RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562011.1

CTU2-203, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTU2, Length 324 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-203ENST00000562011 UNC13BO14795 1591 aa22.14■■□□□ 1.13
CTU2-203ENST00000562011 ZFYVE9O95405 1425 aa22.14■■□□□ 1.13
CTU2-203ENST00000562011 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU2-203ENST00000562011 NWD1Q149M9 1564 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU2-203ENST00000562011 BCANQ96GW7 911 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU2-203ENST00000562011 E9PCH4 1651 aa22.13■■□□□ 1.13
CTU2-203ENST00000562011 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU2-203ENST00000562011 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.12■■□□□ 1.13
CTU2-203ENST00000562011 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CTU2-203ENST00000562011 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.1■■□□□ 1.13
CTU2-203ENST00000562011 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CTU2-203ENST00000562011 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CTU2-203ENST00000562011 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
CTU2-203ENST00000562011 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.08■■□□□ 1.12
CTU2-203ENST00000562011 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CTU2-203ENST00000562011 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CTU2-203ENST00000562011 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.06■■□□□ 1.12
CTU2-203ENST00000562011 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CTU2-203ENST00000562011 ITGAEP38570 1179 aa22.05■■□□□ 1.12
CTU2-203ENST00000562011 ROCK1Q13464 1354 aa22.03■■□□□ 1.12
CTU2-203ENST00000562011 MSH6P52701 1360 aa22.01■■□□□ 1.11
CTU2-203ENST00000562011 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22■■□□□ 1.11
CTU2-203ENST00000562011 NUP155O75694 1391 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-203ENST00000562011 SLAIN2Q9P270 581 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-203ENST00000562011 TBX22Q9Y458 520 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-203ENST00000562011 PHLPP1O60346 1717 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-203ENST00000562011 HDGFP51858 240 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
CTU2-203ENST00000562011 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP21.96■■□□□ 1.11
CTU2-203ENST00000562011 POTEAQ6S8J7 498 aa21.95■■□□□ 1.1
CTU2-203ENST00000562011 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
CTU2-203ENST00000562011 DIP2AQ14689 1571 aa21.92■■□□□ 1.1
CTU2-203ENST00000562011 PTPRUQ92729 1446 aa21.92■■□□□ 1.1
CTU2-203ENST00000562011 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa21.91■■□□□ 1.1
CTU2-203ENST00000562011 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
CTU2-203ENST00000562011 C14orf37Q86TY3 774 aa21.9■■□□□ 1.1
CTU2-203ENST00000562011 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa21.9■■□□□ 1.1
CTU2-203ENST00000562011 TRPM2O94759 1503 aa21.88■■□□□ 1.09
CTU2-203ENST00000562011 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa21.88■■□□□ 1.09
CTU2-203ENST00000562011 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa21.87■■□□□ 1.09
CTU2-203ENST00000562011 PIK3R4Q99570 1358 aa21.87■■□□□ 1.09
CTU2-203ENST00000562011 JCADQ9P266 1359 aa21.87■■□□□ 1.09
CTU2-203ENST00000562011 C19orf44Q9H6X5 657 aa21.85■■□□□ 1.09
CTU2-203ENST00000562011 CLTCL1P53675 1640 aa21.84■■□□□ 1.09
CTU2-203ENST00000562011 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
CTU2-203ENST00000562011 LRP6O75581 1613 aa21.83■■□□□ 1.08
CTU2-203ENST00000562011 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa21.82■■□□□ 1.08
CTU2-203ENST00000562011 ATF3P18847 181 aa21.82■■□□□ 1.08
CTU2-203ENST00000562011 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
CTU2-203ENST00000562011 CADPS2Q86UW7 1296 aa21.82■■□□□ 1.08
CTU2-203ENST00000562011 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
CTU2-203ENST00000562011 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
CTU2-203ENST00000562011 METP08581 1390 aa21.8■■□□□ 1.08
CTU2-203ENST00000562011 BRINP3Q76B58 766 aa21.78■■□□□ 1.08
CTU2-203ENST00000562011 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa21.78■■□□□ 1.08
CTU2-203ENST00000562011 NAIPQ13075 1403 aa21.78■■□□□ 1.08
CTU2-203ENST00000562011 SHPRHQ149N8 1683 aa21.77■■□□□ 1.08
CTU2-203ENST00000562011 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
CTU2-203ENST00000562011 KIF1BO60333 1816 aa21.75■■□□□ 1.07
CTU2-203ENST00000562011 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa21.74■■□□□ 1.07
CTU2-203ENST00000562011 MST1RQ04912 1400 aa21.73■■□□□ 1.07
CTU2-203ENST00000562011 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa21.73■■□□□ 1.07
CTU2-203ENST00000562011 DCCP43146 1447 aa21.72■■□□□ 1.07
CTU2-203ENST00000562011 NALCNQ8IZF0 1738 aa21.72■■□□□ 1.07
CTU2-203ENST00000562011 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
CTU2-203ENST00000562011 NHSL1Q5SYE7 1610 aa21.7■■□□□ 1.06
CTU2-203ENST00000562011 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
CTU2-203ENST00000562011 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
CTU2-203ENST00000562011 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
CTU2-203ENST00000562011 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
CTU2-203ENST00000562011 TRIM52Q96A61 297 aa21.68■■□□□ 1.06
CTU2-203ENST00000562011 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa21.68■■□□□ 1.06
CTU2-203ENST00000562011 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.64■■□□□ 1.06
CTU2-203ENST00000562011 HFM1A2PYH4 1435 aa21.63■■□□□ 1.05
CTU2-203ENST00000562011 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
CTU2-203ENST00000562011 ROBO2Q9HCK4 1378 aa21.61■■□□□ 1.05
CTU2-203ENST00000562011 PPLO60437 1756 aa21.61■■□□□ 1.05
CTU2-203ENST00000562011 FOXD1Q16676 465 aa21.61■■□□□ 1.05
CTU2-203ENST00000562011 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
CTU2-203ENST00000562011 C1orf167Q5SNV9 1468 aa21.59■■□□□ 1.05
CTU2-203ENST00000562011 VGFO15240 615 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
CTU2-203ENST00000562011 AFF2P51816 1311 aa21.58■■□□□ 1.05
CTU2-203ENST00000562011 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
CTU2-203ENST00000562011 PNPLA6Q8IY17 1366 aa21.58■■□□□ 1.04
CTU2-203ENST00000562011 PTCH1Q13635 1447 aa21.57■■□□□ 1.04
CTU2-203ENST00000562011 ORAI2Q96SN7 254 aa21.56■■□□□ 1.04
CTU2-203ENST00000562011 RXRBP28702 533 aa21.55■■□□□ 1.04
CTU2-203ENST00000562011 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP21.55■■□□□ 1.04
CTU2-203ENST00000562011 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa21.55■■□□□ 1.04
CTU2-203ENST00000562011 LAMC1P11047 1609 aa21.54■■□□□ 1.04
CTU2-203ENST00000562011 C8orf37Q96NL8 207 aa21.53■■□□□ 1.04
CTU2-203ENST00000562011 PRAG1Q86YV5 1406 aa21.51■■□□□ 1.03
CTU2-203ENST00000562011 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa21.51■■□□□ 1.03
CTU2-203ENST00000562011 ADAMTS2O95450 1211 aa21.49■■□□□ 1.03
CTU2-203ENST00000562011 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CTU2-203ENST00000562011 RGL3Q3MIN7 710 aa21.48■■□□□ 1.03
CTU2-203ENST00000562011 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CTU2-203ENST00000562011 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CTU2-203ENST00000562011 IFT172Q9UG01 1749 aa21.47■■□□□ 1.03
CTU2-203ENST00000562011 RGS12O14924 1447 aa21.46■■□□□ 1.03
CTU2-203ENST00000562011 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa21.46■■□□□ 1.03
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