RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560622.5

USP3-AS1-207, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 508 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-207ENST00000560622 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.17■■□□□ 1.62
USP3-AS1-207ENST00000560622 KCNA6P17658 529 aa25.16■■□□□ 1.62
USP3-AS1-207ENST00000560622 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
USP3-AS1-207ENST00000560622 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.16■■□□□ 1.62
USP3-AS1-207ENST00000560622 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.16■■□□□ 1.62
USP3-AS1-207ENST00000560622 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
USP3-AS1-207ENST00000560622 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.14■■□□□ 1.62
USP3-AS1-207ENST00000560622 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
USP3-AS1-207ENST00000560622 ROCK1Q13464 1354 aa25.11■■□□□ 1.61
USP3-AS1-207ENST00000560622 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.1■■□□□ 1.61
USP3-AS1-207ENST00000560622 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.1■■□□□ 1.61
USP3-AS1-207ENST00000560622 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
USP3-AS1-207ENST00000560622 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa25.05■■□□□ 1.6
USP3-AS1-207ENST00000560622 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
USP3-AS1-207ENST00000560622 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa25.02■■□□□ 1.6
USP3-AS1-207ENST00000560622 PHLPP1O60346 1717 aa25.01■■□□□ 1.59
USP3-AS1-207ENST00000560622 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.01■■□□□ 1.59
USP3-AS1-207ENST00000560622 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
USP3-AS1-207ENST00000560622 DIP2AQ14689 1571 aa25■■□□□ 1.59
USP3-AS1-207ENST00000560622 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
USP3-AS1-207ENST00000560622 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
USP3-AS1-207ENST00000560622 TBX22Q9Y458 520 aa24.96■■□□□ 1.59
USP3-AS1-207ENST00000560622 PTPRUQ92729 1446 aa24.95■■□□□ 1.58
USP3-AS1-207ENST00000560622 MSH6P52701 1360 aa24.94■■□□□ 1.58
USP3-AS1-207ENST00000560622 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
USP3-AS1-207ENST00000560622 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
USP3-AS1-207ENST00000560622 NUP155O75694 1391 aa24.93■■□□□ 1.58
USP3-AS1-207ENST00000560622 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa24.92■■□□□ 1.58
USP3-AS1-207ENST00000560622 BCANQ96GW7 911 aa24.91■■□□□ 1.58
USP3-AS1-207ENST00000560622 SLAIN2Q9P270 581 aa24.91■■□□□ 1.58
USP3-AS1-207ENST00000560622 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa24.9■■□□□ 1.58
USP3-AS1-207ENST00000560622 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
USP3-AS1-207ENST00000560622 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
USP3-AS1-207ENST00000560622 TRPM2O94759 1503 aa24.9■■□□□ 1.58
USP3-AS1-207ENST00000560622 CLTCL1P53675 1640 aa24.9■■□□□ 1.58
USP3-AS1-207ENST00000560622 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.89■■□□□ 1.58
USP3-AS1-207ENST00000560622 PIK3R4Q99570 1358 aa24.89■■□□□ 1.57
USP3-AS1-207ENST00000560622 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
USP3-AS1-207ENST00000560622 POTEAQ6S8J7 498 aa24.88■■□□□ 1.57
USP3-AS1-207ENST00000560622 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
USP3-AS1-207ENST00000560622 ITGAEP38570 1179 aa24.87■■□□□ 1.57
USP3-AS1-207ENST00000560622 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
USP3-AS1-207ENST00000560622 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa24.84■■□□□ 1.57
USP3-AS1-207ENST00000560622 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
USP3-AS1-207ENST00000560622 SHPRHQ149N8 1683 aa24.84■■□□□ 1.57
USP3-AS1-207ENST00000560622 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
USP3-AS1-207ENST00000560622 LRP6O75581 1613 aa24.83■■□□□ 1.57
USP3-AS1-207ENST00000560622 KIF1BO60333 1816 aa24.82■■□□□ 1.56
USP3-AS1-207ENST00000560622 JCADQ9P266 1359 aa24.8■■□□□ 1.56
USP3-AS1-207ENST00000560622 NAIPQ13075 1403 aa24.79■■□□□ 1.56
USP3-AS1-207ENST00000560622 NALCNQ8IZF0 1738 aa24.78■■□□□ 1.56
USP3-AS1-207ENST00000560622 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa24.78■■□□□ 1.56
USP3-AS1-207ENST00000560622 NHSL1Q5SYE7 1610 aa24.78■■□□□ 1.56
USP3-AS1-207ENST00000560622 C19orf44Q9H6X5 657 aa24.77■■□□□ 1.56
USP3-AS1-207ENST00000560622 METP08581 1390 aa24.77■■□□□ 1.56
USP3-AS1-207ENST00000560622 DCCP43146 1447 aa24.74■■□□□ 1.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 MST1RQ04912 1400 aa24.72■■□□□ 1.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 CADPS2Q86UW7 1296 aa24.72■■□□□ 1.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.71■■□□□ 1.55
USP3-AS1-207ENST00000560622 BRINP3Q76B58 766 aa24.7■■□□□ 1.54
USP3-AS1-207ENST00000560622 PPLO60437 1756 aa24.7■■□□□ 1.54
USP3-AS1-207ENST00000560622 C14orf37Q86TY3 774 aa24.69■■□□□ 1.54
USP3-AS1-207ENST00000560622 ATF3P18847 181 aa24.67■■□□□ 1.54
USP3-AS1-207ENST00000560622 HFM1A2PYH4 1435 aa24.66■■□□□ 1.54
USP3-AS1-207ENST00000560622 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa24.66■■□□□ 1.54
USP3-AS1-207ENST00000560622 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa24.65■■□□□ 1.54
USP3-AS1-207ENST00000560622 LAMC1P11047 1609 aa24.65■■□□□ 1.54
USP3-AS1-207ENST00000560622 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
USP3-AS1-207ENST00000560622 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.62■■□□□ 1.53
USP3-AS1-207ENST00000560622 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.61■■□□□ 1.53
USP3-AS1-207ENST00000560622 IFT172Q9UG01 1749 aa24.58■■□□□ 1.53
USP3-AS1-207ENST00000560622 PTCH1Q13635 1447 aa24.58■■□□□ 1.53
USP3-AS1-207ENST00000560622 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.56■■□□□ 1.52
USP3-AS1-207ENST00000560622 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
USP3-AS1-207ENST00000560622 C1orf167Q5SNV9 1468 aa24.54■■□□□ 1.52
USP3-AS1-207ENST00000560622 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.52■■□□□ 1.52
USP3-AS1-207ENST00000560622 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
USP3-AS1-207ENST00000560622 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
USP3-AS1-207ENST00000560622 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.46■■□□□ 1.51
USP3-AS1-207ENST00000560622 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa24.46■■□□□ 1.51
USP3-AS1-207ENST00000560622 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
USP3-AS1-207ENST00000560622 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
USP3-AS1-207ENST00000560622 VGFO15240 615 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
USP3-AS1-207ENST00000560622 FOXD1Q16676 465 aa24.46■■□□□ 1.51
USP3-AS1-207ENST00000560622 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
USP3-AS1-207ENST00000560622 TRIM52Q96A61 297 aa24.46■■□□□ 1.51
USP3-AS1-207ENST00000560622 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
USP3-AS1-207ENST00000560622 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.51
USP3-AS1-207ENST00000560622 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
USP3-AS1-207ENST00000560622 KNDC1Q76NI1 1749 aa24.44■■□□□ 1.5
USP3-AS1-207ENST00000560622 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
USP3-AS1-207ENST00000560622 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.44■■□□□ 1.5
USP3-AS1-207ENST00000560622 AFF2P51816 1311 aa24.43■■□□□ 1.5
USP3-AS1-207ENST00000560622 ORAI2Q96SN7 254 aa24.43■■□□□ 1.5
USP3-AS1-207ENST00000560622 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
USP3-AS1-207ENST00000560622 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP24.41■■□□□ 1.5
USP3-AS1-207ENST00000560622 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa24.4■■□□□ 1.5
USP3-AS1-207ENST00000560622 EP400Q96L91 3159 aa24.4■■□□□ 1.5
USP3-AS1-207ENST00000560622 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
USP3-AS1-207ENST00000560622 TECPR2O15040 1411 aa24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11 ms