RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561668.5

PKD1-223, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 3

Gene PKD1, Length 665 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-223	ENST00000561668	HRC	P23327	699 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PKD1-223	ENST00000561668	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PKD1-223	ENST00000561668	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PKD1-223	ENST00000561668	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
PKD1-223	ENST00000561668	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PKD1-223	ENST00000561668	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
PKD1-223	ENST00000561668	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PKD1-223	ENST00000561668	TOM1	O60784	492 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PKD1-223	ENST00000561668	ZFYVE9	O95405	1425 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PKD1-223	ENST00000561668	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
PKD1-223	ENST00000561668	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PKD1-223	ENST00000561668	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PKD1-223	ENST00000561668	KCNA6	P17658	529 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PKD1-223	ENST00000561668	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PKD1-223	ENST00000561668	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
PKD1-223	ENST00000561668	TRPM2	O94759	1503 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PKD1-223	ENST00000561668	TBX22	Q9Y458	520 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PKD1-223	ENST00000561668	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PKD1-223	ENST00000561668	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PKD1-223	ENST00000561668	PIP4K2B	P78356	416 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PKD1-223	ENST00000561668	FOXD1	Q16676	465 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PKD1-223	ENST00000561668	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	27.68	■■■□□ 2.02
PKD1-223	ENST00000561668	CLTCL1	P53675	1640 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PKD1-223	ENST00000561668	KIF1B	O60333	1816 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PKD1-223	ENST00000561668	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	27.62	■■■□□ 2.01
PKD1-223	ENST00000561668	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	27.6	■■■□□ 2.01
PKD1-223	ENST00000561668	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PKD1-223	ENST00000561668	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PKD1-223	ENST00000561668	TMEM94	Q12767	1356 aa		27.57	■■■□□ 2
PKD1-223	ENST00000561668	PIK3R4	Q99570	1358 aa		27.56	■■■□□ 2
PKD1-223	ENST00000561668	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		27.56	■■■□□ 2
PKD1-223	ENST00000561668	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
PKD1-223	ENST00000561668	DIP2A	Q14689	1571 aa		27.55	■■■□□ 2
PKD1-223	ENST00000561668	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
PKD1-223	ENST00000561668	RGL3	Q3MIN7	710 aa		27.53	■■■□□ 2
PKD1-223	ENST00000561668	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
PKD1-223	ENST00000561668	C14orf37	Q86TY3	774 aa		27.52	■■■□□ 2
PKD1-223	ENST00000561668	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		27.52	■■■□□ 2
PKD1-223	ENST00000561668	NWD1	Q149M9	1564 aa		27.51	■■□□□ 1.99
PKD1-223	ENST00000561668	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		27.51	■■□□□ 1.99
PKD1-223	ENST00000561668	MSH6	P52701	1360 aa		27.48	■■□□□ 1.99
PKD1-223	ENST00000561668	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		27.48	■■□□□ 1.99
PKD1-223	ENST00000561668	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	27.47	■■□□□ 1.99
PKD1-223	ENST00000561668	HSPA1L	P34931	641 aa		27.46	■■□□□ 1.99
PKD1-223	ENST00000561668	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		27.44	■■□□□ 1.98
PKD1-223	ENST00000561668	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		27.43	■■□□□ 1.98
PKD1-223	ENST00000561668	MET	P08581	1390 aa		27.41	■■□□□ 1.98
PKD1-223	ENST00000561668	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		27.41	■■□□□ 1.98
PKD1-223	ENST00000561668	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		27.4	■■□□□ 1.98
PKD1-223	ENST00000561668	ALK	Q9UM73	1620 aa		27.4	■■□□□ 1.98
PKD1-223	ENST00000561668	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		27.39	■■□□□ 1.97
PKD1-223	ENST00000561668	PTPRU	Q92729	1446 aa		27.39	■■□□□ 1.97
PKD1-223	ENST00000561668	ATF3	P18847	181 aa		27.38	■■□□□ 1.97
PKD1-223	ENST00000561668	SLAIN2	Q9P270	581 aa		27.38	■■□□□ 1.97
PKD1-223	ENST00000561668	PPL	O60437	1756 aa		27.37	■■□□□ 1.97
PKD1-223	ENST00000561668	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		27.36	■■□□□ 1.97
PKD1-223	ENST00000561668	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		27.34	■■□□□ 1.97
PKD1-223	ENST00000561668	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		27.34	■■□□□ 1.97
PKD1-223	ENST00000561668	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		27.3	■■□□□ 1.96
PKD1-223	ENST00000561668	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	27.28	■■□□□ 1.96
PKD1-223	ENST00000561668	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	27.24	■■□□□ 1.95
PKD1-223	ENST00000561668	IFT172	Q9UG01	1749 aa		27.23	■■□□□ 1.95
PKD1-223	ENST00000561668	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		27.23	■■□□□ 1.95
PKD1-223	ENST00000561668	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	27.22	■■□□□ 1.95
PKD1-223	ENST00000561668	STK26	Q9P289	416 aa		27.22	■■□□□ 1.95
PKD1-223	ENST00000561668	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		27.21	■■□□□ 1.95
PKD1-223	ENST00000561668	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		27.21	■■□□□ 1.95
PKD1-223	ENST00000561668	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	27.2	■■□□□ 1.94
PKD1-223	ENST00000561668	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		27.2	■■□□□ 1.94
PKD1-223	ENST00000561668	STAC3	Q96MF2	364 aa		27.2	■■□□□ 1.94
PKD1-223	ENST00000561668	PIK3C2G	O75747	1445 aa		27.19	■■□□□ 1.94
PKD1-223	ENST00000561668	DCC	P43146	1447 aa		27.19	■■□□□ 1.94
PKD1-223	ENST00000561668	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	27.19	■■□□□ 1.94
PKD1-223	ENST00000561668	PTCH1	Q13635	1447 aa		27.18	■■□□□ 1.94
PKD1-223	ENST00000561668	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		27.18	■■□□□ 1.94
PKD1-223	ENST00000561668	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		27.16	■■□□□ 1.94
PKD1-223	ENST00000561668	MYOM2	P54296	1465 aa		27.15	■■□□□ 1.94
PKD1-223	ENST00000561668	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		27.15	■■□□□ 1.94
PKD1-223	ENST00000561668	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		27.14	■■□□□ 1.94
PKD1-223	ENST00000561668	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	27.13	■■□□□ 1.93
PKD1-223	ENST00000561668	ABCC11	Q96J66	1382 aa		27.11	■■□□□ 1.93
PKD1-223	ENST00000561668	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		27.11	■■□□□ 1.93
PKD1-223	ENST00000561668	BRINP3	Q76B58	766 aa		27.11	■■□□□ 1.93
PKD1-223	ENST00000561668	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		27.11	■■□□□ 1.93
PKD1-223	ENST00000561668	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		27.1	■■□□□ 1.93
PKD1-223	ENST00000561668	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	27.09	■■□□□ 1.93
PKD1-223	ENST00000561668	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	27.08	■■□□□ 1.93
PKD1-223	ENST00000561668	MST1R	Q04912	1400 aa		27.07	■■□□□ 1.92
PKD1-223	ENST00000561668	PHLPP1	O60346	1717 aa		27.07	■■□□□ 1.92
PKD1-223	ENST00000561668	SIRT1	Q96EB6	747 aa		27.07	■■□□□ 1.92
PKD1-223	ENST00000561668	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		27.07	■■□□□ 1.92
PKD1-223	ENST00000561668	LAMC1	P11047	1609 aa		27.06	■■□□□ 1.92
PKD1-223	ENST00000561668	TECPR2	O15040	1411 aa		27.06	■■□□□ 1.92
PKD1-223	ENST00000561668	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	27.05	■■□□□ 1.92
PKD1-223	ENST00000561668	JCAD	Q9P266	1359 aa		27.03	■■□□□ 1.92
PKD1-223	ENST00000561668	POGK	Q9P215	609 aa		27.02	■■□□□ 1.92
PKD1-223	ENST00000561668	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		27	■■□□□ 1.91
PKD1-223	ENST00000561668	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		27	■■□□□ 1.91
PKD1-223	ENST00000561668	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		27	■■□□□ 1.91
PKD1-223	ENST00000561668	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		26.99	■■□□□ 1.91

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