RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565849.5

E2F4-206, Transcript of E2F transcription factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene E2F4, Length 639 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4-206ENST00000565849 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP40.35■■■■■ 4.05
E2F4-206ENST00000565849 SLC26A8Q96RN1 970 aa40.35■■■■■ 4.05
E2F4-206ENST00000565849 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP40.35■■■■■ 4.05
E2F4-206ENST00000565849 CLTCL1P53675 1640 aa40.34■■■■■ 4.05
E2F4-206ENST00000565849 BCANQ96GW7 911 aa40.34■■■■■ 4.05
E2F4-206ENST00000565849 LRRC7Q96NW7 1537 aa40.32■■■■■ 4.05
E2F4-206ENST00000565849 HDGFP51858 240 aaKnown RBP40.32■■■■■ 4.05
E2F4-206ENST00000565849 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa40.31■■■■■ 4.04
E2F4-206ENST00000565849 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP40.3■■■■■ 4.04
E2F4-206ENST00000565849 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP40.29■■■■■ 4.04
E2F4-206ENST00000565849 SETD5Q9C0A6 1442 aa40.24■■■■■ 4.03
E2F4-206ENST00000565849 KIF1BO60333 1816 aa40.22■■■■■ 4.03
E2F4-206ENST00000565849 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP40.2■■■■■ 4.03
E2F4-206ENST00000565849 FOXD1Q16676 465 aa40.19■■■■■ 4.02
E2F4-206ENST00000565849 KCNA6P17658 529 aa40.18■■■■■ 4.02
E2F4-206ENST00000565849 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP40.17■■■■■ 4.02
E2F4-206ENST00000565849 NWD1Q149M9 1564 aa40.16■■■■■ 4.02
E2F4-206ENST00000565849 TOM1O60784 492 aa40.15■■■■■ 4.02
E2F4-206ENST00000565849 MPHOSPH9Q99550 1183 aa40.14■■■■■ 4.02
E2F4-206ENST00000565849 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa40.13■■■■■ 4.01
E2F4-206ENST00000565849 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP40.13■■■■■ 4.01
E2F4-206ENST00000565849 PIP4K2BP78356 416 aa40.12■■■■■ 4.01
E2F4-206ENST00000565849 ALKQ9UM73 1620 aa40.12■■■■■ 4.01
E2F4-206ENST00000565849 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP40.11■■■■■ 4.01
E2F4-206ENST00000565849 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa40.1■■■■■ 4.01
E2F4-206ENST00000565849 DIP2AQ14689 1571 aa40.1■■■■■ 4.01
E2F4-206ENST00000565849 TBX22Q9Y458 520 aa40.1■■■■■ 4.01
E2F4-206ENST00000565849 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa40.1■■■■■ 4.01
E2F4-206ENST00000565849 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP40.07■■■■■ 4.01
E2F4-206ENST00000565849 TMEM94Q12767 1356 aa40.06■■■■■ 4
E2F4-206ENST00000565849 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP40.05■■■■■ 4
E2F4-206ENST00000565849 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP40.05■■■■■ 4
E2F4-206ENST00000565849 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa40.05■■■■■ 4
E2F4-206ENST00000565849 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP40.03■■■■■ 4
E2F4-206ENST00000565849 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa40.02■■■■■ 4
E2F4-206ENST00000565849 CCDC144AA2RUR9 1427 aa39.99■■■■□ 3.99
E2F4-206ENST00000565849 PIK3R4Q99570 1358 aa39.96■■■■□ 3.99
E2F4-206ENST00000565849 PPLO60437 1756 aa39.92■■■■□ 3.98
E2F4-206ENST00000565849 PTPRUQ92729 1446 aa39.91■■■■□ 3.98
E2F4-206ENST00000565849 HSPA1LP34931 641 aa39.89■■■■□ 3.98
E2F4-206ENST00000565849 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa39.89■■■■□ 3.98
E2F4-206ENST00000565849 VGFO15240 615 aaPredicted RBP39.86■■■■□ 3.97
E2F4-206ENST00000565849 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa39.86■■■■□ 3.97
E2F4-206ENST00000565849 METP08581 1390 aa39.84■■■■□ 3.97
E2F4-206ENST00000565849 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa39.84■■■■□ 3.97
E2F4-206ENST00000565849 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP39.83■■■■□ 3.97
E2F4-206ENST00000565849 MSH6P52701 1360 aa39.83■■■■□ 3.97
E2F4-206ENST00000565849 RGL3Q3MIN7 710 aa39.82■■■■□ 3.97
E2F4-206ENST00000565849 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP39.78■■■■□ 3.96
E2F4-206ENST00000565849 HRCP23327 699 aa39.77■■■■□ 3.96
E2F4-206ENST00000565849 IFT172Q9UG01 1749 aa39.77■■■■□ 3.96
E2F4-206ENST00000565849 C14orf37Q86TY3 774 aa39.76■■■■□ 3.96
E2F4-206ENST00000565849 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa39.75■■■■□ 3.95
E2F4-206ENST00000565849 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa39.69■■■■□ 3.94
E2F4-206ENST00000565849 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP39.69■■■■□ 3.94
E2F4-206ENST00000565849 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa39.69■■■■□ 3.94
E2F4-206ENST00000565849 FAM135BQ49AJ0 1406 aa39.68■■■■□ 3.94
E2F4-206ENST00000565849 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa39.68■■■■□ 3.94
E2F4-206ENST00000565849 C19orf44Q9H6X5 657 aa39.64■■■■□ 3.94
E2F4-206ENST00000565849 DISP3Q9P2K9 1392 aa39.63■■■■□ 3.93
E2F4-206ENST00000565849 SLAIN2Q9P270 581 aa39.63■■■■□ 3.93
E2F4-206ENST00000565849 ATF3P18847 181 aa39.58■■■■□ 3.93
E2F4-206ENST00000565849 CADPS2Q86UW7 1296 aa39.57■■■■□ 3.93
E2F4-206ENST00000565849 PIK3C2GO75747 1445 aa39.56■■■■□ 3.92
E2F4-206ENST00000565849 PTCH1Q13635 1447 aa39.55■■■■□ 3.92
E2F4-206ENST00000565849 NALCNQ8IZF0 1738 aa39.54■■■■□ 3.92
E2F4-206ENST00000565849 ROBO2Q9HCK4 1378 aa39.53■■■■□ 3.92
E2F4-206ENST00000565849 DCCP43146 1447 aa39.52■■■■□ 3.92
E2F4-206ENST00000565849 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa39.51■■■■□ 3.92
E2F4-206ENST00000565849 MYOM2P54296 1465 aa39.5■■■■□ 3.91
E2F4-206ENST00000565849 PRAG1Q86YV5 1406 aa39.49■■■■□ 3.91
E2F4-206ENST00000565849 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP39.48■■■■□ 3.91
E2F4-206ENST00000565849 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa39.48■■■■□ 3.91
E2F4-206ENST00000565849 NRXN1Q9ULB1 1477 aa39.47■■■■□ 3.91
E2F4-206ENST00000565849 PHLPP1O60346 1717 aa39.45■■■■□ 3.91
E2F4-206ENST00000565849 TMEM132EQ6IEE7 984 aa39.43■■■■□ 3.9
E2F4-206ENST00000565849 STK26Q9P289 416 aa39.42■■■■□ 3.9
E2F4-206ENST00000565849 MST1RQ04912 1400 aa39.4■■■■□ 3.9
E2F4-206ENST00000565849 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP39.39■■■■□ 3.9
E2F4-206ENST00000565849 LAMC1P11047 1609 aa39.39■■■■□ 3.9
E2F4-206ENST00000565849 KNDC1Q76NI1 1749 aa39.37■■■■□ 3.89
E2F4-206ENST00000565849 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP39.37■■■■□ 3.89
E2F4-206ENST00000565849 CFAP70Q5T0N1 1121 aa39.36■■■■□ 3.89
E2F4-206ENST00000565849 TECPR2O15040 1411 aa39.36■■■■□ 3.89
E2F4-206ENST00000565849 BRINP3Q76B58 766 aa39.35■■■■□ 3.89
E2F4-206ENST00000565849 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP39.34■■■■□ 3.89
E2F4-206ENST00000565849 DCAF11Q8TEB1 546 aa39.34■■■■□ 3.89
E2F4-206ENST00000565849 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP39.33■■■■□ 3.89
E2F4-206ENST00000565849 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa39.33■■■■□ 3.89
E2F4-206ENST00000565849 ABCC11Q96J66 1382 aa39.33■■■■□ 3.89
E2F4-206ENST00000565849 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP39.32■■■■□ 3.89
E2F4-206ENST00000565849 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP39.29■■■■□ 3.88
E2F4-206ENST00000565849 WAPLQ7Z5K2 1190 aa39.28■■■■□ 3.88
E2F4-206ENST00000565849 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa39.26■■■■□ 3.88
E2F4-206ENST00000565849 ILDR2Q71H61 639 aa39.26■■■■□ 3.88
E2F4-206ENST00000565849 C1orf167Q5SNV9 1468 aa39.24■■■■□ 3.87
E2F4-206ENST00000565849 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa39.23■■■■□ 3.87
E2F4-206ENST00000565849 NHSL1Q5SYE7 1610 aa39.22■■■■□ 3.87
E2F4-206ENST00000565849 JCADQ9P266 1359 aa39.21■■■■□ 3.87
E2F4-206ENST00000565849 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP39.2■■■■□ 3.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms