RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560067.1

USP3-AS1-205, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene USP3-AS1, Length 366 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-205ENST00000560067 IQSEC2Q5JU85 1478 aa18.4■□□□□ 0.54
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
USP3-AS1-205ENST00000560067 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
USP3-AS1-205ENST00000560067 SLC26A8Q96RN1 970 aa18.4■□□□□ 0.54
USP3-AS1-205ENST00000560067 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa18.4■□□□□ 0.54
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZFYVE9O95405 1425 aa18.4■□□□□ 0.54
USP3-AS1-205ENST00000560067 CPS1P31327 1500 aa18.39■□□□□ 0.54
USP3-AS1-205ENST00000560067 FOXD1Q16676 465 aa18.38■□□□□ 0.53
USP3-AS1-205ENST00000560067 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa18.38■□□□□ 0.53
USP3-AS1-205ENST00000560067 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa18.37■□□□□ 0.53
USP3-AS1-205ENST00000560067 UBAP1LF5GYI3 381 aa18.36■□□□□ 0.53
USP3-AS1-205ENST00000560067 TRPM2O94759 1503 aa18.36■□□□□ 0.53
USP3-AS1-205ENST00000560067 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa18.35■□□□□ 0.53
USP3-AS1-205ENST00000560067 KCNA6P17658 529 aa18.34■□□□□ 0.53
USP3-AS1-205ENST00000560067 TBX22Q9Y458 520 aa18.33■□□□□ 0.52
USP3-AS1-205ENST00000560067 HRCP23327 699 aa18.32■□□□□ 0.52
USP3-AS1-205ENST00000560067 TOM1O60784 492 aa18.31■□□□□ 0.52
USP3-AS1-205ENST00000560067 CLTCL1P53675 1640 aa18.31■□□□□ 0.52
USP3-AS1-205ENST00000560067 LRRC7Q96NW7 1537 aa18.29■□□□□ 0.52
USP3-AS1-205ENST00000560067 MYO5BQ9ULV0 1848 aa18.29■□□□□ 0.52
USP3-AS1-205ENST00000560067 CCDC144AA2RUR9 1427 aa18.29■□□□□ 0.52
USP3-AS1-205ENST00000560067 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
USP3-AS1-205ENST00000560067 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa18.27■□□□□ 0.52
USP3-AS1-205ENST00000560067 VGFO15240 615 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
USP3-AS1-205ENST00000560067 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa18.26■□□□□ 0.51
USP3-AS1-205ENST00000560067 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
USP3-AS1-205ENST00000560067 PIP4K2BP78356 416 aa18.25■□□□□ 0.51
USP3-AS1-205ENST00000560067 RGL3Q3MIN7 710 aa18.25■□□□□ 0.51
USP3-AS1-205ENST00000560067 TMEM94Q12767 1356 aa18.24■□□□□ 0.51
USP3-AS1-205ENST00000560067 PIK3R4Q99570 1358 aa18.24■□□□□ 0.51
USP3-AS1-205ENST00000560067 STRCP1A6NGW2 1772 aa18.23■□□□□ 0.51
USP3-AS1-205ENST00000560067 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
USP3-AS1-205ENST00000560067 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa18.21■□□□□ 0.51
USP3-AS1-205ENST00000560067 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa18.21■□□□□ 0.51
USP3-AS1-205ENST00000560067 KIF1BO60333 1816 aa18.21■□□□□ 0.51
USP3-AS1-205ENST00000560067 DIP2AQ14689 1571 aa18.21■□□□□ 0.51
USP3-AS1-205ENST00000560067 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
USP3-AS1-205ENST00000560067 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa18.18■□□□□ 0.5
USP3-AS1-205ENST00000560067 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa18.18■□□□□ 0.5
USP3-AS1-205ENST00000560067 NWD1Q149M9 1564 aa18.17■□□□□ 0.5
USP3-AS1-205ENST00000560067 C14orf37Q86TY3 774 aa18.17■□□□□ 0.5
USP3-AS1-205ENST00000560067 METP08581 1390 aa18.17■□□□□ 0.5
USP3-AS1-205ENST00000560067 MSH6P52701 1360 aa18.16■□□□□ 0.5
USP3-AS1-205ENST00000560067 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa18.16■□□□□ 0.5
USP3-AS1-205ENST00000560067 PTPRUQ92729 1446 aa18.15■□□□□ 0.5
USP3-AS1-205ENST00000560067 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa18.14■□□□□ 0.49
USP3-AS1-205ENST00000560067 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa18.14■□□□□ 0.49
USP3-AS1-205ENST00000560067 HSPA1LP34931 641 aa18.12■□□□□ 0.49
USP3-AS1-205ENST00000560067 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa18.12■□□□□ 0.49
USP3-AS1-205ENST00000560067 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
USP3-AS1-205ENST00000560067 C19orf44Q9H6X5 657 aa18.11■□□□□ 0.49
USP3-AS1-205ENST00000560067 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
USP3-AS1-205ENST00000560067 ALKQ9UM73 1620 aa18.09■□□□□ 0.49
USP3-AS1-205ENST00000560067 ATF3P18847 181 aa18.08■□□□□ 0.48
USP3-AS1-205ENST00000560067 CADPS2Q86UW7 1296 aa18.08■□□□□ 0.48
USP3-AS1-205ENST00000560067 SLAIN2Q9P270 581 aa18.08■□□□□ 0.48
USP3-AS1-205ENST00000560067 PPLO60437 1756 aa18.07■□□□□ 0.48
USP3-AS1-205ENST00000560067 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
USP3-AS1-205ENST00000560067 FAM135BQ49AJ0 1406 aa18.06■□□□□ 0.48
USP3-AS1-205ENST00000560067 DCAF11Q8TEB1 546 aa18.04■□□□□ 0.48
USP3-AS1-205ENST00000560067 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
USP3-AS1-205ENST00000560067 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa18.04■□□□□ 0.48
USP3-AS1-205ENST00000560067 PIK3C2GO75747 1445 aa18.04■□□□□ 0.48
USP3-AS1-205ENST00000560067 TMEM132EQ6IEE7 984 aa18.03■□□□□ 0.48
USP3-AS1-205ENST00000560067 STAC3Q96MF2 364 aa18.03■□□□□ 0.48
USP3-AS1-205ENST00000560067 STK26Q9P289 416 aa18.03■□□□□ 0.48
USP3-AS1-205ENST00000560067 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
USP3-AS1-205ENST00000560067 ROBO2Q9HCK4 1378 aa18.02■□□□□ 0.47
USP3-AS1-205ENST00000560067 MYOM2P54296 1465 aa18.01■□□□□ 0.47
USP3-AS1-205ENST00000560067 PTCH1Q13635 1447 aa18.01■□□□□ 0.47
USP3-AS1-205ENST00000560067 CFAP70Q5T0N1 1121 aa18.01■□□□□ 0.47
USP3-AS1-205ENST00000560067 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
USP3-AS1-205ENST00000560067 NRXN1Q9ULB1 1477 aa17.99■□□□□ 0.47
USP3-AS1-205ENST00000560067 DCCP43146 1447 aa17.98■□□□□ 0.47
USP3-AS1-205ENST00000560067 IFT172Q9UG01 1749 aa17.98■□□□□ 0.47
USP3-AS1-205ENST00000560067 PRAG1Q86YV5 1406 aa17.98■□□□□ 0.47
USP3-AS1-205ENST00000560067 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa17.98■□□□□ 0.47
USP3-AS1-205ENST00000560067 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
USP3-AS1-205ENST00000560067 ABCC11Q96J66 1382 aa17.97■□□□□ 0.47
USP3-AS1-205ENST00000560067 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
USP3-AS1-205ENST00000560067 WAPLQ7Z5K2 1190 aa17.95■□□□□ 0.46
USP3-AS1-205ENST00000560067 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
USP3-AS1-205ENST00000560067 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
USP3-AS1-205ENST00000560067 DISP3Q9P2K9 1392 aa17.94■□□□□ 0.46
USP3-AS1-205ENST00000560067 POTEDQ86YR6 584 aa17.94■□□□□ 0.46
USP3-AS1-205ENST00000560067 SIRT1Q96EB6 747 aa17.94■□□□□ 0.46
USP3-AS1-205ENST00000560067 TECPR2O15040 1411 aa17.93■□□□□ 0.46
USP3-AS1-205ENST00000560067 BRINP3Q76B58 766 aa17.93■□□□□ 0.46
USP3-AS1-205ENST00000560067 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa17.93■□□□□ 0.46
USP3-AS1-205ENST00000560067 NEUROD1Q13562 356 aa17.92■□□□□ 0.46
USP3-AS1-205ENST00000560067 SIN3AQ96ST3 1273 aa17.92■□□□□ 0.46
USP3-AS1-205ENST00000560067 MST1RQ04912 1400 aa17.91■□□□□ 0.46
USP3-AS1-205ENST00000560067 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa17.91■□□□□ 0.46
USP3-AS1-205ENST00000560067 PRAM1Q96QH2 718 aa17.89■□□□□ 0.45
USP3-AS1-205ENST00000560067 POGKQ9P215 609 aa17.89■□□□□ 0.45
USP3-AS1-205ENST00000560067 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa17.89■□□□□ 0.45
USP3-AS1-205ENST00000560067 LAMC1P11047 1609 aa17.88■□□□□ 0.45
USP3-AS1-205ENST00000560067 TRAK1Q9UPV9 953 aa17.88■□□□□ 0.45
USP3-AS1-205ENST00000560067 L3MBTL2Q969R5 705 aa17.87■□□□□ 0.45
USP3-AS1-205ENST00000560067 C1orf167Q5SNV9 1468 aa17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms