RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553789.5

RPS6KL1-204, Transcript of ribosomal protein S6 kinase like 1, humanhuman

TSL 3

Gene RPS6KL1, Length 607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1-204ENST00000553789 SLIT1O75093 1534 aa21.89■■□□□ 1.09
RPS6KL1-204ENST00000553789 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa21.88■■□□□ 1.09
RPS6KL1-204ENST00000553789 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP21.88■■□□□ 1.09
RPS6KL1-204ENST00000553789 ARHGAP23Q9P227 1491 aa21.88■■□□□ 1.09
RPS6KL1-204ENST00000553789 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa21.87■■□□□ 1.09
RPS6KL1-204ENST00000553789 NEURL4Q96JN8 1562 aa21.86■■□□□ 1.09
RPS6KL1-204ENST00000553789 TXNDC2Q86VQ3 553 aa21.85■■□□□ 1.09
RPS6KL1-204ENST00000553789 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
RPS6KL1-204ENST00000553789 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
RPS6KL1-204ENST00000553789 KIF1BO60333 1816 aa21.83■■□□□ 1.09
RPS6KL1-204ENST00000553789 TOM1O60784 492 aa21.83■■□□□ 1.09
RPS6KL1-204ENST00000553789 HSPA1LP34931 641 aa21.82■■□□□ 1.08
RPS6KL1-204ENST00000553789 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.81■■□□□ 1.08
RPS6KL1-204ENST00000553789 ZFYVE9O95405 1425 aa21.81■■□□□ 1.08
RPS6KL1-204ENST00000553789 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa21.81■■□□□ 1.08
RPS6KL1-204ENST00000553789 RIMS2Q9UQ26 1411 aa21.81■■□□□ 1.08
RPS6KL1-204ENST00000553789 LTKP29376 864 aa21.81■■□□□ 1.08
RPS6KL1-204ENST00000553789 PIP4K2BP78356 416 aa21.81■■□□□ 1.08
RPS6KL1-204ENST00000553789 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
RPS6KL1-204ENST00000553789 MED14O60244 1454 aa21.8■■□□□ 1.08
RPS6KL1-204ENST00000553789 STAC3Q96MF2 364 aa21.8■■□□□ 1.08
RPS6KL1-204ENST00000553789 VGFO15240 615 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
RPS6KL1-204ENST00000553789 RGL3Q3MIN7 710 aa21.78■■□□□ 1.08
RPS6KL1-204ENST00000553789 CPS1P31327 1500 aa21.77■■□□□ 1.08
RPS6KL1-204ENST00000553789 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
RPS6KL1-204ENST00000553789 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
RPS6KL1-204ENST00000553789 MYO5BQ9ULV0 1848 aa21.75■■□□□ 1.07
RPS6KL1-204ENST00000553789 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa21.74■■□□□ 1.07
RPS6KL1-204ENST00000553789 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
RPS6KL1-204ENST00000553789 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa21.71■■□□□ 1.07
RPS6KL1-204ENST00000553789 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.71■■□□□ 1.07
RPS6KL1-204ENST00000553789 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
RPS6KL1-204ENST00000553789 NEUROD1Q13562 356 aa21.69■■□□□ 1.06
RPS6KL1-204ENST00000553789 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
RPS6KL1-204ENST00000553789 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
RPS6KL1-204ENST00000553789 BCANQ96GW7 911 aa21.68■■□□□ 1.06
RPS6KL1-204ENST00000553789 TBX22Q9Y458 520 aa21.68■■□□□ 1.06
RPS6KL1-204ENST00000553789 IQGAP1P46940 1657 aa21.66■■□□□ 1.06
RPS6KL1-204ENST00000553789 DCAF11Q8TEB1 546 aa21.66■■□□□ 1.06
RPS6KL1-204ENST00000553789 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
RPS6KL1-204ENST00000553789 PPLO60437 1756 aa21.65■■□□□ 1.06
RPS6KL1-204ENST00000553789 MYOM2P54296 1465 aa21.64■■□□□ 1.06
RPS6KL1-204ENST00000553789 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.64■■□□□ 1.05
RPS6KL1-204ENST00000553789 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa21.62■■□□□ 1.05
RPS6KL1-204ENST00000553789 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa21.62■■□□□ 1.05
RPS6KL1-204ENST00000553789 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.62■■□□□ 1.05
RPS6KL1-204ENST00000553789 SLC26A8Q96RN1 970 aa21.61■■□□□ 1.05
RPS6KL1-204ENST00000553789 DIP2AQ14689 1571 aa21.61■■□□□ 1.05
RPS6KL1-204ENST00000553789 PIK3R4Q99570 1358 aa21.61■■□□□ 1.05
RPS6KL1-204ENST00000553789 IFT172Q9UG01 1749 aa21.6■■□□□ 1.05
RPS6KL1-204ENST00000553789 NRXN1Q9ULB1 1477 aa21.6■■□□□ 1.05
RPS6KL1-204ENST00000553789 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa21.6■■□□□ 1.05
RPS6KL1-204ENST00000553789 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa21.6■■□□□ 1.05
RPS6KL1-204ENST00000553789 TONSLQ96HA7 1378 aa21.59■■□□□ 1.05
RPS6KL1-204ENST00000553789 PIK3C2GO75747 1445 aa21.58■■□□□ 1.05
RPS6KL1-204ENST00000553789 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
RPS6KL1-204ENST00000553789 ALKQ9UM73 1620 aa21.56■■□□□ 1.04
RPS6KL1-204ENST00000553789 KCNA6P17658 529 aa21.56■■□□□ 1.04
RPS6KL1-204ENST00000553789 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
RPS6KL1-204ENST00000553789 LRRC7Q96NW7 1537 aa21.54■■□□□ 1.04
RPS6KL1-204ENST00000553789 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa21.53■■□□□ 1.04
RPS6KL1-204ENST00000553789 METP08581 1390 aa21.49■■□□□ 1.03
RPS6KL1-204ENST00000553789 PRAG1Q86YV5 1406 aa21.49■■□□□ 1.03
RPS6KL1-204ENST00000553789 CFAP70Q5T0N1 1121 aa21.49■■□□□ 1.03
RPS6KL1-204ENST00000553789 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa21.48■■□□□ 1.03
RPS6KL1-204ENST00000553789 LAMC1P11047 1609 aa21.47■■□□□ 1.03
RPS6KL1-204ENST00000553789 STRCP1A6NGW2 1772 aa21.46■■□□□ 1.03
RPS6KL1-204ENST00000553789 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
RPS6KL1-204ENST00000553789 NWD1Q149M9 1564 aa21.44■■□□□ 1.02
RPS6KL1-204ENST00000553789 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
RPS6KL1-204ENST00000553789 PTPRUQ92729 1446 aa21.44■■□□□ 1.02
RPS6KL1-204ENST00000553789 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
RPS6KL1-204ENST00000553789 SIRT1Q96EB6 747 aa21.43■■□□□ 1.02
RPS6KL1-204ENST00000553789 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
RPS6KL1-204ENST00000553789 ABCC11Q96J66 1382 aa21.43■■□□□ 1.02
RPS6KL1-204ENST00000553789 TMEM132EQ6IEE7 984 aa21.42■■□□□ 1.02
RPS6KL1-204ENST00000553789 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
RPS6KL1-204ENST00000553789 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa21.42■■□□□ 1.02
RPS6KL1-204ENST00000553789 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa21.41■■□□□ 1.02
RPS6KL1-204ENST00000553789 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
RPS6KL1-204ENST00000553789 NBPF8Q3BBV2 869 aa21.4■■□□□ 1.02
RPS6KL1-204ENST00000553789 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
RPS6KL1-204ENST00000553789 TECPR2O15040 1411 aa21.38■■□□□ 1.01
RPS6KL1-204ENST00000553789 PTCH1Q13635 1447 aa21.38■■□□□ 1.01
RPS6KL1-204ENST00000553789 ADGRB1O14514 1584 aa21.37■■□□□ 1.01
RPS6KL1-204ENST00000553789 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
RPS6KL1-204ENST00000553789 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa21.36■■□□□ 1.01
RPS6KL1-204ENST00000553789 NBPF1Q3BBV0 1214 aa21.36■■□□□ 1.01
RPS6KL1-204ENST00000553789 STK26Q9P289 416 aa21.36■■□□□ 1.01
RPS6KL1-204ENST00000553789 FAM135BQ49AJ0 1406 aa21.35■■□□□ 1.01
RPS6KL1-204ENST00000553789 TMEM94Q12767 1356 aa21.35■■□□□ 1.01
RPS6KL1-204ENST00000553789 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
RPS6KL1-204ENST00000553789 GPRASP1Q5JY77 1395 aa21.34■■□□□ 1.01
RPS6KL1-204ENST00000553789 ROBO2Q9HCK4 1378 aa21.33■■□□□ 1
RPS6KL1-204ENST00000553789 DLC1Q96QB1 1528 aa21.32■■□□□ 1
RPS6KL1-204ENST00000553789 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa21.32■■□□□ 1
RPS6KL1-204ENST00000553789 C19orf44Q9H6X5 657 aa21.31■■□□□ 1
RPS6KL1-204ENST00000553789 TRAK1Q9UPV9 953 aa21.31■■□□□ 1
RPS6KL1-204ENST00000553789 RALGAPBQ86X10 1494 aa21.31■■□□□ 1
RPS6KL1-204ENST00000553789 KNDC1Q76NI1 1749 aa21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms