RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549400.1

PTPRB-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRB, Length 552 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-207ENST00000549400 CFAP43Q8NDM7 1665 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRB-207ENST00000549400 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRB-207ENST00000549400 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRB-207ENST00000549400 RGL2O15211 777 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRB-207ENST00000549400 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRB-207ENST00000549400 TIAM1Q13009 1591 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRB-207ENST00000549400 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRB-207ENST00000549400 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
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PTPRB-207ENST00000549400 FYCO1Q9BQS8 1478 aa5.58□□□□□ -1.52
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PTPRB-207ENST00000549400 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
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PTPRB-207ENST00000549400 PKD2Q13563 968 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-207ENST00000549400 TRAF7Q6Q0C0 670 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-207ENST00000549400 GAPVD1Q14C86 1478 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRB-207ENST00000549400 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa5.58□□□□□ -1.52
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PTPRB-207ENST00000549400 ZDHHC16Q969W1 377 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-207ENST00000549400 ADAMTS12P58397 1594 aa5.57□□□□□ -1.52
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PTPRB-207ENST00000549400 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-207ENST00000549400 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-207ENST00000549400 BCAMP50895 628 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-207ENST00000549400 ADAM33Q9BZ11 813 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-207ENST00000549400 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-207ENST00000549400 CLSPNQ9HAW4 1339 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-207ENST00000549400 NECTIN2Q92692 538 aa5.55□□□□□ -1.52
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PTPRB-207ENST00000549400 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-207ENST00000549400 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa5.55□□□□□ -1.52
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PTPRB-207ENST00000549400 PBRM1Q86U86 1689 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-207ENST00000549400 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-207ENST00000549400 HS6ST3Q8IZP7 471 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-207ENST00000549400 JPH4Q96JJ6 628 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-207ENST00000549400 RABGEF1Q9UJ41 708 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-207ENST00000549400 FMN1Q68DA7 1419 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-207ENST00000549400 ARHGEF11O15085 1522 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRB-207ENST00000549400 UGGT2Q9NYU1 1516 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRB-207ENST00000549400 GRIN2BQ13224 1484 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRB-207ENST00000549400 SOWAHBA6NEL2 793 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRB-207ENST00000549400 EVI5O60447 810 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRB-207ENST00000549400 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP5.53□□□□□ -1.52
PTPRB-207ENST00000549400 FGD1P98174 961 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-207ENST00000549400 PROX2Q3B8N5 592 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-207ENST00000549400 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-207ENST00000549400 RSPH4AQ5TD94 716 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-207ENST00000549400 NYAP1Q6ZVC0 841 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-207ENST00000549400 WBP1LQ9NX94 342 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-207ENST00000549400 CCNB3Q8WWL7 1395 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-207ENST00000549400 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
PTPRB-207ENST00000549400 ZNF787Q6DD87 383 aa5.51□□□□□ -1.53
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PTPRB-207ENST00000549400 LCE2BO14633 110 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRB-207ENST00000549400 MAP3K9P80192 1104 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRB-207ENST00000549400 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRB-207ENST00000549400 LAPTM4BQ86VI4 370 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRB-207ENST00000549400 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRB-207ENST00000549400 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRB-207ENST00000549400 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRB-207ENST00000549400 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRB-207ENST00000549400 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRB-207ENST00000549400 FHOD3Q2V2M9 1422 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRB-207ENST00000549400 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRB-207ENST00000549400 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRB-207ENST00000549400 NEUROD1Q13562 356 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRB-207ENST00000549400 KIAA1468Q9P260 1216 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRB-207ENST00000549400 CCDC18Q5T9S5 1454 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRB-207ENST00000549400 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa5.48□□□□□ -1.53
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PTPRB-207ENST00000549400 PHLDB1Q86UU1 1377 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRB-207ENST00000549400 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRB-207ENST00000549400 COL9A1P20849 921 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRB-207ENST00000549400 PDE4AP27815 886 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRB-207ENST00000549400 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRB-207ENST00000549400 NUP160Q12769 1436 aa5.48□□□□□ -1.53
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PTPRB-207ENST00000549400 C1orf115Q9H7X2 142 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRB-207ENST00000549400 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRB-207ENST00000549400 KIAA0556O60303 1618 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRB-207ENST00000549400 HECW1Q76N89 1606 aa5.47□□□□□ -1.53
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PTPRB-207ENST00000549400 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRB-207ENST00000549400 AKNAQ7Z591 1439 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRB-207ENST00000549400 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.53
PTPRB-207ENST00000549400 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-207ENST00000549400 CFAP44Q96MT7 982 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-207ENST00000549400 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-207ENST00000549400 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-207ENST00000549400 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-207ENST00000549400 HPS5Q9UPZ3 1129 aa5.46□□□□□ -1.54
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