RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557015.1

PRMT5-224, Transcript of protein arginine methyltransferase 5, human

TSL 2

Gene PRMT5, Length 628 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRMT5-224	ENST00000557015	HRC	P23327	699 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PRMT5-224	ENST00000557015	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PRMT5-224	ENST00000557015	CPS1	P31327	1500 aa		29.2	■■■□□ 2.27
PRMT5-224	ENST00000557015	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		29.2	■■■□□ 2.26
PRMT5-224	ENST00000557015	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	29.19	■■■□□ 2.26
PRMT5-224	ENST00000557015	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	29.19	■■■□□ 2.26
PRMT5-224	ENST00000557015	FBXO41	Q8TF61	875 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PRMT5-224	ENST00000557015	KIF1B	O60333	1816 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PRMT5-224	ENST00000557015	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	29.18	■■■□□ 2.26
PRMT5-224	ENST00000557015	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PRMT5-224	ENST00000557015	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	29.15	■■■□□ 2.26
PRMT5-224	ENST00000557015	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PRMT5-224	ENST00000557015	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PRMT5-224	ENST00000557015	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	29.11	■■■□□ 2.25
PRMT5-224	ENST00000557015	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PRMT5-224	ENST00000557015	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	29.1	■■■□□ 2.25
PRMT5-224	ENST00000557015	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		29.09	■■■□□ 2.25
PRMT5-224	ENST00000557015	DIP2A	Q14689	1571 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PRMT5-224	ENST00000557015	BCAN	Q96GW7	911 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PRMT5-224	ENST00000557015	NWD1	Q149M9	1564 aa		29.05	■■■□□ 2.24
PRMT5-224	ENST00000557015	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		29.05	■■■□□ 2.24
PRMT5-224	ENST00000557015	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		29.05	■■■□□ 2.24
PRMT5-224	ENST00000557015	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		29.05	■■■□□ 2.24
PRMT5-224	ENST00000557015	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		29.05	■■■□□ 2.24
PRMT5-224	ENST00000557015	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	29.04	■■■□□ 2.24
PRMT5-224	ENST00000557015	TBX22	Q9Y458	520 aa		29.04	■■■□□ 2.24
PRMT5-224	ENST00000557015	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		29.01	■■■□□ 2.23
PRMT5-224	ENST00000557015	KCNA6	P17658	529 aa		29.01	■■■□□ 2.23
PRMT5-224	ENST00000557015	PPL	O60437	1756 aa		29.01	■■■□□ 2.23
PRMT5-224	ENST00000557015	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		29	■■■□□ 2.23
PRMT5-224	ENST00000557015	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	28.99	■■■□□ 2.23
PRMT5-224	ENST00000557015	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	28.98	■■■□□ 2.23
PRMT5-224	ENST00000557015	PIK3R4	Q99570	1358 aa		28.97	■■■□□ 2.23
PRMT5-224	ENST00000557015	IFT172	Q9UG01	1749 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PRMT5-224	ENST00000557015	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	28.94	■■■□□ 2.22
PRMT5-224	ENST00000557015	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	28.94	■■■□□ 2.22
PRMT5-224	ENST00000557015	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	28.92	■■■□□ 2.22
PRMT5-224	ENST00000557015	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PRMT5-224	ENST00000557015	RGL3	Q3MIN7	710 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PRMT5-224	ENST00000557015	PTPRU	Q92729	1446 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PRMT5-224	ENST00000557015	ALK	Q9UM73	1620 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PRMT5-224	ENST00000557015	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	28.89	■■■□□ 2.21
PRMT5-224	ENST00000557015	TMEM94	Q12767	1356 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PRMT5-224	ENST00000557015	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
PRMT5-224	ENST00000557015	MET	P08581	1390 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PRMT5-224	ENST00000557015	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
PRMT5-224	ENST00000557015	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PRMT5-224	ENST00000557015	TOM1	O60784	492 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PRMT5-224	ENST00000557015	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PRMT5-224	ENST00000557015	MYOM2	P54296	1465 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PRMT5-224	ENST00000557015	PIK3C2G	O75747	1445 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PRMT5-224	ENST00000557015	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
PRMT5-224	ENST00000557015	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PRMT5-224	ENST00000557015	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PRMT5-224	ENST00000557015	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PRMT5-224	ENST00000557015	MSH6	P52701	1360 aa		28.72	■■■□□ 2.19
PRMT5-224	ENST00000557015	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		28.71	■■■□□ 2.19
PRMT5-224	ENST00000557015	PIP4K2B	P78356	416 aa		28.71	■■■□□ 2.19
PRMT5-224	ENST00000557015	PTCH1	Q13635	1447 aa		28.69	■■■□□ 2.18
PRMT5-224	ENST00000557015	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	28.69	■■■□□ 2.18
PRMT5-224	ENST00000557015	LAMC1	P11047	1609 aa		28.67	■■■□□ 2.18
PRMT5-224	ENST00000557015	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	28.67	■■■□□ 2.18
PRMT5-224	ENST00000557015	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	28.65	■■■□□ 2.18
PRMT5-224	ENST00000557015	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	28.65	■■■□□ 2.18
PRMT5-224	ENST00000557015	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		28.64	■■■□□ 2.18
PRMT5-224	ENST00000557015	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PRMT5-224	ENST00000557015	STAC3	Q96MF2	364 aa		28.63	■■■□□ 2.17
PRMT5-224	ENST00000557015	TECPR2	O15040	1411 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PRMT5-224	ENST00000557015	C14orf37	Q86TY3	774 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PRMT5-224	ENST00000557015	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PRMT5-224	ENST00000557015	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	28.62	■■■□□ 2.17
PRMT5-224	ENST00000557015	DCC	P43146	1447 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PRMT5-224	ENST00000557015	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PRMT5-224	ENST00000557015	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PRMT5-224	ENST00000557015	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PRMT5-224	ENST00000557015	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PRMT5-224	ENST00000557015	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PRMT5-224	ENST00000557015	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PRMT5-224	ENST00000557015	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		28.59	■■■□□ 2.17
PRMT5-224	ENST00000557015	ABCC11	Q96J66	1382 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PRMT5-224	ENST00000557015	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	28.58	■■■□□ 2.17
PRMT5-224	ENST00000557015	HSPA1L	P34931	641 aa		28.57	■■■□□ 2.16
PRMT5-224	ENST00000557015	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		28.56	■■■□□ 2.16
PRMT5-224	ENST00000557015	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		28.55	■■■□□ 2.16
PRMT5-224	ENST00000557015	ADGRB1	O14514	1584 aa		28.55	■■■□□ 2.16
PRMT5-224	ENST00000557015	SLAIN2	Q9P270	581 aa		28.55	■■■□□ 2.16
PRMT5-224	ENST00000557015	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		28.54	■■■□□ 2.16
PRMT5-224	ENST00000557015	ATF3	P18847	181 aa		28.53	■■■□□ 2.16
PRMT5-224	ENST00000557015	STK26	Q9P289	416 aa		28.53	■■■□□ 2.16
PRMT5-224	ENST00000557015	MST1R	Q04912	1400 aa		28.49	■■■□□ 2.15
PRMT5-224	ENST00000557015	SIRT1	Q96EB6	747 aa		28.47	■■■□□ 2.15
PRMT5-224	ENST00000557015	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		28.47	■■■□□ 2.15
PRMT5-224	ENST00000557015	DLC1	Q96QB1	1528 aa		28.46	■■■□□ 2.15
PRMT5-224	ENST00000557015	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		28.45	■■■□□ 2.14
PRMT5-224	ENST00000557015	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		28.45	■■■□□ 2.14
PRMT5-224	ENST00000557015	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		28.45	■■■□□ 2.14
PRMT5-224	ENST00000557015	NEUROD1	Q13562	356 aa		28.44	■■■□□ 2.14
PRMT5-224	ENST00000557015	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		28.44	■■■□□ 2.14
PRMT5-224	ENST00000557015	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		28.42	■■■□□ 2.14
PRMT5-224	ENST00000557015	BRINP3	Q76B58	766 aa		28.38	■■■□□ 2.13

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