RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559365.5

PSMA4-212, Transcript of proteasome subunit alpha 4, humanhuman

TSL 5

Gene PSMA4, Length 786 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4-212ENST00000559365 RIMS2Q9UQ26 1411 aa41.09■■■■■ 4.17
PSMA4-212ENST00000559365 HSPA1LP34931 641 aa41.08■■■■■ 4.17
PSMA4-212ENST00000559365 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa41.04■■■■■ 4.16
PSMA4-212ENST00000559365 CHGAP10645 457 aaKnown RBP41.03■■■■■ 4.16
PSMA4-212ENST00000559365 NAIPQ13075 1403 aa41.02■■■■■ 4.16
PSMA4-212ENST00000559365 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa41.02■■■■■ 4.16
PSMA4-212ENST00000559365 KCNA6P17658 529 aa41.02■■■■■ 4.16
PSMA4-212ENST00000559365 NWD1Q149M9 1564 aa41.01■■■■■ 4.16
PSMA4-212ENST00000559365 BCANQ96GW7 911 aa41■■■■■ 4.15
PSMA4-212ENST00000559365 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP40.99■■■■■ 4.15
PSMA4-212ENST00000559365 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP40.97■■■■■ 4.15
PSMA4-212ENST00000559365 HDGFP51858 240 aaKnown RBP40.97■■■■■ 4.15
PSMA4-212ENST00000559365 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP40.96■■■■■ 4.15
PSMA4-212ENST00000559365 TMEM94Q12767 1356 aa40.94■■■■■ 4.14
PSMA4-212ENST00000559365 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP40.92■■■■■ 4.14
PSMA4-212ENST00000559365 ILDR2Q71H61 639 aa40.92■■■■■ 4.14
PSMA4-212ENST00000559365 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP40.92■■■■■ 4.14
PSMA4-212ENST00000559365 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP40.89■■■■■ 4.14
PSMA4-212ENST00000559365 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP40.88■■■■■ 4.13
PSMA4-212ENST00000559365 HFM1A2PYH4 1435 aa40.87■■■■■ 4.13
PSMA4-212ENST00000559365 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP40.85■■■■■ 4.13
PSMA4-212ENST00000559365 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa40.84■■■■■ 4.13
PSMA4-212ENST00000559365 TBX22Q9Y458 520 aa40.83■■■■■ 4.13
PSMA4-212ENST00000559365 DIP2AQ14689 1571 aa40.82■■■■■ 4.12
PSMA4-212ENST00000559365 CLTCL1P53675 1640 aa40.82■■■■■ 4.12
PSMA4-212ENST00000559365 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP40.8■■■■■ 4.12
PSMA4-212ENST00000559365 TRPM2O94759 1503 aa40.78■■■■■ 4.12
PSMA4-212ENST00000559365 KIF1BO60333 1816 aa40.74■■■■■ 4.11
PSMA4-212ENST00000559365 TRIM52Q96A61 297 aa40.73■■■■■ 4.11
PSMA4-212ENST00000559365 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa40.72■■■■■ 4.11
PSMA4-212ENST00000559365 FAM135BQ49AJ0 1406 aa40.71■■■■■ 4.11
PSMA4-212ENST00000559365 PIK3R4Q99570 1358 aa40.69■■■■■ 4.1
PSMA4-212ENST00000559365 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa40.69■■■■■ 4.1
PSMA4-212ENST00000559365 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP40.68■■■■■ 4.1
PSMA4-212ENST00000559365 MSH6P52701 1360 aa40.68■■■■■ 4.1
PSMA4-212ENST00000559365 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa40.66■■■■■ 4.1
PSMA4-212ENST00000559365 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa40.65■■■■■ 4.1
PSMA4-212ENST00000559365 PTPRUQ92729 1446 aa40.62■■■■■ 4.09
PSMA4-212ENST00000559365 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP40.61■■■■■ 4.09
PSMA4-212ENST00000559365 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa40.59■■■■■ 4.09
PSMA4-212ENST00000559365 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP40.56■■■■■ 4.08
PSMA4-212ENST00000559365 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa40.56■■■■■ 4.08
PSMA4-212ENST00000559365 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP40.56■■■■■ 4.08
PSMA4-212ENST00000559365 SOCS7O14512 581 aa40.55■■■■■ 4.08
PSMA4-212ENST00000559365 SLAIN2Q9P270 581 aa40.53■■■■■ 4.08
PSMA4-212ENST00000559365 C14orf37Q86TY3 774 aa40.5■■■■■ 4.07
PSMA4-212ENST00000559365 METP08581 1390 aa40.48■■■■■ 4.07
PSMA4-212ENST00000559365 PHLPP1O60346 1717 aa40.45■■■■■ 4.07
PSMA4-212ENST00000559365 FOXD1Q16676 465 aa40.45■■■■■ 4.07
PSMA4-212ENST00000559365 PPLO60437 1756 aa40.45■■■■■ 4.07
PSMA4-212ENST00000559365 C19orf44Q9H6X5 657 aa40.44■■■■■ 4.06
PSMA4-212ENST00000559365 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP40.42■■■■■ 4.06
PSMA4-212ENST00000559365 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP40.42■■■■■ 4.06
PSMA4-212ENST00000559365 CADPS2Q86UW7 1296 aa40.39■■■■■ 4.06
PSMA4-212ENST00000559365 ATF3P18847 181 aa40.36■■■■■ 4.05
PSMA4-212ENST00000559365 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa40.36■■■■■ 4.05
PSMA4-212ENST00000559365 VGFO15240 615 aaPredicted RBP40.35■■■■■ 4.05
PSMA4-212ENST00000559365 MPHOSPH9Q99550 1183 aa40.35■■■■■ 4.05
PSMA4-212ENST00000559365 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP40.33■■■■■ 4.05
PSMA4-212ENST00000559365 DCCP43146 1447 aa40.32■■■■■ 4.04
PSMA4-212ENST00000559365 CCDC144AA2RUR9 1427 aa40.3■■■■■ 4.04
PSMA4-212ENST00000559365 SETD5Q9C0A6 1442 aa40.29■■■■■ 4.04
PSMA4-212ENST00000559365 NALCNQ8IZF0 1738 aa40.28■■■■■ 4.04
PSMA4-212ENST00000559365 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP40.26■■■■■ 4.04
PSMA4-212ENST00000559365 IFT172Q9UG01 1749 aa40.25■■■■■ 4.03
PSMA4-212ENST00000559365 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa40.24■■■■■ 4.03
PSMA4-212ENST00000559365 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa40.24■■■■■ 4.03
PSMA4-212ENST00000559365 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP40.22■■■■■ 4.03
PSMA4-212ENST00000559365 JCADQ9P266 1359 aa40.22■■■■■ 4.03
PSMA4-212ENST00000559365 MST1RQ04912 1400 aa40.21■■■■■ 4.03
PSMA4-212ENST00000559365 PTCH1Q13635 1447 aa40.19■■■■■ 4.02
PSMA4-212ENST00000559365 BRINP3Q76B58 766 aa40.19■■■■■ 4.02
PSMA4-212ENST00000559365 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP40.18■■■■■ 4.02
PSMA4-212ENST00000559365 RGL3Q3MIN7 710 aa40.16■■■■■ 4.02
PSMA4-212ENST00000559365 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa40.16■■■■■ 4.02
PSMA4-212ENST00000559365 PRAG1Q86YV5 1406 aa40.16■■■■■ 4.02
PSMA4-212ENST00000559365 ROBO2Q9HCK4 1378 aa40.15■■■■■ 4.02
PSMA4-212ENST00000559365 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa40.14■■■■■ 4.02
PSMA4-212ENST00000559365 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa40.14■■■■■ 4.02
PSMA4-212ENST00000559365 NHSL1Q5SYE7 1610 aa40.12■■■■■ 4.01
PSMA4-212ENST00000559365 SHPRHQ149N8 1683 aa40.11■■■■■ 4.01
PSMA4-212ENST00000559365 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa40.1■■■■■ 4.01
PSMA4-212ENST00000559365 LRP6O75581 1613 aa40.02■■■■■ 4
PSMA4-212ENST00000559365 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa40.01■■■■■ 4
PSMA4-212ENST00000559365 C1orf167Q5SNV9 1468 aa40■■■■□ 3.99
PSMA4-212ENST00000559365 PIK3C2GO75747 1445 aa39.99■■■■□ 3.99
PSMA4-212ENST00000559365 POTEAQ6S8J7 498 aa39.99■■■■□ 3.99
PSMA4-212ENST00000559365 KNDC1Q76NI1 1749 aa39.96■■■■□ 3.99
PSMA4-212ENST00000559365 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP39.94■■■■□ 3.98
PSMA4-212ENST00000559365 TECPR2O15040 1411 aa39.93■■■■□ 3.98
PSMA4-212ENST00000559365 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP39.92■■■■□ 3.98
PSMA4-212ENST00000559365 LAMC1P11047 1609 aa39.91■■■■□ 3.98
PSMA4-212ENST00000559365 TMEM132EQ6IEE7 984 aa39.9■■■■□ 3.98
PSMA4-212ENST00000559365 STK26Q9P289 416 aa39.9■■■■□ 3.98
PSMA4-212ENST00000559365 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa39.89■■■■□ 3.98
PSMA4-212ENST00000559365 NRXN1Q9ULB1 1477 aa39.89■■■■□ 3.98
PSMA4-212ENST00000559365 MYOM2P54296 1465 aa39.88■■■■□ 3.98
PSMA4-212ENST00000559365 ABCC11Q96J66 1382 aa39.86■■■■□ 3.97
PSMA4-212ENST00000559365 ORAI2Q96SN7 254 aa39.86■■■■□ 3.97
PSMA4-212ENST00000559365 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP39.85■■■■□ 3.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms