RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542019.1

TM7SF3-210, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 3

Gene TM7SF3, Length 737 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-210ENST00000542019 SETD5Q9C0A6 1442 aa37.2■■■■□ 3.55
TM7SF3-210ENST00000542019 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP37.2■■■■□ 3.55
TM7SF3-210ENST00000542019 FOXD1Q16676 465 aa37.16■■■■□ 3.54
TM7SF3-210ENST00000542019 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP37.16■■■■□ 3.54
TM7SF3-210ENST00000542019 SLC26A8Q96RN1 970 aa37.15■■■■□ 3.54
TM7SF3-210ENST00000542019 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa37.12■■■■□ 3.53
TM7SF3-210ENST00000542019 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa37.12■■■■□ 3.53
TM7SF3-210ENST00000542019 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP37.11■■■■□ 3.53
TM7SF3-210ENST00000542019 MPHOSPH9Q99550 1183 aa37.09■■■■□ 3.53
TM7SF3-210ENST00000542019 LRRC7Q96NW7 1537 aa37.08■■■■□ 3.53
TM7SF3-210ENST00000542019 BCANQ96GW7 911 aa37.07■■■■□ 3.52
TM7SF3-210ENST00000542019 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP37.06■■■■□ 3.52
TM7SF3-210ENST00000542019 HDGFP51858 240 aaKnown RBP37.05■■■■□ 3.52
TM7SF3-210ENST00000542019 KIF1BO60333 1816 aa37.03■■■■□ 3.52
TM7SF3-210ENST00000542019 UBAP1LF5GYI3 381 aa37.01■■■■□ 3.52
TM7SF3-210ENST00000542019 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP37.01■■■■□ 3.52
TM7SF3-210ENST00000542019 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa37.01■■■■□ 3.51
TM7SF3-210ENST00000542019 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa37■■■■□ 3.51
TM7SF3-210ENST00000542019 NWD1Q149M9 1564 aa36.97■■■■□ 3.51
TM7SF3-210ENST00000542019 KCNA6P17658 529 aa36.96■■■■□ 3.51
TM7SF3-210ENST00000542019 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP36.95■■■■□ 3.51
TM7SF3-210ENST00000542019 ALKQ9UM73 1620 aa36.94■■■■□ 3.5
TM7SF3-210ENST00000542019 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa36.94■■■■□ 3.5
TM7SF3-210ENST00000542019 TBX22Q9Y458 520 aa36.91■■■■□ 3.5
TM7SF3-210ENST00000542019 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP36.9■■■■□ 3.5
TM7SF3-210ENST00000542019 DIP2AQ14689 1571 aa36.9■■■■□ 3.5
TM7SF3-210ENST00000542019 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP36.89■■■■□ 3.5
TM7SF3-210ENST00000542019 CCDC144AA2RUR9 1427 aa36.89■■■■□ 3.5
TM7SF3-210ENST00000542019 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa36.89■■■■□ 3.5
TM7SF3-210ENST00000542019 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP36.87■■■■□ 3.49
TM7SF3-210ENST00000542019 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP36.86■■■■□ 3.49
TM7SF3-210ENST00000542019 TMEM94Q12767 1356 aa36.85■■■■□ 3.49
TM7SF3-210ENST00000542019 TOM1O60784 492 aa36.82■■■■□ 3.48
TM7SF3-210ENST00000542019 PIP4K2BP78356 416 aa36.81■■■■□ 3.48
TM7SF3-210ENST00000542019 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP36.81■■■■□ 3.48
TM7SF3-210ENST00000542019 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa36.81■■■■□ 3.48
TM7SF3-210ENST00000542019 PTPRUQ92729 1446 aa36.81■■■■□ 3.48
TM7SF3-210ENST00000542019 PPLO60437 1756 aa36.81■■■■□ 3.48
TM7SF3-210ENST00000542019 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP36.78■■■■□ 3.48
TM7SF3-210ENST00000542019 HRCP23327 699 aa36.77■■■■□ 3.48
TM7SF3-210ENST00000542019 PIK3R4Q99570 1358 aa36.77■■■■□ 3.48
TM7SF3-210ENST00000542019 METP08581 1390 aa36.76■■■■□ 3.47
TM7SF3-210ENST00000542019 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa36.75■■■■□ 3.47
TM7SF3-210ENST00000542019 RGL3Q3MIN7 710 aa36.74■■■■□ 3.47
TM7SF3-210ENST00000542019 VGFO15240 615 aaPredicted RBP36.71■■■■□ 3.47
TM7SF3-210ENST00000542019 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP36.71■■■■□ 3.47
TM7SF3-210ENST00000542019 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa36.7■■■■□ 3.47
TM7SF3-210ENST00000542019 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP36.7■■■■□ 3.47
TM7SF3-210ENST00000542019 IFT172Q9UG01 1749 aa36.7■■■■□ 3.47
TM7SF3-210ENST00000542019 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa36.68■■■■□ 3.46
TM7SF3-210ENST00000542019 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa36.65■■■■□ 3.46
TM7SF3-210ENST00000542019 HSPA1LP34931 641 aa36.62■■■■□ 3.45
TM7SF3-210ENST00000542019 MSH6P52701 1360 aa36.59■■■■□ 3.45
TM7SF3-210ENST00000542019 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa36.56■■■■□ 3.44
TM7SF3-210ENST00000542019 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP36.52■■■■□ 3.44
TM7SF3-210ENST00000542019 C14orf37Q86TY3 774 aa36.52■■■■□ 3.44
TM7SF3-210ENST00000542019 PIK3C2GO75747 1445 aa36.51■■■■□ 3.44
TM7SF3-210ENST00000542019 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa36.48■■■■□ 3.43
TM7SF3-210ENST00000542019 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa36.48■■■■□ 3.43
TM7SF3-210ENST00000542019 FAM135BQ49AJ0 1406 aa36.47■■■■□ 3.43
TM7SF3-210ENST00000542019 MYOM2P54296 1465 aa36.47■■■■□ 3.43
TM7SF3-210ENST00000542019 NRXN1Q9ULB1 1477 aa36.45■■■■□ 3.43
TM7SF3-210ENST00000542019 ROBO2Q9HCK4 1378 aa36.45■■■■□ 3.43
TM7SF3-210ENST00000542019 C19orf44Q9H6X5 657 aa36.44■■■■□ 3.42
TM7SF3-210ENST00000542019 PTCH1Q13635 1447 aa36.43■■■■□ 3.42
TM7SF3-210ENST00000542019 SLAIN2Q9P270 581 aa36.43■■■■□ 3.42
TM7SF3-210ENST00000542019 PRAG1Q86YV5 1406 aa36.42■■■■□ 3.42
TM7SF3-210ENST00000542019 NALCNQ8IZF0 1738 aa36.42■■■■□ 3.42
TM7SF3-210ENST00000542019 TMEM132EQ6IEE7 984 aa36.38■■■■□ 3.41
TM7SF3-210ENST00000542019 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa36.38■■■■□ 3.41
TM7SF3-210ENST00000542019 ATF3P18847 181 aa36.36■■■■□ 3.41
TM7SF3-210ENST00000542019 CADPS2Q86UW7 1296 aa36.36■■■■□ 3.41
TM7SF3-210ENST00000542019 DCCP43146 1447 aa36.35■■■■□ 3.41
TM7SF3-210ENST00000542019 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP36.35■■■■□ 3.41
TM7SF3-210ENST00000542019 CFAP70Q5T0N1 1121 aa36.34■■■■□ 3.41
TM7SF3-210ENST00000542019 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP36.33■■■■□ 3.41
TM7SF3-210ENST00000542019 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP36.32■■■■□ 3.4
TM7SF3-210ENST00000542019 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP36.32■■■■□ 3.4
TM7SF3-210ENST00000542019 STK26Q9P289 416 aa36.32■■■■□ 3.4
TM7SF3-210ENST00000542019 DCAF11Q8TEB1 546 aa36.31■■■■□ 3.4
TM7SF3-210ENST00000542019 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa36.31■■■■□ 3.4
TM7SF3-210ENST00000542019 LAMC1P11047 1609 aa36.3■■■■□ 3.4
TM7SF3-210ENST00000542019 TECPR2O15040 1411 aa36.3■■■■□ 3.4
TM7SF3-210ENST00000542019 MST1RQ04912 1400 aa36.29■■■■□ 3.4
TM7SF3-210ENST00000542019 KNDC1Q76NI1 1749 aa36.28■■■■□ 3.4
TM7SF3-210ENST00000542019 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP36.27■■■■□ 3.4
TM7SF3-210ENST00000542019 ABCC11Q96J66 1382 aa36.26■■■■□ 3.39
TM7SF3-210ENST00000542019 DISP3Q9P2K9 1392 aa36.25■■■■□ 3.39
TM7SF3-210ENST00000542019 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa36.24■■■■□ 3.39
TM7SF3-210ENST00000542019 WAPLQ7Z5K2 1190 aa36.23■■■■□ 3.39
TM7SF3-210ENST00000542019 PHLPP1O60346 1717 aa36.22■■■■□ 3.39
TM7SF3-210ENST00000542019 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP36.22■■■■□ 3.39
TM7SF3-210ENST00000542019 BRINP3Q76B58 766 aa36.21■■■■□ 3.39
TM7SF3-210ENST00000542019 ADGRB1O14514 1584 aa36.2■■■■□ 3.39
TM7SF3-210ENST00000542019 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP36.17■■■■□ 3.38
TM7SF3-210ENST00000542019 SIN3AQ96ST3 1273 aa36.16■■■■□ 3.38
TM7SF3-210ENST00000542019 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP36.16■■■■□ 3.38
TM7SF3-210ENST00000542019 C1orf167Q5SNV9 1468 aa36.14■■■■□ 3.38
TM7SF3-210ENST00000542019 STAC3Q96MF2 364 aa36.13■■■■□ 3.37
TM7SF3-210ENST00000542019 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa36.13■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.4 ms