RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555837.5

CDKN3-208, Transcript of cyclin dependent kinase inhibitor 3, human

TSL 2

Gene CDKN3, Length 689 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CDKN3-208	ENST00000555837	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		33.76	■■■■□ 3
CDKN3-208	ENST00000555837	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	33.76	■■■□□ 2.99
CDKN3-208	ENST00000555837	CPS1	P31327	1500 aa		33.74	■■■□□ 2.99
CDKN3-208	ENST00000555837	ZFYVE9	O95405	1425 aa		33.74	■■■□□ 2.99
CDKN3-208	ENST00000555837	FBXO41	Q8TF61	875 aa		33.74	■■■□□ 2.99
CDKN3-208	ENST00000555837	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		33.74	■■■□□ 2.99
CDKN3-208	ENST00000555837	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		33.72	■■■□□ 2.99
CDKN3-208	ENST00000555837	KIF1B	O60333	1816 aa		33.72	■■■□□ 2.99
CDKN3-208	ENST00000555837	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		33.72	■■■□□ 2.99
CDKN3-208	ENST00000555837	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		33.72	■■■□□ 2.99
CDKN3-208	ENST00000555837	CLTCL1	P53675	1640 aa		33.69	■■■□□ 2.98
CDKN3-208	ENST00000555837	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		33.68	■■■□□ 2.98
CDKN3-208	ENST00000555837	FOXD1	Q16676	465 aa		33.64	■■■□□ 2.98
CDKN3-208	ENST00000555837	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	33.62	■■■□□ 2.97
CDKN3-208	ENST00000555837	TBX22	Q9Y458	520 aa		33.61	■■■□□ 2.97
CDKN3-208	ENST00000555837	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		33.6	■■■□□ 2.97
CDKN3-208	ENST00000555837	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	33.59	■■■□□ 2.97
CDKN3-208	ENST00000555837	DIP2A	Q14689	1571 aa		33.58	■■■□□ 2.97
CDKN3-208	ENST00000555837	KCNA6	P17658	529 aa		33.57	■■■□□ 2.96
CDKN3-208	ENST00000555837	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	33.55	■■■□□ 2.96
CDKN3-208	ENST00000555837	PIK3R4	Q99570	1358 aa		33.55	■■■□□ 2.96
CDKN3-208	ENST00000555837	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	33.53	■■■□□ 2.96
CDKN3-208	ENST00000555837	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		33.5	■■■□□ 2.95
CDKN3-208	ENST00000555837	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		33.47	■■■□□ 2.95
CDKN3-208	ENST00000555837	TOM1	O60784	492 aa		33.47	■■■□□ 2.95
CDKN3-208	ENST00000555837	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		33.47	■■■□□ 2.95
CDKN3-208	ENST00000555837	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	33.46	■■■□□ 2.95
CDKN3-208	ENST00000555837	RGL3	Q3MIN7	710 aa		33.44	■■■□□ 2.94
CDKN3-208	ENST00000555837	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		33.44	■■■□□ 2.94
CDKN3-208	ENST00000555837	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		33.44	■■■□□ 2.94
CDKN3-208	ENST00000555837	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		33.43	■■■□□ 2.94
CDKN3-208	ENST00000555837	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		33.43	■■■□□ 2.94
CDKN3-208	ENST00000555837	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	33.42	■■■□□ 2.94
CDKN3-208	ENST00000555837	NWD1	Q149M9	1564 aa		33.41	■■■□□ 2.94
CDKN3-208	ENST00000555837	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	33.4	■■■□□ 2.94
CDKN3-208	ENST00000555837	STAC3	Q96MF2	364 aa		33.39	■■■□□ 2.94
CDKN3-208	ENST00000555837	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		33.39	■■■□□ 2.94
CDKN3-208	ENST00000555837	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	33.37	■■■□□ 2.93
CDKN3-208	ENST00000555837	PPL	O60437	1756 aa		33.37	■■■□□ 2.93
CDKN3-208	ENST00000555837	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		33.35	■■■□□ 2.93
CDKN3-208	ENST00000555837	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		33.32	■■■□□ 2.92
CDKN3-208	ENST00000555837	TMEM94	Q12767	1356 aa		33.32	■■■□□ 2.92
CDKN3-208	ENST00000555837	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		33.3	■■■□□ 2.92
CDKN3-208	ENST00000555837	MSH6	P52701	1360 aa		33.27	■■■□□ 2.92
CDKN3-208	ENST00000555837	C14orf37	Q86TY3	774 aa		33.25	■■■□□ 2.91
CDKN3-208	ENST00000555837	IFT172	Q9UG01	1749 aa		33.25	■■■□□ 2.91
CDKN3-208	ENST00000555837	MYOM2	P54296	1465 aa		33.24	■■■□□ 2.91
CDKN3-208	ENST00000555837	ALK	Q9UM73	1620 aa		33.23	■■■□□ 2.91
CDKN3-208	ENST00000555837	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		33.23	■■■□□ 2.91
CDKN3-208	ENST00000555837	MET	P08581	1390 aa		33.22	■■■□□ 2.91
CDKN3-208	ENST00000555837	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	33.22	■■■□□ 2.91
CDKN3-208	ENST00000555837	PIK3C2G	O75747	1445 aa		33.19	■■■□□ 2.9
CDKN3-208	ENST00000555837	PIP4K2B	P78356	416 aa		33.18	■■■□□ 2.9
CDKN3-208	ENST00000555837	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		33.17	■■■□□ 2.9
CDKN3-208	ENST00000555837	PTPRU	Q92729	1446 aa		33.17	■■■□□ 2.9
CDKN3-208	ENST00000555837	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	33.16	■■■□□ 2.9
CDKN3-208	ENST00000555837	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		33.16	■■■□□ 2.9
CDKN3-208	ENST00000555837	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	33.15	■■■□□ 2.9
CDKN3-208	ENST00000555837	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		33.15	■■■□□ 2.9
CDKN3-208	ENST00000555837	LAMC1	P11047	1609 aa		33.13	■■■□□ 2.89
CDKN3-208	ENST00000555837	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		33.13	■■■□□ 2.89
CDKN3-208	ENST00000555837	ATF3	P18847	181 aa		33.13	■■■□□ 2.89
CDKN3-208	ENST00000555837	PTCH1	Q13635	1447 aa		33.12	■■■□□ 2.89
CDKN3-208	ENST00000555837	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	33.12	■■■□□ 2.89
CDKN3-208	ENST00000555837	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		33.11	■■■□□ 2.89
CDKN3-208	ENST00000555837	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	33.11	■■■□□ 2.89
CDKN3-208	ENST00000555837	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	33.1	■■■□□ 2.89
CDKN3-208	ENST00000555837	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		33.09	■■■□□ 2.89
CDKN3-208	ENST00000555837	DCC	P43146	1447 aa		33.08	■■■□□ 2.89
CDKN3-208	ENST00000555837	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	33.08	■■■□□ 2.89
CDKN3-208	ENST00000555837	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	33.05	■■■□□ 2.88
CDKN3-208	ENST00000555837	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		33.04	■■■□□ 2.88
CDKN3-208	ENST00000555837	SLAIN2	Q9P270	581 aa		33.04	■■■□□ 2.88
CDKN3-208	ENST00000555837	ABCC11	Q96J66	1382 aa		33.03	■■■□□ 2.88
CDKN3-208	ENST00000555837	SIRT1	Q96EB6	747 aa		33.01	■■■□□ 2.87
CDKN3-208	ENST00000555837	TECPR2	O15040	1411 aa		33.01	■■■□□ 2.87
CDKN3-208	ENST00000555837	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		33	■■■□□ 2.87
CDKN3-208	ENST00000555837	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		33	■■■□□ 2.87
CDKN3-208	ENST00000555837	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	32.99	■■■□□ 2.87
CDKN3-208	ENST00000555837	STK26	Q9P289	416 aa		32.98	■■■□□ 2.87
CDKN3-208	ENST00000555837	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	32.97	■■■□□ 2.87
CDKN3-208	ENST00000555837	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		32.97	■■■□□ 2.87
CDKN3-208	ENST00000555837	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		32.96	■■■□□ 2.87
CDKN3-208	ENST00000555837	NEUROD1	Q13562	356 aa		32.94	■■■□□ 2.86
CDKN3-208	ENST00000555837	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		32.94	■■■□□ 2.86
CDKN3-208	ENST00000555837	HSPA1L	P34931	641 aa		32.92	■■■□□ 2.86
CDKN3-208	ENST00000555837	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		32.92	■■■□□ 2.86
CDKN3-208	ENST00000555837	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		32.9	■■■□□ 2.86
CDKN3-208	ENST00000555837	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		32.87	■■■□□ 2.85
CDKN3-208	ENST00000555837	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		32.86	■■■□□ 2.85
CDKN3-208	ENST00000555837	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		32.86	■■■□□ 2.85
CDKN3-208	ENST00000555837	POGK	Q9P215	609 aa		32.86	■■■□□ 2.85
CDKN3-208	ENST00000555837	DLC1	Q96QB1	1528 aa		32.84	■■■□□ 2.85
CDKN3-208	ENST00000555837	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		32.84	■■■□□ 2.85
CDKN3-208	ENST00000555837	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		32.83	■■■□□ 2.85
CDKN3-208	ENST00000555837	TONSL	Q96HA7	1378 aa		32.83	■■■□□ 2.85
CDKN3-208	ENST00000555837	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		32.81	■■■□□ 2.84
CDKN3-208	ENST00000555837	ADGRB1	O14514	1584 aa		32.81	■■■□□ 2.84
CDKN3-208	ENST00000555837	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		32.81	■■■□□ 2.84
CDKN3-208	ENST00000555837	MST1R	Q04912	1400 aa		32.79	■■■□□ 2.84

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