RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558754.5

MIR9-3HG-205, Transcript of MIR9-3 host gene, humanhuman

TSL 4

Gene MIR9-3HG, Length 786 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIR9-3HG-205ENST00000558754 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa36.37■■■■□ 3.41
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ZFYVE9O95405 1425 aa36.36■■■■□ 3.41
MIR9-3HG-205ENST00000558754 RIMS2Q9UQ26 1411 aa36.36■■■■□ 3.41
MIR9-3HG-205ENST00000558754 BCANQ96GW7 911 aa36.36■■■■□ 3.41
MIR9-3HG-205ENST00000558754 SLC26A8Q96RN1 970 aa36.36■■■■□ 3.41
MIR9-3HG-205ENST00000558754 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP36.32■■■■□ 3.4
MIR9-3HG-205ENST00000558754 HSPA1LP34931 641 aa36.3■■■■□ 3.4
MIR9-3HG-205ENST00000558754 NAIPQ13075 1403 aa36.3■■■■□ 3.4
MIR9-3HG-205ENST00000558754 NWD1Q149M9 1564 aa36.28■■■■□ 3.4
MIR9-3HG-205ENST00000558754 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa36.27■■■■□ 3.4
MIR9-3HG-205ENST00000558754 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP36.22■■■■□ 3.39
MIR9-3HG-205ENST00000558754 KCNA6P17658 529 aa36.21■■■■□ 3.39
MIR9-3HG-205ENST00000558754 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP36.21■■■■□ 3.39
MIR9-3HG-205ENST00000558754 TMEM94Q12767 1356 aa36.21■■■■□ 3.39
MIR9-3HG-205ENST00000558754 HDGFP51858 240 aaKnown RBP36.2■■■■□ 3.39
MIR9-3HG-205ENST00000558754 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP36.2■■■■□ 3.38
MIR9-3HG-205ENST00000558754 HFM1A2PYH4 1435 aa36.18■■■■□ 3.38
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP36.17■■■■□ 3.38
MIR9-3HG-205ENST00000558754 CLTCL1P53675 1640 aa36.16■■■■□ 3.38
MIR9-3HG-205ENST00000558754 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
MIR9-3HG-205ENST00000558754 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP36.15■■■■□ 3.38
MIR9-3HG-205ENST00000558754 DIP2AQ14689 1571 aa36.14■■■■□ 3.38
MIR9-3HG-205ENST00000558754 TRPM2O94759 1503 aa36.13■■■■□ 3.38
MIR9-3HG-205ENST00000558754 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP36.11■■■■□ 3.37
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ILDR2Q71H61 639 aa36.1■■■■□ 3.37
MIR9-3HG-205ENST00000558754 TRIM52Q96A61 297 aa36.1■■■■□ 3.37
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa36.09■■■■□ 3.37
MIR9-3HG-205ENST00000558754 KIF1BO60333 1816 aa36.08■■■■□ 3.37
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP36.04■■■■□ 3.36
MIR9-3HG-205ENST00000558754 TBX22Q9Y458 520 aa36.04■■■■□ 3.36
MIR9-3HG-205ENST00000558754 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa36.03■■■■□ 3.36
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa36.02■■■■□ 3.36
MIR9-3HG-205ENST00000558754 MSH6P52701 1360 aa36.01■■■■□ 3.35
MIR9-3HG-205ENST00000558754 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa35.98■■■■□ 3.35
MIR9-3HG-205ENST00000558754 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa35.98■■■■□ 3.35
MIR9-3HG-205ENST00000558754 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP35.96■■■■□ 3.35
MIR9-3HG-205ENST00000558754 PIK3R4Q99570 1358 aa35.94■■■■□ 3.34
MIR9-3HG-205ENST00000558754 FAM135BQ49AJ0 1406 aa35.93■■■■□ 3.34
MIR9-3HG-205ENST00000558754 C14orf37Q86TY3 774 aa35.91■■■■□ 3.34
MIR9-3HG-205ENST00000558754 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP35.91■■■■□ 3.34
MIR9-3HG-205ENST00000558754 PTPRUQ92729 1446 aa35.9■■■■□ 3.34
MIR9-3HG-205ENST00000558754 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP35.88■■■■□ 3.33
MIR9-3HG-205ENST00000558754 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa35.84■■■■□ 3.33
MIR9-3HG-205ENST00000558754 FOXD1Q16676 465 aa35.83■■■■□ 3.33
MIR9-3HG-205ENST00000558754 PHLPP1O60346 1717 aa35.83■■■■□ 3.33
MIR9-3HG-205ENST00000558754 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa35.83■■■■□ 3.33
MIR9-3HG-205ENST00000558754 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP35.81■■■■□ 3.32
MIR9-3HG-205ENST00000558754 PPLO60437 1756 aa35.81■■■■□ 3.32
MIR9-3HG-205ENST00000558754 SLAIN2Q9P270 581 aa35.8■■■■□ 3.32
MIR9-3HG-205ENST00000558754 METP08581 1390 aa35.79■■■■□ 3.32
MIR9-3HG-205ENST00000558754 SOCS7O14512 581 aa35.76■■■■□ 3.32
MIR9-3HG-205ENST00000558754 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.31
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ATF3P18847 181 aa35.72■■■■□ 3.31
MIR9-3HG-205ENST00000558754 CCDC144AA2RUR9 1427 aa35.72■■■■□ 3.31
MIR9-3HG-205ENST00000558754 C19orf44Q9H6X5 657 aa35.71■■■■□ 3.31
MIR9-3HG-205ENST00000558754 CADPS2Q86UW7 1296 aa35.7■■■■□ 3.31
MIR9-3HG-205ENST00000558754 NALCNQ8IZF0 1738 aa35.69■■■■□ 3.3
MIR9-3HG-205ENST00000558754 MPHOSPH9Q99550 1183 aa35.69■■■■□ 3.3
MIR9-3HG-205ENST00000558754 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP35.68■■■■□ 3.3
MIR9-3HG-205ENST00000558754 SETD5Q9C0A6 1442 aa35.67■■■■□ 3.3
MIR9-3HG-205ENST00000558754 VGFO15240 615 aaPredicted RBP35.67■■■■□ 3.3
MIR9-3HG-205ENST00000558754 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa35.65■■■■□ 3.3
MIR9-3HG-205ENST00000558754 IFT172Q9UG01 1749 aa35.64■■■■□ 3.3
MIR9-3HG-205ENST00000558754 DCCP43146 1447 aa35.64■■■■□ 3.3
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa35.61■■■■□ 3.29
MIR9-3HG-205ENST00000558754 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP35.61■■■■□ 3.29
MIR9-3HG-205ENST00000558754 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa35.57■■■■□ 3.29
MIR9-3HG-205ENST00000558754 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa35.57■■■■□ 3.28
MIR9-3HG-205ENST00000558754 RGL3Q3MIN7 710 aa35.57■■■■□ 3.28
MIR9-3HG-205ENST00000558754 PTCH1Q13635 1447 aa35.57■■■■□ 3.28
MIR9-3HG-205ENST00000558754 MST1RQ04912 1400 aa35.56■■■■□ 3.28
MIR9-3HG-205ENST00000558754 JCADQ9P266 1359 aa35.55■■■■□ 3.28
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa35.55■■■■□ 3.28
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ROBO2Q9HCK4 1378 aa35.52■■■■□ 3.28
MIR9-3HG-205ENST00000558754 BRINP3Q76B58 766 aa35.52■■■■□ 3.28
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa35.51■■■■□ 3.27
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
MIR9-3HG-205ENST00000558754 NHSL1Q5SYE7 1610 aa35.5■■■■□ 3.27
MIR9-3HG-205ENST00000558754 SHPRHQ149N8 1683 aa35.49■■■■□ 3.27
MIR9-3HG-205ENST00000558754 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP35.46■■■■□ 3.27
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa35.46■■■■□ 3.27
MIR9-3HG-205ENST00000558754 PRAG1Q86YV5 1406 aa35.46■■■■□ 3.27
MIR9-3HG-205ENST00000558754 LRP6O75581 1613 aa35.41■■■■□ 3.26
MIR9-3HG-205ENST00000558754 PIK3C2GO75747 1445 aa35.4■■■■□ 3.26
MIR9-3HG-205ENST00000558754 KNDC1Q76NI1 1749 aa35.38■■■■□ 3.25
MIR9-3HG-205ENST00000558754 C1orf167Q5SNV9 1468 aa35.37■■■■□ 3.25
MIR9-3HG-205ENST00000558754 STK26Q9P289 416 aa35.35■■■■□ 3.25
MIR9-3HG-205ENST00000558754 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa35.34■■■■□ 3.25
MIR9-3HG-205ENST00000558754 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP35.33■■■■□ 3.25
MIR9-3HG-205ENST00000558754 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa35.33■■■■□ 3.25
MIR9-3HG-205ENST00000558754 LAMC1P11047 1609 aa35.32■■■■□ 3.24
MIR9-3HG-205ENST00000558754 MYOM2P54296 1465 aa35.31■■■■□ 3.24
MIR9-3HG-205ENST00000558754 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP35.31■■■■□ 3.24
MIR9-3HG-205ENST00000558754 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP35.3■■■■□ 3.24
MIR9-3HG-205ENST00000558754 TMEM132EQ6IEE7 984 aa35.3■■■■□ 3.24
MIR9-3HG-205ENST00000558754 POTEAQ6S8J7 498 aa35.3■■■■□ 3.24
MIR9-3HG-205ENST00000558754 TECPR2O15040 1411 aa35.3■■■■□ 3.24
MIR9-3HG-205ENST00000558754 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP35.26■■■■□ 3.24
MIR9-3HG-205ENST00000558754 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP35.26■■■■□ 3.24
MIR9-3HG-205ENST00000558754 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP35.26■■■■□ 3.24
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