RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553948.1

TTC7B-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 7B, humanhuman

TSL 5

Gene TTC7B, Length 630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7B-202ENST00000553948 HDGFP51858 240 aaKnown RBP48.97■■■■■ 5.43
TTC7B-202ENST00000553948 ALKQ9UM73 1620 aa48.97■■■■■ 5.43
TTC7B-202ENST00000553948 BCANQ96GW7 911 aa48.96■■■■■ 5.43
TTC7B-202ENST00000553948 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP48.93■■■■■ 5.42
TTC7B-202ENST00000553948 NAIPQ13075 1403 aa48.92■■■■■ 5.42
TTC7B-202ENST00000553948 KCNA6P17658 529 aa48.9■■■■■ 5.42
TTC7B-202ENST00000553948 HSPA1LP34931 641 aa48.9■■■■■ 5.42
TTC7B-202ENST00000553948 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa48.9■■■■■ 5.42
TTC7B-202ENST00000553948 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP48.88■■■■■ 5.41
TTC7B-202ENST00000553948 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP48.87■■■■■ 5.41
TTC7B-202ENST00000553948 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP48.85■■■■■ 5.41
TTC7B-202ENST00000553948 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa48.83■■■■■ 5.41
TTC7B-202ENST00000553948 NWD1Q149M9 1564 aa48.78■■■■■ 5.4
TTC7B-202ENST00000553948 HFM1A2PYH4 1435 aa48.78■■■■■ 5.4
TTC7B-202ENST00000553948 TMEM94Q12767 1356 aa48.77■■■■■ 5.4
TTC7B-202ENST00000553948 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP48.76■■■■■ 5.4
TTC7B-202ENST00000553948 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP48.75■■■■■ 5.4
TTC7B-202ENST00000553948 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP48.74■■■■■ 5.39
TTC7B-202ENST00000553948 TBX22Q9Y458 520 aa48.7■■■■■ 5.39
TTC7B-202ENST00000553948 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP48.68■■■■■ 5.38
TTC7B-202ENST00000553948 TRIM52Q96A61 297 aa48.67■■■■■ 5.38
TTC7B-202ENST00000553948 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP48.64■■■■■ 5.38
TTC7B-202ENST00000553948 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa48.63■■■■■ 5.38
TTC7B-202ENST00000553948 DIP2AQ14689 1571 aa48.63■■■■■ 5.38
TTC7B-202ENST00000553948 TRPM2O94759 1503 aa48.61■■■■■ 5.37
TTC7B-202ENST00000553948 CLTCL1P53675 1640 aa48.58■■■■■ 5.37
TTC7B-202ENST00000553948 ILDR2Q71H61 639 aa48.58■■■■■ 5.37
TTC7B-202ENST00000553948 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP48.57■■■■■ 5.37
TTC7B-202ENST00000553948 PIK3R4Q99570 1358 aa48.52■■■■■ 5.36
TTC7B-202ENST00000553948 MSH6P52701 1360 aa48.51■■■■■ 5.36
TTC7B-202ENST00000553948 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP48.51■■■■■ 5.36
TTC7B-202ENST00000553948 FAM135BQ49AJ0 1406 aa48.49■■■■■ 5.35
TTC7B-202ENST00000553948 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP48.49■■■■■ 5.35
TTC7B-202ENST00000553948 KIF1BO60333 1816 aa48.48■■■■■ 5.35
TTC7B-202ENST00000553948 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa48.43■■■■■ 5.34
TTC7B-202ENST00000553948 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa48.41■■■■■ 5.34
TTC7B-202ENST00000553948 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa48.41■■■■■ 5.34
TTC7B-202ENST00000553948 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa48.4■■■■■ 5.34
TTC7B-202ENST00000553948 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa48.37■■■■■ 5.33
TTC7B-202ENST00000553948 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa48.36■■■■■ 5.33
TTC7B-202ENST00000553948 C14orf37Q86TY3 774 aa48.35■■■■■ 5.33
TTC7B-202ENST00000553948 PTPRUQ92729 1446 aa48.34■■■■■ 5.33
TTC7B-202ENST00000553948 SLAIN2Q9P270 581 aa48.33■■■■■ 5.33
TTC7B-202ENST00000553948 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP48.25■■■■■ 5.31
TTC7B-202ENST00000553948 FOXD1Q16676 465 aa48.25■■■■■ 5.31
TTC7B-202ENST00000553948 C19orf44Q9H6X5 657 aa48.24■■■■■ 5.31
TTC7B-202ENST00000553948 METP08581 1390 aa48.24■■■■■ 5.31
TTC7B-202ENST00000553948 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP48.22■■■■■ 5.31
TTC7B-202ENST00000553948 SOCS7O14512 581 aa48.22■■■■■ 5.31
TTC7B-202ENST00000553948 VGFO15240 615 aaPredicted RBP48.21■■■■■ 5.31
TTC7B-202ENST00000553948 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa48.19■■■■■ 5.3
TTC7B-202ENST00000553948 CADPS2Q86UW7 1296 aa48.19■■■■■ 5.3
TTC7B-202ENST00000553948 MPHOSPH9Q99550 1183 aa48.19■■■■■ 5.3
TTC7B-202ENST00000553948 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP48.19■■■■■ 5.3
TTC7B-202ENST00000553948 ATF3P18847 181 aa48.18■■■■■ 5.3
TTC7B-202ENST00000553948 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP48.13■■■■■ 5.3
TTC7B-202ENST00000553948 CCDC144AA2RUR9 1427 aa48.12■■■■■ 5.29
TTC7B-202ENST00000553948 SETD5Q9C0A6 1442 aa48.12■■■■■ 5.29
TTC7B-202ENST00000553948 PPLO60437 1756 aa48.11■■■■■ 5.29
TTC7B-202ENST00000553948 PHLPP1O60346 1717 aa48.1■■■■■ 5.29
TTC7B-202ENST00000553948 DCCP43146 1447 aa48.06■■■■■ 5.28
TTC7B-202ENST00000553948 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP48.02■■■■■ 5.28
TTC7B-202ENST00000553948 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa47.96■■■■■ 5.27
TTC7B-202ENST00000553948 RGL3Q3MIN7 710 aa47.95■■■■■ 5.27
TTC7B-202ENST00000553948 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP47.94■■■■■ 5.26
TTC7B-202ENST00000553948 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa47.94■■■■■ 5.26
TTC7B-202ENST00000553948 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa47.92■■■■■ 5.26
TTC7B-202ENST00000553948 JCADQ9P266 1359 aa47.92■■■■■ 5.26
TTC7B-202ENST00000553948 PTCH1Q13635 1447 aa47.9■■■■■ 5.26
TTC7B-202ENST00000553948 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP47.9■■■■■ 5.26
TTC7B-202ENST00000553948 BRINP3Q76B58 766 aa47.89■■■■■ 5.26
TTC7B-202ENST00000553948 NALCNQ8IZF0 1738 aa47.89■■■■■ 5.26
TTC7B-202ENST00000553948 MST1RQ04912 1400 aa47.87■■■■■ 5.25
TTC7B-202ENST00000553948 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa47.87■■■■■ 5.25
TTC7B-202ENST00000553948 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa47.86■■■■■ 5.25
TTC7B-202ENST00000553948 IFT172Q9UG01 1749 aa47.86■■■■■ 5.25
TTC7B-202ENST00000553948 ROBO2Q9HCK4 1378 aa47.85■■■■■ 5.25
TTC7B-202ENST00000553948 PRAG1Q86YV5 1406 aa47.84■■■■■ 5.25
TTC7B-202ENST00000553948 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP47.81■■■■■ 5.24
TTC7B-202ENST00000553948 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa47.81■■■■■ 5.24
TTC7B-202ENST00000553948 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa47.7■■■■■ 5.23
TTC7B-202ENST00000553948 PIK3C2GO75747 1445 aa47.69■■■■■ 5.22
TTC7B-202ENST00000553948 SHPRHQ149N8 1683 aa47.69■■■■■ 5.22
TTC7B-202ENST00000553948 NHSL1Q5SYE7 1610 aa47.68■■■■■ 5.22
TTC7B-202ENST00000553948 C1orf167Q5SNV9 1468 aa47.65■■■■■ 5.22
TTC7B-202ENST00000553948 STK26Q9P289 416 aa47.62■■■■■ 5.21
TTC7B-202ENST00000553948 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP47.61■■■■■ 5.21
TTC7B-202ENST00000553948 HRCP23327 699 aa47.6■■■■■ 5.21
TTC7B-202ENST00000553948 TECPR2O15040 1411 aa47.59■■■■■ 5.21
TTC7B-202ENST00000553948 LRP6O75581 1613 aa47.59■■■■■ 5.21
TTC7B-202ENST00000553948 TMEM132EQ6IEE7 984 aa47.58■■■■■ 5.21
TTC7B-202ENST00000553948 POTEAQ6S8J7 498 aa47.57■■■■■ 5.21
TTC7B-202ENST00000553948 MYOM2P54296 1465 aa47.55■■■■■ 5.2
TTC7B-202ENST00000553948 ABCC11Q96J66 1382 aa47.55■■■■■ 5.2
TTC7B-202ENST00000553948 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP47.55■■■■■ 5.2
TTC7B-202ENST00000553948 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP47.54■■■■■ 5.2
TTC7B-202ENST00000553948 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP47.54■■■■■ 5.2
TTC7B-202ENST00000553948 NRXN1Q9ULB1 1477 aa47.53■■■■■ 5.2
TTC7B-202ENST00000553948 KNDC1Q76NI1 1749 aa47.53■■■■■ 5.2
TTC7B-202ENST00000553948 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa47.52■■■■■ 5.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.1 ms