RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539804.1

PITX3-202, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PITX3, Length 1,187 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-202ENST00000539804 RIMS2Q9UQ26 1411 aa36.07■■■■□ 3.36
PITX3-202ENST00000539804 ZFYVE9O95405 1425 aa36.05■■■■□ 3.36
PITX3-202ENST00000539804 BCANQ96GW7 911 aa36.04■■■■□ 3.36
PITX3-202ENST00000539804 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa36.02■■■■□ 3.36
PITX3-202ENST00000539804 MYO5BQ9ULV0 1848 aa35.99■■■■□ 3.35
PITX3-202ENST00000539804 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP35.95■■■■□ 3.35
PITX3-202ENST00000539804 MPHOSPH9Q99550 1183 aa35.95■■■■□ 3.35
PITX3-202ENST00000539804 HRCP23327 699 aa35.93■■■■□ 3.34
PITX3-202ENST00000539804 KIF1BO60333 1816 aa35.91■■■■□ 3.34
PITX3-202ENST00000539804 CLTCL1P53675 1640 aa35.9■■■■□ 3.34
PITX3-202ENST00000539804 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa35.89■■■■□ 3.34
PITX3-202ENST00000539804 UBAP1LF5GYI3 381 aa35.89■■■■□ 3.34
PITX3-202ENST00000539804 TOM1O60784 492 aa35.89■■■■□ 3.34
PITX3-202ENST00000539804 KCNA6P17658 529 aa35.89■■■■□ 3.34
PITX3-202ENST00000539804 SLC26A8Q96RN1 970 aa35.89■■■■□ 3.34
PITX3-202ENST00000539804 TBX22Q9Y458 520 aa35.89■■■■□ 3.34
PITX3-202ENST00000539804 DIP2AQ14689 1571 aa35.87■■■■□ 3.33
PITX3-202ENST00000539804 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa35.85■■■■□ 3.33
PITX3-202ENST00000539804 CCDC144AA2RUR9 1427 aa35.84■■■■□ 3.33
PITX3-202ENST00000539804 LRRC7Q96NW7 1537 aa35.83■■■■□ 3.33
PITX3-202ENST00000539804 PIK3R4Q99570 1358 aa35.83■■■■□ 3.33
PITX3-202ENST00000539804 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP35.8■■■■□ 3.32
PITX3-202ENST00000539804 STRCP1A6NGW2 1772 aa35.79■■■■□ 3.32
PITX3-202ENST00000539804 VGFO15240 615 aaPredicted RBP35.79■■■■□ 3.32
PITX3-202ENST00000539804 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP35.77■■■■□ 3.32
PITX3-202ENST00000539804 NWD1Q149M9 1564 aa35.76■■■■□ 3.32
PITX3-202ENST00000539804 FOXD1Q16676 465 aa35.74■■■■□ 3.31
PITX3-202ENST00000539804 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
PITX3-202ENST00000539804 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa35.73■■■■□ 3.31
PITX3-202ENST00000539804 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa35.73■■■■□ 3.31
PITX3-202ENST00000539804 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa35.72■■■■□ 3.31
PITX3-202ENST00000539804 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP35.69■■■■□ 3.3
PITX3-202ENST00000539804 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa35.66■■■■□ 3.3
PITX3-202ENST00000539804 TMEM94Q12767 1356 aa35.66■■■■□ 3.3
PITX3-202ENST00000539804 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP35.65■■■■□ 3.3
PITX3-202ENST00000539804 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP35.63■■■■□ 3.29
PITX3-202ENST00000539804 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa35.62■■■■□ 3.29
PITX3-202ENST00000539804 MSH6P52701 1360 aa35.6■■■■□ 3.29
PITX3-202ENST00000539804 PIP4K2BP78356 416 aa35.59■■■■□ 3.29
PITX3-202ENST00000539804 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa35.58■■■■□ 3.29
PITX3-202ENST00000539804 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa35.57■■■■□ 3.28
PITX3-202ENST00000539804 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa35.57■■■■□ 3.28
PITX3-202ENST00000539804 PPLO60437 1756 aa35.56■■■■□ 3.28
PITX3-202ENST00000539804 RGL3Q3MIN7 710 aa35.55■■■■□ 3.28
PITX3-202ENST00000539804 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
PITX3-202ENST00000539804 C14orf37Q86TY3 774 aa35.51■■■■□ 3.28
PITX3-202ENST00000539804 METP08581 1390 aa35.47■■■■□ 3.27
PITX3-202ENST00000539804 STAC3Q96MF2 364 aa35.45■■■■□ 3.27
PITX3-202ENST00000539804 C19orf44Q9H6X5 657 aa35.45■■■■□ 3.27
PITX3-202ENST00000539804 PTPRUQ92729 1446 aa35.45■■■■□ 3.27
PITX3-202ENST00000539804 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP35.44■■■■□ 3.26
PITX3-202ENST00000539804 ALKQ9UM73 1620 aa35.44■■■■□ 3.26
PITX3-202ENST00000539804 CADPS2Q86UW7 1296 aa35.43■■■■□ 3.26
PITX3-202ENST00000539804 FAM135BQ49AJ0 1406 aa35.42■■■■□ 3.26
PITX3-202ENST00000539804 IFT172Q9UG01 1749 aa35.42■■■■□ 3.26
PITX3-202ENST00000539804 ATF3P18847 181 aa35.41■■■■□ 3.26
PITX3-202ENST00000539804 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP35.4■■■■□ 3.26
PITX3-202ENST00000539804 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa35.38■■■■□ 3.25
PITX3-202ENST00000539804 MYOM2P54296 1465 aa35.37■■■■□ 3.25
PITX3-202ENST00000539804 HSPA1LP34931 641 aa35.37■■■■□ 3.25
PITX3-202ENST00000539804 DCCP43146 1447 aa35.37■■■■□ 3.25
PITX3-202ENST00000539804 PTCH1Q13635 1447 aa35.37■■■■□ 3.25
PITX3-202ENST00000539804 PRAG1Q86YV5 1406 aa35.36■■■■□ 3.25
PITX3-202ENST00000539804 SLAIN2Q9P270 581 aa35.36■■■■□ 3.25
PITX3-202ENST00000539804 PIK3C2GO75747 1445 aa35.35■■■■□ 3.25
PITX3-202ENST00000539804 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP35.34■■■■□ 3.25
PITX3-202ENST00000539804 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP35.33■■■■□ 3.25
PITX3-202ENST00000539804 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP35.28■■■■□ 3.24
PITX3-202ENST00000539804 NRXN1Q9ULB1 1477 aa35.28■■■■□ 3.24
PITX3-202ENST00000539804 LAMC1P11047 1609 aa35.28■■■■□ 3.24
PITX3-202ENST00000539804 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.24
PITX3-202ENST00000539804 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa35.25■■■■□ 3.23
PITX3-202ENST00000539804 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa35.23■■■■□ 3.23
PITX3-202ENST00000539804 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP35.23■■■■□ 3.23
PITX3-202ENST00000539804 DCAF11Q8TEB1 546 aa35.21■■■■□ 3.23
PITX3-202ENST00000539804 ABCC11Q96J66 1382 aa35.21■■■■□ 3.23
PITX3-202ENST00000539804 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP35.2■■■■□ 3.23
PITX3-202ENST00000539804 TECPR2O15040 1411 aa35.2■■■■□ 3.23
PITX3-202ENST00000539804 ROBO2Q9HCK4 1378 aa35.19■■■■□ 3.22
PITX3-202ENST00000539804 SIRT1Q96EB6 747 aa35.17■■■■□ 3.22
PITX3-202ENST00000539804 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP35.15■■■■□ 3.22
PITX3-202ENST00000539804 KNDC1Q76NI1 1749 aa35.13■■■■□ 3.21
PITX3-202ENST00000539804 STK26Q9P289 416 aa35.13■■■■□ 3.21
PITX3-202ENST00000539804 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa35.13■■■■□ 3.21
PITX3-202ENST00000539804 CFAP70Q5T0N1 1121 aa35.12■■■■□ 3.21
PITX3-202ENST00000539804 TMEM132EQ6IEE7 984 aa35.11■■■■□ 3.21
PITX3-202ENST00000539804 DISP3Q9P2K9 1392 aa35.11■■■■□ 3.21
PITX3-202ENST00000539804 NALCNQ8IZF0 1738 aa35.1■■■■□ 3.21
PITX3-202ENST00000539804 MST1RQ04912 1400 aa35.08■■■■□ 3.21
PITX3-202ENST00000539804 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa35.06■■■■□ 3.2
PITX3-202ENST00000539804 PHLPP1O60346 1717 aa35.03■■■■□ 3.2
PITX3-202ENST00000539804 BRINP3Q76B58 766 aa35.03■■■■□ 3.2
PITX3-202ENST00000539804 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP35.02■■■■□ 3.2
PITX3-202ENST00000539804 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa35■■■■□ 3.19
PITX3-202ENST00000539804 DLC1Q96QB1 1528 aa35■■■■□ 3.19
PITX3-202ENST00000539804 JCADQ9P266 1359 aa34.99■■■■□ 3.19
PITX3-202ENST00000539804 C1orf167Q5SNV9 1468 aa34.98■■■■□ 3.19
PITX3-202ENST00000539804 WAPLQ7Z5K2 1190 aa34.98■■■■□ 3.19
PITX3-202ENST00000539804 POGKQ9P215 609 aa34.96■■■■□ 3.19
PITX3-202ENST00000539804 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP34.96■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms