RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557779.1

TMEM229B-208, Transcript of transmembrane protein 229B, humanhuman

TSL 2

Gene TMEM229B, Length 701 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229B-208ENST00000557779 DISP3Q9P2K9 1392 aa36.66■■■■□ 3.46
TMEM229B-208ENST00000557779 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa36.66■■■■□ 3.46
TMEM229B-208ENST00000557779 CHGAP10645 457 aaKnown RBP36.65■■■■□ 3.46
TMEM229B-208ENST00000557779 KCNA6P17658 529 aa36.64■■■■□ 3.46
TMEM229B-208ENST00000557779 HDGFP51858 240 aaKnown RBP36.64■■■■□ 3.46
TMEM229B-208ENST00000557779 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP36.62■■■■□ 3.45
TMEM229B-208ENST00000557779 HSPA1LP34931 641 aa36.62■■■■□ 3.45
TMEM229B-208ENST00000557779 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP36.62■■■■□ 3.45
TMEM229B-208ENST00000557779 HFM1A2PYH4 1435 aa36.61■■■■□ 3.45
TMEM229B-208ENST00000557779 BCANQ96GW7 911 aa36.61■■■■□ 3.45
TMEM229B-208ENST00000557779 NWD1Q149M9 1564 aa36.61■■■■□ 3.45
TMEM229B-208ENST00000557779 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa36.59■■■■□ 3.45
TMEM229B-208ENST00000557779 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP36.59■■■■□ 3.45
TMEM229B-208ENST00000557779 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP36.56■■■■□ 3.44
TMEM229B-208ENST00000557779 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP36.56■■■■□ 3.44
TMEM229B-208ENST00000557779 TMEM94Q12767 1356 aa36.55■■■■□ 3.44
TMEM229B-208ENST00000557779 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP36.5■■■■□ 3.43
TMEM229B-208ENST00000557779 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP36.49■■■■□ 3.43
TMEM229B-208ENST00000557779 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa36.49■■■■□ 3.43
TMEM229B-208ENST00000557779 TBX22Q9Y458 520 aa36.48■■■■□ 3.43
TMEM229B-208ENST00000557779 TRPM2O94759 1503 aa36.48■■■■□ 3.43
TMEM229B-208ENST00000557779 DIP2AQ14689 1571 aa36.47■■■■□ 3.43
TMEM229B-208ENST00000557779 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP36.45■■■■□ 3.43
TMEM229B-208ENST00000557779 CLTCL1P53675 1640 aa36.45■■■■□ 3.42
TMEM229B-208ENST00000557779 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
TMEM229B-208ENST00000557779 TRIM52Q96A61 297 aa36.42■■■■□ 3.42
TMEM229B-208ENST00000557779 ILDR2Q71H61 639 aa36.4■■■■□ 3.42
TMEM229B-208ENST00000557779 PIK3R4Q99570 1358 aa36.38■■■■□ 3.41
TMEM229B-208ENST00000557779 FAM135BQ49AJ0 1406 aa36.35■■■■□ 3.41
TMEM229B-208ENST00000557779 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP36.35■■■■□ 3.41
TMEM229B-208ENST00000557779 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP36.35■■■■□ 3.41
TMEM229B-208ENST00000557779 MSH6P52701 1360 aa36.34■■■■□ 3.41
TMEM229B-208ENST00000557779 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa36.34■■■■□ 3.41
TMEM229B-208ENST00000557779 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP36.33■■■■□ 3.41
TMEM229B-208ENST00000557779 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa36.33■■■■□ 3.41
TMEM229B-208ENST00000557779 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa36.31■■■■□ 3.4
TMEM229B-208ENST00000557779 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa36.29■■■■□ 3.4
TMEM229B-208ENST00000557779 KIF1BO60333 1816 aa36.27■■■■□ 3.4
TMEM229B-208ENST00000557779 PTPRUQ92729 1446 aa36.27■■■■□ 3.4
TMEM229B-208ENST00000557779 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa36.25■■■■□ 3.39
TMEM229B-208ENST00000557779 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa36.22■■■■□ 3.39
TMEM229B-208ENST00000557779 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP36.2■■■■□ 3.38
TMEM229B-208ENST00000557779 SLAIN2Q9P270 581 aa36.18■■■■□ 3.38
TMEM229B-208ENST00000557779 METP08581 1390 aa36.17■■■■□ 3.38
TMEM229B-208ENST00000557779 C14orf37Q86TY3 774 aa36.17■■■■□ 3.38
TMEM229B-208ENST00000557779 FOXD1Q16676 465 aa36.16■■■■□ 3.38
TMEM229B-208ENST00000557779 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP36.12■■■■□ 3.37
TMEM229B-208ENST00000557779 C19orf44Q9H6X5 657 aa36.12■■■■□ 3.37
TMEM229B-208ENST00000557779 MPHOSPH9Q99550 1183 aa36.11■■■■□ 3.37
TMEM229B-208ENST00000557779 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa36.1■■■■□ 3.37
TMEM229B-208ENST00000557779 SOCS7O14512 581 aa36.1■■■■□ 3.37
TMEM229B-208ENST00000557779 VGFO15240 615 aaPredicted RBP36.09■■■■□ 3.37
TMEM229B-208ENST00000557779 CADPS2Q86UW7 1296 aa36.09■■■■□ 3.37
TMEM229B-208ENST00000557779 CCDC144AA2RUR9 1427 aa36.07■■■■□ 3.36
TMEM229B-208ENST00000557779 SETD5Q9C0A6 1442 aa36.07■■■■□ 3.36
TMEM229B-208ENST00000557779 ATF3P18847 181 aa36.06■■■■□ 3.36
TMEM229B-208ENST00000557779 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP36.05■■■■□ 3.36
TMEM229B-208ENST00000557779 DCCP43146 1447 aa36.05■■■■□ 3.36
TMEM229B-208ENST00000557779 PPLO60437 1756 aa36.04■■■■□ 3.36
TMEM229B-208ENST00000557779 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP36.04■■■■□ 3.36
TMEM229B-208ENST00000557779 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP36.03■■■■□ 3.36
TMEM229B-208ENST00000557779 PHLPP1O60346 1717 aa36.01■■■■□ 3.36
TMEM229B-208ENST00000557779 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa35.99■■■■□ 3.35
TMEM229B-208ENST00000557779 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP35.95■■■■□ 3.35
TMEM229B-208ENST00000557779 PTCH1Q13635 1447 aa35.95■■■■□ 3.35
TMEM229B-208ENST00000557779 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa35.95■■■■□ 3.35
TMEM229B-208ENST00000557779 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa35.95■■■■□ 3.35
TMEM229B-208ENST00000557779 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP35.94■■■■□ 3.34
TMEM229B-208ENST00000557779 PRAG1Q86YV5 1406 aa35.93■■■■□ 3.34
TMEM229B-208ENST00000557779 NALCNQ8IZF0 1738 aa35.91■■■■□ 3.34
TMEM229B-208ENST00000557779 MST1RQ04912 1400 aa35.91■■■■□ 3.34
TMEM229B-208ENST00000557779 JCADQ9P266 1359 aa35.9■■■■□ 3.34
TMEM229B-208ENST00000557779 RGL3Q3MIN7 710 aa35.9■■■■□ 3.34
TMEM229B-208ENST00000557779 BRINP3Q76B58 766 aa35.89■■■■□ 3.34
TMEM229B-208ENST00000557779 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa35.89■■■■□ 3.34
TMEM229B-208ENST00000557779 IFT172Q9UG01 1749 aa35.88■■■■□ 3.33
TMEM229B-208ENST00000557779 ROBO2Q9HCK4 1378 aa35.88■■■■□ 3.33
TMEM229B-208ENST00000557779 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa35.87■■■■□ 3.33
TMEM229B-208ENST00000557779 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa35.85■■■■□ 3.33
TMEM229B-208ENST00000557779 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP35.84■■■■□ 3.33
TMEM229B-208ENST00000557779 PIK3C2GO75747 1445 aa35.78■■■■□ 3.32
TMEM229B-208ENST00000557779 NHSL1Q5SYE7 1610 aa35.75■■■■□ 3.31
TMEM229B-208ENST00000557779 SHPRHQ149N8 1683 aa35.74■■■■□ 3.31
TMEM229B-208ENST00000557779 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa35.73■■■■□ 3.31
TMEM229B-208ENST00000557779 C1orf167Q5SNV9 1468 aa35.73■■■■□ 3.31
TMEM229B-208ENST00000557779 TECPR2O15040 1411 aa35.72■■■■□ 3.31
TMEM229B-208ENST00000557779 LRP6O75581 1613 aa35.7■■■■□ 3.31
TMEM229B-208ENST00000557779 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP35.7■■■■□ 3.31
TMEM229B-208ENST00000557779 MYOM2P54296 1465 aa35.69■■■■□ 3.3
TMEM229B-208ENST00000557779 NRXN1Q9ULB1 1477 aa35.68■■■■□ 3.3
TMEM229B-208ENST00000557779 HRCP23327 699 aa35.67■■■■□ 3.3
TMEM229B-208ENST00000557779 ABCC11Q96J66 1382 aa35.65■■■■□ 3.3
TMEM229B-208ENST00000557779 STK26Q9P289 416 aa35.65■■■■□ 3.3
TMEM229B-208ENST00000557779 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa35.64■■■■□ 3.3
TMEM229B-208ENST00000557779 KNDC1Q76NI1 1749 aa35.64■■■■□ 3.3
TMEM229B-208ENST00000557779 TMEM132EQ6IEE7 984 aa35.64■■■■□ 3.3
TMEM229B-208ENST00000557779 POTEAQ6S8J7 498 aa35.64■■■■□ 3.3
TMEM229B-208ENST00000557779 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP35.63■■■■□ 3.29
TMEM229B-208ENST00000557779 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
TMEM229B-208ENST00000557779 LAMC1P11047 1609 aa35.61■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms