RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550178.1

DYNLL1-208, Transcript of dynein light chain LC8-type 1, human

BASIC

Gene DYNLL1, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DYNLL1-208	ENST00000550178	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	43.04	■■■■■ 4.48
DYNLL1-208	ENST00000550178	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	43.04	■■■■■ 4.48
DYNLL1-208	ENST00000550178	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	43.04	■■■■■ 4.48
DYNLL1-208	ENST00000550178	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		43.03	■■■■■ 4.48
DYNLL1-208	ENST00000550178	BCAN	Q96GW7	911 aa		43.03	■■■■■ 4.48
DYNLL1-208	ENST00000550178	TRPM2	O94759	1503 aa		43.01	■■■■■ 4.48
DYNLL1-208	ENST00000550178	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		43	■■■■■ 4.47
DYNLL1-208	ENST00000550178	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	42.99	■■■■■ 4.47
DYNLL1-208	ENST00000550178	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		42.98	■■■■■ 4.47
DYNLL1-208	ENST00000550178	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		42.97	■■■■■ 4.47
DYNLL1-208	ENST00000550178	CLTCL1	P53675	1640 aa		42.97	■■■■■ 4.47
DYNLL1-208	ENST00000550178	FOXD1	Q16676	465 aa		42.96	■■■■■ 4.47
DYNLL1-208	ENST00000550178	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		42.92	■■■■■ 4.46
DYNLL1-208	ENST00000550178	KCNA6	P17658	529 aa		42.89	■■■■■ 4.46
DYNLL1-208	ENST00000550178	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	42.89	■■■■■ 4.46
DYNLL1-208	ENST00000550178	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		42.84	■■■■■ 4.45
DYNLL1-208	ENST00000550178	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		42.83	■■■■■ 4.45
DYNLL1-208	ENST00000550178	TBX22	Q9Y458	520 aa		42.83	■■■■■ 4.45
DYNLL1-208	ENST00000550178	TOM1	O60784	492 aa		42.82	■■■■■ 4.45
DYNLL1-208	ENST00000550178	PIP4K2B	P78356	416 aa		42.77	■■■■■ 4.44
DYNLL1-208	ENST00000550178	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	42.76	■■■■■ 4.44
DYNLL1-208	ENST00000550178	KIF1B	O60333	1816 aa		42.76	■■■■■ 4.44
DYNLL1-208	ENST00000550178	ALK	Q9UM73	1620 aa		42.75	■■■■■ 4.43
DYNLL1-208	ENST00000550178	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	42.75	■■■■■ 4.43
DYNLL1-208	ENST00000550178	NWD1	Q149M9	1564 aa		42.74	■■■■■ 4.43
DYNLL1-208	ENST00000550178	TMEM94	Q12767	1356 aa		42.74	■■■■■ 4.43
DYNLL1-208	ENST00000550178	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	42.73	■■■■■ 4.43
DYNLL1-208	ENST00000550178	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		42.73	■■■■■ 4.43
DYNLL1-208	ENST00000550178	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	42.73	■■■■■ 4.43
DYNLL1-208	ENST00000550178	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	42.71	■■■■■ 4.43
DYNLL1-208	ENST00000550178	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	42.68	■■■■■ 4.42
DYNLL1-208	ENST00000550178	DIP2A	Q14689	1571 aa		42.68	■■■■■ 4.42
DYNLL1-208	ENST00000550178	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	42.67	■■■■■ 4.42
DYNLL1-208	ENST00000550178	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		42.66	■■■■■ 4.42
DYNLL1-208	ENST00000550178	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		42.65	■■■■■ 4.42
DYNLL1-208	ENST00000550178	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		42.65	■■■■■ 4.42
DYNLL1-208	ENST00000550178	PIK3R4	Q99570	1358 aa		42.63	■■■■■ 4.41
DYNLL1-208	ENST00000550178	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		42.59	■■■■■ 4.41
DYNLL1-208	ENST00000550178	PTPRU	Q92729	1446 aa		42.59	■■■■■ 4.41
DYNLL1-208	ENST00000550178	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	42.56	■■■■■ 4.4
DYNLL1-208	ENST00000550178	MET	P08581	1390 aa		42.55	■■■■■ 4.4
DYNLL1-208	ENST00000550178	HRC	P23327	699 aa		42.55	■■■■■ 4.4
DYNLL1-208	ENST00000550178	HSPA1L	P34931	641 aa		42.55	■■■■■ 4.4
DYNLL1-208	ENST00000550178	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		42.55	■■■■■ 4.4
DYNLL1-208	ENST00000550178	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		42.54	■■■■■ 4.4
DYNLL1-208	ENST00000550178	RGL3	Q3MIN7	710 aa		42.54	■■■■■ 4.4
DYNLL1-208	ENST00000550178	PPL	O60437	1756 aa		42.47	■■■■■ 4.39
DYNLL1-208	ENST00000550178	MSH6	P52701	1360 aa		42.46	■■■■■ 4.39
DYNLL1-208	ENST00000550178	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		42.41	■■■■■ 4.38
DYNLL1-208	ENST00000550178	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		42.41	■■■■■ 4.38
DYNLL1-208	ENST00000550178	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	42.4	■■■■■ 4.38
DYNLL1-208	ENST00000550178	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		42.39	■■■■■ 4.38
DYNLL1-208	ENST00000550178	C14orf37	Q86TY3	774 aa		42.39	■■■■■ 4.38
DYNLL1-208	ENST00000550178	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	42.34	■■■■■ 4.37
DYNLL1-208	ENST00000550178	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		42.33	■■■■■ 4.37
DYNLL1-208	ENST00000550178	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		42.32	■■■■■ 4.37
DYNLL1-208	ENST00000550178	SLAIN2	Q9P270	581 aa		42.31	■■■■■ 4.36
DYNLL1-208	ENST00000550178	IFT172	Q9UG01	1749 aa		42.3	■■■■■ 4.36
DYNLL1-208	ENST00000550178	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	42.24	■■■■■ 4.35
DYNLL1-208	ENST00000550178	ATF3	P18847	181 aa		42.23	■■■■■ 4.35
DYNLL1-208	ENST00000550178	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		42.22	■■■■■ 4.35
DYNLL1-208	ENST00000550178	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		42.22	■■■■■ 4.35
DYNLL1-208	ENST00000550178	PIK3C2G	O75747	1445 aa		42.2	■■■■■ 4.35
DYNLL1-208	ENST00000550178	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		42.2	■■■■■ 4.35
DYNLL1-208	ENST00000550178	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		42.19	■■■■■ 4.34
DYNLL1-208	ENST00000550178	PTCH1	Q13635	1447 aa		42.17	■■■■■ 4.34
DYNLL1-208	ENST00000550178	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		42.14	■■■■■ 4.34
DYNLL1-208	ENST00000550178	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		42.13	■■■■■ 4.33
DYNLL1-208	ENST00000550178	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		42.12	■■■■■ 4.33
DYNLL1-208	ENST00000550178	MYOM2	P54296	1465 aa		42.12	■■■■■ 4.33
DYNLL1-208	ENST00000550178	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		42.12	■■■■■ 4.33
DYNLL1-208	ENST00000550178	DCC	P43146	1447 aa		42.12	■■■■■ 4.33
DYNLL1-208	ENST00000550178	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		42.1	■■■■■ 4.33
DYNLL1-208	ENST00000550178	STK26	Q9P289	416 aa		42.09	■■■■■ 4.33
DYNLL1-208	ENST00000550178	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	42.08	■■■■■ 4.33
DYNLL1-208	ENST00000550178	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		42.06	■■■■■ 4.32
DYNLL1-208	ENST00000550178	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	42.05	■■■■■ 4.32
DYNLL1-208	ENST00000550178	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		42.05	■■■■■ 4.32
DYNLL1-208	ENST00000550178	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		42.03	■■■■■ 4.32
DYNLL1-208	ENST00000550178	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		42.03	■■■■■ 4.32
DYNLL1-208	ENST00000550178	MST1R	Q04912	1400 aa		42.02	■■■■■ 4.32
DYNLL1-208	ENST00000550178	BRINP3	Q76B58	766 aa		42	■■■■■ 4.31
DYNLL1-208	ENST00000550178	ABCC11	Q96J66	1382 aa		42	■■■■■ 4.31
DYNLL1-208	ENST00000550178	TECPR2	O15040	1411 aa		41.99	■■■■■ 4.31
DYNLL1-208	ENST00000550178	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	41.99	■■■■■ 4.31
DYNLL1-208	ENST00000550178	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	41.99	■■■■■ 4.31
DYNLL1-208	ENST00000550178	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	41.97	■■■■■ 4.31
DYNLL1-208	ENST00000550178	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		41.97	■■■■■ 4.31
DYNLL1-208	ENST00000550178	PHLPP1	O60346	1717 aa		41.93	■■■■■ 4.3
DYNLL1-208	ENST00000550178	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		41.91	■■■■■ 4.3
DYNLL1-208	ENST00000550178	LAMC1	P11047	1609 aa		41.9	■■■■■ 4.3
DYNLL1-208	ENST00000550178	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	41.89	■■■■■ 4.3
DYNLL1-208	ENST00000550178	STAC3	Q96MF2	364 aa		41.88	■■■■■ 4.29
DYNLL1-208	ENST00000550178	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		41.88	■■■■■ 4.29
DYNLL1-208	ENST00000550178	ILDR2	Q71H61	639 aa		41.87	■■■■■ 4.29
DYNLL1-208	ENST00000550178	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		41.86	■■■■■ 4.29
DYNLL1-208	ENST00000550178	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	41.86	■■■■■ 4.29
DYNLL1-208	ENST00000550178	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	41.86	■■■■■ 4.29
DYNLL1-208	ENST00000550178	SIRT1	Q96EB6	747 aa		41.83	■■■■■ 4.29
DYNLL1-208	ENST00000550178	ADGRB1	O14514	1584 aa		41.8	■■■■■ 4.28

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms