RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560547.1

C15orf61-204, Transcript of chromosome 15 open reading frame 61, humanhuman

TSL 2

Gene C15orf61, Length 461 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf61-204ENST00000560547 STRCP1A6NGW2 1772 aa33.06■■■□□ 2.88
C15orf61-204ENST00000560547 KIF1BO60333 1816 aa33.05■■■□□ 2.88
C15orf61-204ENST00000560547 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP33.04■■■□□ 2.88
C15orf61-204ENST00000560547 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa33.04■■■□□ 2.88
C15orf61-204ENST00000560547 HDGFP51858 240 aaKnown RBP33■■■□□ 2.87
C15orf61-204ENST00000560547 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa32.99■■■□□ 2.87
C15orf61-204ENST00000560547 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP32.98■■■□□ 2.87
C15orf61-204ENST00000560547 MPHOSPH9Q99550 1183 aa32.98■■■□□ 2.87
C15orf61-204ENST00000560547 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP32.97■■■□□ 2.87
C15orf61-204ENST00000560547 FOXD1Q16676 465 aa32.94■■■□□ 2.86
C15orf61-204ENST00000560547 BCANQ96GW7 911 aa32.91■■■□□ 2.86
C15orf61-204ENST00000560547 SLC26A8Q96RN1 970 aa32.91■■■□□ 2.86
C15orf61-204ENST00000560547 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP32.9■■■□□ 2.86
C15orf61-204ENST00000560547 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa32.89■■■□□ 2.86
C15orf61-204ENST00000560547 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP32.89■■■□□ 2.86
C15orf61-204ENST00000560547 LRRC7Q96NW7 1537 aa32.88■■■□□ 2.85
C15orf61-204ENST00000560547 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP32.88■■■□□ 2.85
C15orf61-204ENST00000560547 DIP2AQ14689 1571 aa32.87■■■□□ 2.85
C15orf61-204ENST00000560547 NWD1Q149M9 1564 aa32.87■■■□□ 2.85
C15orf61-204ENST00000560547 CCDC144AA2RUR9 1427 aa32.85■■■□□ 2.85
C15orf61-204ENST00000560547 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa32.85■■■□□ 2.85
C15orf61-204ENST00000560547 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP32.83■■■□□ 2.85
C15orf61-204ENST00000560547 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa32.83■■■□□ 2.85
C15orf61-204ENST00000560547 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa32.82■■■□□ 2.84
C15orf61-204ENST00000560547 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP32.81■■■□□ 2.84
C15orf61-204ENST00000560547 HRCP23327 699 aa32.81■■■□□ 2.84
C15orf61-204ENST00000560547 KCNA6P17658 529 aa32.8■■■□□ 2.84
C15orf61-204ENST00000560547 PPLO60437 1756 aa32.8■■■□□ 2.84
C15orf61-204ENST00000560547 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP32.8■■■□□ 2.84
C15orf61-204ENST00000560547 TBX22Q9Y458 520 aa32.79■■■□□ 2.84
C15orf61-204ENST00000560547 UBAP1LF5GYI3 381 aa32.78■■■□□ 2.84
C15orf61-204ENST00000560547 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa32.73■■■□□ 2.83
C15orf61-204ENST00000560547 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa32.73■■■□□ 2.83
C15orf61-204ENST00000560547 PIK3R4Q99570 1358 aa32.72■■■□□ 2.83
C15orf61-204ENST00000560547 IFT172Q9UG01 1749 aa32.71■■■□□ 2.83
C15orf61-204ENST00000560547 ALKQ9UM73 1620 aa32.69■■■□□ 2.82
C15orf61-204ENST00000560547 TOM1O60784 492 aa32.68■■■□□ 2.82
C15orf61-204ENST00000560547 TMEM94Q12767 1356 aa32.68■■■□□ 2.82
C15orf61-204ENST00000560547 VGFO15240 615 aaPredicted RBP32.67■■■□□ 2.82
C15orf61-204ENST00000560547 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP32.66■■■□□ 2.82
C15orf61-204ENST00000560547 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP32.65■■■□□ 2.82
C15orf61-204ENST00000560547 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP32.65■■■□□ 2.82
C15orf61-204ENST00000560547 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa32.63■■■□□ 2.81
C15orf61-204ENST00000560547 PTPRUQ92729 1446 aa32.62■■■□□ 2.81
C15orf61-204ENST00000560547 RGL3Q3MIN7 710 aa32.62■■■□□ 2.81
C15orf61-204ENST00000560547 METP08581 1390 aa32.59■■■□□ 2.81
C15orf61-204ENST00000560547 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP32.58■■■□□ 2.81
C15orf61-204ENST00000560547 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP32.57■■■□□ 2.8
C15orf61-204ENST00000560547 PIP4K2BP78356 416 aa32.57■■■□□ 2.8
C15orf61-204ENST00000560547 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa32.56■■■□□ 2.8
C15orf61-204ENST00000560547 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa32.52■■■□□ 2.8
C15orf61-204ENST00000560547 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa32.52■■■□□ 2.8
C15orf61-204ENST00000560547 MSH6P52701 1360 aa32.51■■■□□ 2.79
C15orf61-204ENST00000560547 MYOM2P54296 1465 aa32.48■■■□□ 2.79
C15orf61-204ENST00000560547 PIK3C2GO75747 1445 aa32.48■■■□□ 2.79
C15orf61-204ENST00000560547 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP32.46■■■□□ 2.79
C15orf61-204ENST00000560547 NRXN1Q9ULB1 1477 aa32.44■■■□□ 2.78
C15orf61-204ENST00000560547 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP32.43■■■□□ 2.78
C15orf61-204ENST00000560547 C14orf37Q86TY3 774 aa32.43■■■□□ 2.78
C15orf61-204ENST00000560547 PTCH1Q13635 1447 aa32.42■■■□□ 2.78
C15orf61-204ENST00000560547 PRAG1Q86YV5 1406 aa32.42■■■□□ 2.78
C15orf61-204ENST00000560547 LAMC1P11047 1609 aa32.4■■■□□ 2.78
C15orf61-204ENST00000560547 HSPA1LP34931 641 aa32.39■■■□□ 2.78
C15orf61-204ENST00000560547 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa32.39■■■□□ 2.78
C15orf61-204ENST00000560547 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa32.39■■■□□ 2.78
C15orf61-204ENST00000560547 NALCNQ8IZF0 1738 aa32.38■■■□□ 2.77
C15orf61-204ENST00000560547 FAM135BQ49AJ0 1406 aa32.36■■■□□ 2.77
C15orf61-204ENST00000560547 C19orf44Q9H6X5 657 aa32.36■■■□□ 2.77
C15orf61-204ENST00000560547 DCCP43146 1447 aa32.34■■■□□ 2.77
C15orf61-204ENST00000560547 KNDC1Q76NI1 1749 aa32.34■■■□□ 2.77
C15orf61-204ENST00000560547 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa32.34■■■□□ 2.77
C15orf61-204ENST00000560547 ROBO2Q9HCK4 1378 aa32.33■■■□□ 2.77
C15orf61-204ENST00000560547 CADPS2Q86UW7 1296 aa32.31■■■□□ 2.76
C15orf61-204ENST00000560547 ATF3P18847 181 aa32.3■■■□□ 2.76
C15orf61-204ENST00000560547 SLAIN2Q9P270 581 aa32.3■■■□□ 2.76
C15orf61-204ENST00000560547 TECPR2O15040 1411 aa32.29■■■□□ 2.76
C15orf61-204ENST00000560547 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP32.29■■■□□ 2.76
C15orf61-204ENST00000560547 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP32.29■■■□□ 2.76
C15orf61-204ENST00000560547 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP32.29■■■□□ 2.76
C15orf61-204ENST00000560547 DCAF11Q8TEB1 546 aa32.28■■■□□ 2.76
C15orf61-204ENST00000560547 TMEM132EQ6IEE7 984 aa32.26■■■□□ 2.75
C15orf61-204ENST00000560547 CFAP70Q5T0N1 1121 aa32.25■■■□□ 2.75
C15orf61-204ENST00000560547 STAC3Q96MF2 364 aa32.25■■■□□ 2.75
C15orf61-204ENST00000560547 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP32.25■■■□□ 2.75
C15orf61-204ENST00000560547 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa32.24■■■□□ 2.75
C15orf61-204ENST00000560547 ABCC11Q96J66 1382 aa32.23■■■□□ 2.75
C15orf61-204ENST00000560547 STK26Q9P289 416 aa32.22■■■□□ 2.75
C15orf61-204ENST00000560547 MST1RQ04912 1400 aa32.21■■■□□ 2.75
C15orf61-204ENST00000560547 ADGRB1O14514 1584 aa32.19■■■□□ 2.74
C15orf61-204ENST00000560547 PHLPP1O60346 1717 aa32.19■■■□□ 2.74
C15orf61-204ENST00000560547 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa32.15■■■□□ 2.74
C15orf61-204ENST00000560547 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP32.13■■■□□ 2.73
C15orf61-204ENST00000560547 DLC1Q96QB1 1528 aa32.12■■■□□ 2.73
C15orf61-204ENST00000560547 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa32.12■■■□□ 2.73
C15orf61-204ENST00000560547 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa32.12■■■□□ 2.73
C15orf61-204ENST00000560547 WAPLQ7Z5K2 1190 aa32.11■■■□□ 2.73
C15orf61-204ENST00000560547 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP32.11■■■□□ 2.73
C15orf61-204ENST00000560547 SIN3AQ96ST3 1273 aa32.1■■■□□ 2.73
C15orf61-204ENST00000560547 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP32.1■■■□□ 2.73
C15orf61-204ENST00000560547 BRINP3Q76B58 766 aa32.09■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms