RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561191.1

USP3-AS1-209, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene USP3-AS1, Length 572 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-209ENST00000561191 EID1Q9Y6B2 187 aa27.51■■□□□ 1.99
USP3-AS1-209ENST00000561191 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa27.49■■□□□ 1.99
USP3-AS1-209ENST00000561191 CCDC144AA2RUR9 1427 aa27.49■■□□□ 1.99
USP3-AS1-209ENST00000561191 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
USP3-AS1-209ENST00000561191 STRCP1A6NGW2 1772 aa27.46■■□□□ 1.99
USP3-AS1-209ENST00000561191 PPLO60437 1756 aa27.44■■□□□ 1.98
USP3-AS1-209ENST00000561191 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa27.43■■□□□ 1.98
USP3-AS1-209ENST00000561191 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa27.42■■□□□ 1.98
USP3-AS1-209ENST00000561191 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa27.41■■□□□ 1.98
USP3-AS1-209ENST00000561191 IFT172Q9UG01 1749 aa27.41■■□□□ 1.98
USP3-AS1-209ENST00000561191 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa27.4■■□□□ 1.98
USP3-AS1-209ENST00000561191 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
USP3-AS1-209ENST00000561191 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
USP3-AS1-209ENST00000561191 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
USP3-AS1-209ENST00000561191 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP27.38■■□□□ 1.97
USP3-AS1-209ENST00000561191 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa27.37■■□□□ 1.97
USP3-AS1-209ENST00000561191 DIP2AQ14689 1571 aa27.36■■□□□ 1.97
USP3-AS1-209ENST00000561191 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
USP3-AS1-209ENST00000561191 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa27.35■■□□□ 1.97
USP3-AS1-209ENST00000561191 HDGFP51858 240 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
USP3-AS1-209ENST00000561191 CPS1P31327 1500 aa27.35■■□□□ 1.97
USP3-AS1-209ENST00000561191 CERKQ8TCT0 537 aa27.33■■□□□ 1.97
USP3-AS1-209ENST00000561191 SLC26A8Q96RN1 970 aa27.33■■□□□ 1.97
USP3-AS1-209ENST00000561191 NWD1Q149M9 1564 aa27.33■■□□□ 1.97
USP3-AS1-209ENST00000561191 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
USP3-AS1-209ENST00000561191 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
USP3-AS1-209ENST00000561191 IQSEC2Q5JU85 1478 aa27.28■■□□□ 1.96
USP3-AS1-209ENST00000561191 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa27.28■■□□□ 1.96
USP3-AS1-209ENST00000561191 BCANQ96GW7 911 aa27.28■■□□□ 1.96
USP3-AS1-209ENST00000561191 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
USP3-AS1-209ENST00000561191 RGL3Q3MIN7 710 aa27.25■■□□□ 1.95
USP3-AS1-209ENST00000561191 LRRC7Q96NW7 1537 aa27.25■■□□□ 1.95
USP3-AS1-209ENST00000561191 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
USP3-AS1-209ENST00000561191 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
USP3-AS1-209ENST00000561191 TBX22Q9Y458 520 aa27.22■■□□□ 1.95
USP3-AS1-209ENST00000561191 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
USP3-AS1-209ENST00000561191 ALKQ9UM73 1620 aa27.2■■□□□ 1.95
USP3-AS1-209ENST00000561191 VGFO15240 615 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
USP3-AS1-209ENST00000561191 MYOM2P54296 1465 aa27.19■■□□□ 1.94
USP3-AS1-209ENST00000561191 PIK3R4Q99570 1358 aa27.18■■□□□ 1.94
USP3-AS1-209ENST00000561191 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa27.17■■□□□ 1.94
USP3-AS1-209ENST00000561191 PTPRUQ92729 1446 aa27.17■■□□□ 1.94
USP3-AS1-209ENST00000561191 KCNA6P17658 529 aa27.17■■□□□ 1.94
USP3-AS1-209ENST00000561191 NRXN1Q9ULB1 1477 aa27.17■■□□□ 1.94
USP3-AS1-209ENST00000561191 PIK3C2GO75747 1445 aa27.16■■□□□ 1.94
USP3-AS1-209ENST00000561191 METP08581 1390 aa27.16■■□□□ 1.94
USP3-AS1-209ENST00000561191 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.13■■□□□ 1.93
USP3-AS1-209ENST00000561191 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa27.11■■□□□ 1.93
USP3-AS1-209ENST00000561191 FBXO41Q8TF61 875 aa27.11■■□□□ 1.93
USP3-AS1-209ENST00000561191 LAMC1P11047 1609 aa27.1■■□□□ 1.93
USP3-AS1-209ENST00000561191 TMEM94Q12767 1356 aa27.09■■□□□ 1.93
USP3-AS1-209ENST00000561191 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
USP3-AS1-209ENST00000561191 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
USP3-AS1-209ENST00000561191 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
USP3-AS1-209ENST00000561191 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa27.04■■□□□ 1.92
USP3-AS1-209ENST00000561191 PRAG1Q86YV5 1406 aa27.04■■□□□ 1.92
USP3-AS1-209ENST00000561191 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.03■■□□□ 1.92
USP3-AS1-209ENST00000561191 KNDC1Q76NI1 1749 aa27.02■■□□□ 1.92
USP3-AS1-209ENST00000561191 DCAF11Q8TEB1 546 aa27.01■■□□□ 1.91
USP3-AS1-209ENST00000561191 PTCH1Q13635 1447 aa26.99■■□□□ 1.91
USP3-AS1-209ENST00000561191 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.99■■□□□ 1.91
USP3-AS1-209ENST00000561191 NALCNQ8IZF0 1738 aa26.99■■□□□ 1.91
USP3-AS1-209ENST00000561191 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.97■■□□□ 1.91
USP3-AS1-209ENST00000561191 ADGRB1O14514 1584 aa26.97■■□□□ 1.91
USP3-AS1-209ENST00000561191 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
USP3-AS1-209ENST00000561191 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
USP3-AS1-209ENST00000561191 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa26.96■■□□□ 1.91
USP3-AS1-209ENST00000561191 ROBO2Q9HCK4 1378 aa26.96■■□□□ 1.91
USP3-AS1-209ENST00000561191 CFAP70Q5T0N1 1121 aa26.95■■□□□ 1.9
USP3-AS1-209ENST00000561191 TECPR2O15040 1411 aa26.94■■□□□ 1.9
USP3-AS1-209ENST00000561191 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa26.93■■□□□ 1.9
USP3-AS1-209ENST00000561191 NEUROD1Q13562 356 aa26.93■■□□□ 1.9
USP3-AS1-209ENST00000561191 TMEM132EQ6IEE7 984 aa26.93■■□□□ 1.9
USP3-AS1-209ENST00000561191 STAC3Q96MF2 364 aa26.93■■□□□ 1.9
USP3-AS1-209ENST00000561191 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
USP3-AS1-209ENST00000561191 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
USP3-AS1-209ENST00000561191 MSH6P52701 1360 aa26.92■■□□□ 1.9
USP3-AS1-209ENST00000561191 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.9■■□□□ 1.9
USP3-AS1-209ENST00000561191 TOM1O60784 492 aa26.89■■□□□ 1.9
USP3-AS1-209ENST00000561191 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa26.89■■□□□ 1.89
USP3-AS1-209ENST00000561191 ABCC11Q96J66 1382 aa26.87■■□□□ 1.89
USP3-AS1-209ENST00000561191 STK26Q9P289 416 aa26.86■■□□□ 1.89
USP3-AS1-209ENST00000561191 DCCP43146 1447 aa26.85■■□□□ 1.89
USP3-AS1-209ENST00000561191 C14orf37Q86TY3 774 aa26.85■■□□□ 1.89
USP3-AS1-209ENST00000561191 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa26.84■■□□□ 1.89
USP3-AS1-209ENST00000561191 PIP4K2BP78356 416 aa26.84■■□□□ 1.89
USP3-AS1-209ENST00000561191 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa26.83■■□□□ 1.89
USP3-AS1-209ENST00000561191 DLC1Q96QB1 1528 aa26.83■■□□□ 1.89
USP3-AS1-209ENST00000561191 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
USP3-AS1-209ENST00000561191 C19orf44Q9H6X5 657 aa26.82■■□□□ 1.88
USP3-AS1-209ENST00000561191 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa26.82■■□□□ 1.88
USP3-AS1-209ENST00000561191 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
USP3-AS1-209ENST00000561191 FAM135BQ49AJ0 1406 aa26.8■■□□□ 1.88
USP3-AS1-209ENST00000561191 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa26.8■■□□□ 1.88
USP3-AS1-209ENST00000561191 TONSLQ96HA7 1378 aa26.78■■□□□ 1.88
USP3-AS1-209ENST00000561191 WAPLQ7Z5K2 1190 aa26.77■■□□□ 1.88
USP3-AS1-209ENST00000561191 MST1RQ04912 1400 aa26.75■■□□□ 1.87
USP3-AS1-209ENST00000561191 CADPS2Q86UW7 1296 aa26.75■■□□□ 1.87
USP3-AS1-209ENST00000561191 ATF3P18847 181 aa26.74■■□□□ 1.87
USP3-AS1-209ENST00000561191 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.2 ms