ENST00000566059 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.8■■□□□ 1.72
SPNS1-208ENST00000566059 LAMC1P11047 1609 aa25.79■■□□□ 1.72
SPNS1-208ENST00000566059 STK26Q9P289 416 aa25.77■■□□□ 1.72
SPNS1-208ENST00000566059 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
SPNS1-208ENST00000566059 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
SPNS1-208ENST00000566059 ADGRB1O14514 1584 aa25.74■■□□□ 1.71
SPNS1-208ENST00000566059 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
SPNS1-208ENST00000566059 ROBO2Q9HCK4 1378 aa25.74■■□□□ 1.71
SPNS1-208ENST00000566059 ABCC11Q96J66 1382 aa25.73■■□□□ 1.71
SPNS1-208ENST00000566059 PTCH1Q13635 1447 aa25.72■■□□□ 1.71
SPNS1-208ENST00000566059 NBPF1Q3BBV0 1214 aa25.71■■□□□ 1.71
SPNS1-208ENST00000566059 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.71■■□□□ 1.71
SPNS1-208ENST00000566059 TECPR2O15040 1411 aa25.71■■□□□ 1.71
SPNS1-208ENST00000566059 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.71■■□□□ 1.71
SPNS1-208ENST00000566059 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa25.69■■□□□ 1.7
SPNS1-208ENST00000566059 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.68■■□□□ 1.7
SPNS1-208ENST00000566059 UBAP1LF5GYI3 381 aa25.66■■□□□ 1.7
SPNS1-208ENST00000566059 WAPLQ7Z5K2 1190 aa25.66■■□□□ 1.7
SPNS1-208ENST00000566059 C14orf37Q86TY3 774 aa25.66■■□□□ 1.7
SPNS1-208ENST00000566059 FBXO41Q8TF61 875 aa25.66■■□□□ 1.7
SPNS1-208ENST00000566059 SIRT1Q96EB6 747 aa25.66■■□□□ 1.7
SPNS1-208ENST00000566059 KNDC1Q76NI1 1749 aa25.65■■□□□ 1.7
SPNS1-208ENST00000566059 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.65■■□□□ 1.7
SPNS1-208ENST00000566059 MSH6P52701 1360 aa25.65■■□□□ 1.7
SPNS1-208ENST00000566059 C19orf44Q9H6X5 657 aa25.64■■□□□ 1.7
SPNS1-208ENST00000566059 TOM1O60784 492 aa25.63■■□□□ 1.69
SPNS1-208ENST00000566059 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa25.62■■□□□ 1.69
SPNS1-208ENST00000566059 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.62■■□□□ 1.69
SPNS1-208ENST00000566059 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa25.62■■□□□ 1.69
SPNS1-208ENST00000566059 DLC1Q96QB1 1528 aa25.6■■□□□ 1.69
SPNS1-208ENST00000566059 PRAM1Q96QH2 718 aa25.6■■□□□ 1.69
SPNS1-208ENST00000566059 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa25.6■■□□□ 1.69
SPNS1-208ENST00000566059 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
SPNS1-208ENST00000566059 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.68
SPNS1-208ENST00000566059 NALCNQ8IZF0 1738 aa25.56■■□□□ 1.68
SPNS1-208ENST00000566059 ATF3P18847 181 aa25.56■■□□□ 1.68
SPNS1-208ENST00000566059 POGKQ9P215 609 aa25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms