RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564105.5

CTU2-204, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CTU2, Length 1,586 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-204ENST00000564105 STAG3Q9UJ98 1225 aa27.64■■■□□ 2.01
CTU2-204ENST00000564105 L3MBTL2Q969R5 705 aa27.63■■■□□ 2.01
CTU2-204ENST00000564105 A2ML1A8K2U0 1454 aa27.62■■■□□ 2.01
CTU2-204ENST00000564105 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
CTU2-204ENST00000564105 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa27.57■■■□□ 2
CTU2-204ENST00000564105 DCAF11Q8TEB1 546 aa27.56■■■□□ 2
CTU2-204ENST00000564105 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa27.53■■■□□ 2
CTU2-204ENST00000564105 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa27.52■■■□□ 2
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CTU2-204ENST00000564105 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
CTU2-204ENST00000564105 LTBP4Q8N2S1 1624 aa27.5■■□□□ 1.99
CTU2-204ENST00000564105 MYOM2P54296 1465 aa27.49■■□□□ 1.99
CTU2-204ENST00000564105 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
CTU2-204ENST00000564105 RIMS2Q9UQ26 1411 aa27.48■■□□□ 1.99
CTU2-204ENST00000564105 SLIT1O75093 1534 aa27.47■■□□□ 1.99
CTU2-204ENST00000564105 STAC3Q96MF2 364 aa27.47■■□□□ 1.99
CTU2-204ENST00000564105 TMEM2Q9UHN6 1383 aa27.46■■□□□ 1.99
CTU2-204ENST00000564105 ZFYVE9O95405 1425 aa27.46■■□□□ 1.99
CTU2-204ENST00000564105 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
CTU2-204ENST00000564105 ARHGAP23Q9P227 1491 aa27.44■■□□□ 1.98
CTU2-204ENST00000564105 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa27.44■■□□□ 1.98
CTU2-204ENST00000564105 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
CTU2-204ENST00000564105 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa27.43■■□□□ 1.98
CTU2-204ENST00000564105 PRAG1Q86YV5 1406 aa27.42■■□□□ 1.98
CTU2-204ENST00000564105 VGFO15240 615 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
CTU2-204ENST00000564105 NRXN1Q9ULB1 1477 aa27.41■■□□□ 1.98
CTU2-204ENST00000564105 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa27.4■■□□□ 1.98
CTU2-204ENST00000564105 HDGFP51858 240 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
CTU2-204ENST00000564105 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP27.4■■□□□ 1.98
CTU2-204ENST00000564105 NBPF8Q3BBV2 869 aa27.39■■□□□ 1.98
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CTU2-204ENST00000564105 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
CTU2-204ENST00000564105 PIK3C2GO75747 1445 aa27.36■■□□□ 1.97
CTU2-204ENST00000564105 EID1Q9Y6B2 187 aa27.35■■□□□ 1.97
CTU2-204ENST00000564105 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa27.35■■□□□ 1.97
CTU2-204ENST00000564105 TXNDC2Q86VQ3 553 aa27.35■■□□□ 1.97
CTU2-204ENST00000564105 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
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CTU2-204ENST00000564105 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
CTU2-204ENST00000564105 RALGAPBQ86X10 1494 aa27.32■■□□□ 1.96
CTU2-204ENST00000564105 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa27.31■■□□□ 1.96
CTU2-204ENST00000564105 IQSEC2Q5JU85 1478 aa27.3■■□□□ 1.96
CTU2-204ENST00000564105 ANKLE2Q86XL3 938 aa27.3■■□□□ 1.96
CTU2-204ENST00000564105 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
CTU2-204ENST00000564105 ALKQ9UM73 1620 aa27.29■■□□□ 1.96
CTU2-204ENST00000564105 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa27.28■■□□□ 1.96
CTU2-204ENST00000564105 CFAP70Q5T0N1 1121 aa27.26■■□□□ 1.95
CTU2-204ENST00000564105 BCANQ96GW7 911 aa27.24■■□□□ 1.95
CTU2-204ENST00000564105 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
CTU2-204ENST00000564105 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
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CTU2-204ENST00000564105 MED14O60244 1454 aa27.21■■□□□ 1.95
CTU2-204ENST00000564105 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa27.19■■□□□ 1.94
CTU2-204ENST00000564105 ADGRB1O14514 1584 aa27.19■■□□□ 1.94
CTU2-204ENST00000564105 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa27.19■■□□□ 1.94
CTU2-204ENST00000564105 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
CTU2-204ENST00000564105 GPRASP1Q5JY77 1395 aa27.18■■□□□ 1.94
CTU2-204ENST00000564105 CARD11Q9BXL7 1154 aa27.16■■□□□ 1.94
CTU2-204ENST00000564105 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
CTU2-204ENST00000564105 TMEM132EQ6IEE7 984 aa27.14■■□□□ 1.93
CTU2-204ENST00000564105 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
CTU2-204ENST00000564105 KNDC1Q76NI1 1749 aa27.13■■□□□ 1.93
CTU2-204ENST00000564105 SLC26A8Q96RN1 970 aa27.13■■□□□ 1.93
CTU2-204ENST00000564105 TBX22Q9Y458 520 aa27.1■■□□□ 1.93
CTU2-204ENST00000564105 CPS1P31327 1500 aa27.1■■□□□ 1.93
CTU2-204ENST00000564105 METP08581 1390 aa27.09■■□□□ 1.93
CTU2-204ENST00000564105 STRCP1A6NGW2 1772 aa27.09■■□□□ 1.93
CTU2-204ENST00000564105 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
CTU2-204ENST00000564105 UBAP1LF5GYI3 381 aa27.07■■□□□ 1.92
CTU2-204ENST00000564105 USP47Q96K76 1375 aa27.06■■□□□ 1.92
CTU2-204ENST00000564105 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP27.05■■□□□ 1.92
CTU2-204ENST00000564105 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
CTU2-204ENST00000564105 QRICH2Q9H0J4 1663 aa27.03■■□□□ 1.92
CTU2-204ENST00000564105 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
CTU2-204ENST00000564105 PIK3R4Q99570 1358 aa27.02■■□□□ 1.92
CTU2-204ENST00000564105 STK26Q9P289 416 aa27.02■■□□□ 1.92
CTU2-204ENST00000564105 TRAK1Q9UPV9 953 aa27.01■■□□□ 1.92
CTU2-204ENST00000564105 PTPRUQ92729 1446 aa27.01■■□□□ 1.91
CTU2-204ENST00000564105 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
CTU2-204ENST00000564105 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
CTU2-204ENST00000564105 DLC1Q96QB1 1528 aa27■■□□□ 1.91
CTU2-204ENST00000564105 ABCC11Q96J66 1382 aa26.98■■□□□ 1.91
CTU2-204ENST00000564105 NWD1Q149M9 1564 aa26.97■■□□□ 1.91
CTU2-204ENST00000564105 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
CTU2-204ENST00000564105 TECPR2O15040 1411 aa26.96■■□□□ 1.91
CTU2-204ENST00000564105 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.95■■□□□ 1.9
CTU2-204ENST00000564105 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa26.95■■□□□ 1.9
CTU2-204ENST00000564105 LRRC7Q96NW7 1537 aa26.94■■□□□ 1.9
CTU2-204ENST00000564105 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
CTU2-204ENST00000564105 PTCH1Q13635 1447 aa26.89■■□□□ 1.9
CTU2-204ENST00000564105 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.89■■□□□ 1.89
CTU2-204ENST00000564105 FAM135BQ49AJ0 1406 aa26.89■■□□□ 1.89
CTU2-204ENST00000564105 TOM1O60784 492 aa26.88■■□□□ 1.89
CTU2-204ENST00000564105 KCNA6P17658 529 aa26.88■■□□□ 1.89
CTU2-204ENST00000564105 PIP4K2BP78356 416 aa26.88■■□□□ 1.89
CTU2-204ENST00000564105 ROBO2Q9HCK4 1378 aa26.88■■□□□ 1.89
CTU2-204ENST00000564105 SIRT1Q96EB6 747 aa26.88■■□□□ 1.89
CTU2-204ENST00000564105 PRAM1Q96QH2 718 aa26.88■■□□□ 1.89
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