RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538020.1

LMO3-218, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 622 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-218ENST00000538020 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa17.14■□□□□ 0.33
LMO3-218ENST00000538020 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa17.13■□□□□ 0.33
LMO3-218ENST00000538020 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa17.12■□□□□ 0.33
LMO3-218ENST00000538020 PRAG1Q86YV5 1406 aa17.11■□□□□ 0.33
LMO3-218ENST00000538020 ZFYVE9O95405 1425 aa17.1■□□□□ 0.33
LMO3-218ENST00000538020 VGFO15240 615 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
LMO3-218ENST00000538020 HDGFP51858 240 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
LMO3-218ENST00000538020 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
LMO3-218ENST00000538020 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP17.09■□□□□ 0.33
LMO3-218ENST00000538020 RIMS2Q9UQ26 1411 aa17.09■□□□□ 0.33
LMO3-218ENST00000538020 SLIT1O75093 1534 aa17.08■□□□□ 0.32
LMO3-218ENST00000538020 NRXN1Q9ULB1 1477 aa17.08■□□□□ 0.32
LMO3-218ENST00000538020 TMEM2Q9UHN6 1383 aa17.08■□□□□ 0.32
LMO3-218ENST00000538020 RALGAPBQ86X10 1494 aa17.06■□□□□ 0.32
LMO3-218ENST00000538020 ARHGAP23Q9P227 1491 aa17.06■□□□□ 0.32
LMO3-218ENST00000538020 NBPF8Q3BBV2 869 aa17.06■□□□□ 0.32
LMO3-218ENST00000538020 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa17.06■□□□□ 0.32
LMO3-218ENST00000538020 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa17.05■□□□□ 0.32
LMO3-218ENST00000538020 PIK3C2GO75747 1445 aa17.04■□□□□ 0.32
LMO3-218ENST00000538020 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa17.04■□□□□ 0.32
LMO3-218ENST00000538020 LAMC1P11047 1609 aa17.03■□□□□ 0.32
LMO3-218ENST00000538020 EID1Q9Y6B2 187 aa17.03■□□□□ 0.32
LMO3-218ENST00000538020 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
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LMO3-218ENST00000538020 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
LMO3-218ENST00000538020 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa16.99■□□□□ 0.31
LMO3-218ENST00000538020 TXNDC2Q86VQ3 553 aa16.99■□□□□ 0.31
LMO3-218ENST00000538020 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa16.99■□□□□ 0.31
LMO3-218ENST00000538020 GPRASP1Q5JY77 1395 aa16.98■□□□□ 0.31
LMO3-218ENST00000538020 ANKLE2Q86XL3 938 aa16.97■□□□□ 0.31
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LMO3-218ENST00000538020 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
LMO3-218ENST00000538020 LTKP29376 864 aa16.96■□□□□ 0.31
LMO3-218ENST00000538020 LMTK3Q96Q04 1460 aa16.96■□□□□ 0.31
LMO3-218ENST00000538020 ALKQ9UM73 1620 aa16.96■□□□□ 0.3
LMO3-218ENST00000538020 IQGAP1P46940 1657 aa16.95■□□□□ 0.3
LMO3-218ENST00000538020 CFAP70Q5T0N1 1121 aa16.95■□□□□ 0.3
LMO3-218ENST00000538020 CARD11Q9BXL7 1154 aa16.95■□□□□ 0.3
LMO3-218ENST00000538020 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa16.95■□□□□ 0.3
LMO3-218ENST00000538020 DIP2AQ14689 1571 aa16.94■□□□□ 0.3
LMO3-218ENST00000538020 NBPF1Q3BBV0 1214 aa16.93■□□□□ 0.3
LMO3-218ENST00000538020 BCANQ96GW7 911 aa16.93■□□□□ 0.3
LMO3-218ENST00000538020 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
LMO3-218ENST00000538020 ADGRB1O14514 1584 aa16.92■□□□□ 0.3
LMO3-218ENST00000538020 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP16.91■□□□□ 0.3
LMO3-218ENST00000538020 MED14O60244 1454 aa16.91■□□□□ 0.3
LMO3-218ENST00000538020 USP47Q96K76 1375 aa16.9■□□□□ 0.3
LMO3-218ENST00000538020 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.3
LMO3-218ENST00000538020 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa16.89■□□□□ 0.29
LMO3-218ENST00000538020 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa16.89■□□□□ 0.29
LMO3-218ENST00000538020 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
LMO3-218ENST00000538020 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
LMO3-218ENST00000538020 HSPA2P54652 639 aa16.86■□□□□ 0.29
LMO3-218ENST00000538020 TBX22Q9Y458 520 aa16.86■□□□□ 0.29
LMO3-218ENST00000538020 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
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LMO3-218ENST00000538020 TMEM132EQ6IEE7 984 aa16.85■□□□□ 0.29
LMO3-218ENST00000538020 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa16.85■□□□□ 0.29
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LMO3-218ENST00000538020 PIK3R4Q99570 1358 aa16.84■□□□□ 0.29
LMO3-218ENST00000538020 KNDC1Q76NI1 1749 aa16.84■□□□□ 0.29
LMO3-218ENST00000538020 METP08581 1390 aa16.83■□□□□ 0.28
LMO3-218ENST00000538020 SLC26A8Q96RN1 970 aa16.83■□□□□ 0.28
LMO3-218ENST00000538020 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
LMO3-218ENST00000538020 DLC1Q96QB1 1528 aa16.82■□□□□ 0.28
LMO3-218ENST00000538020 ABCC11Q96J66 1382 aa16.81■□□□□ 0.28
LMO3-218ENST00000538020 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
LMO3-218ENST00000538020 TRAK1Q9UPV9 953 aa16.81■□□□□ 0.28
LMO3-218ENST00000538020 STRCQ7RTU9 1775 aa16.81■□□□□ 0.28
LMO3-218ENST00000538020 CPS1P31327 1500 aa16.8■□□□□ 0.28
LMO3-218ENST00000538020 TECPR2O15040 1411 aa16.8■□□□□ 0.28
LMO3-218ENST00000538020 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa16.79■□□□□ 0.28
LMO3-218ENST00000538020 STK26Q9P289 416 aa16.79■□□□□ 0.28
LMO3-218ENST00000538020 SLC24A1O60721 1099 aa16.78■□□□□ 0.28
LMO3-218ENST00000538020 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
LMO3-218ENST00000538020 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
LMO3-218ENST00000538020 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
LMO3-218ENST00000538020 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
LMO3-218ENST00000538020 QRICH2Q9H0J4 1663 aa16.77■□□□□ 0.28
LMO3-218ENST00000538020 FAM135BQ49AJ0 1406 aa16.77■□□□□ 0.27
LMO3-218ENST00000538020 PTPRUQ92729 1446 aa16.77■□□□□ 0.27
LMO3-218ENST00000538020 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
LMO3-218ENST00000538020 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa16.77■□□□□ 0.27
LMO3-218ENST00000538020 SIRT1Q96EB6 747 aa16.76■□□□□ 0.27
LMO3-218ENST00000538020 PTCH1Q13635 1447 aa16.76■□□□□ 0.27
LMO3-218ENST00000538020 DMRT2Q9Y5R5 561 aa16.75■□□□□ 0.27
LMO3-218ENST00000538020 NWD1Q149M9 1564 aa16.75■□□□□ 0.27
LMO3-218ENST00000538020 POGKQ9P215 609 aa16.74■□□□□ 0.27
LMO3-218ENST00000538020 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa16.74■□□□□ 0.27
LMO3-218ENST00000538020 PRAM1Q96QH2 718 aa16.73■□□□□ 0.27
LMO3-218ENST00000538020 TMF1P82094 1093 aa16.72■□□□□ 0.27
LMO3-218ENST00000538020 TESK2Q96S53 571 aa16.72■□□□□ 0.27
LMO3-218ENST00000538020 KCNA6P17658 529 aa16.71■□□□□ 0.27
LMO3-218ENST00000538020 ROBO2Q9HCK4 1378 aa16.71■□□□□ 0.27
LMO3-218ENST00000538020 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
LMO3-218ENST00000538020 CDCA8Q53HL2 280 aa16.69■□□□□ 0.26
LMO3-218ENST00000538020 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP16.68■□□□□ 0.26
LMO3-218ENST00000538020 CCDC7Q96M83 1385 aa16.67■□□□□ 0.26
LMO3-218ENST00000538020 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa16.67■□□□□ 0.26
LMO3-218ENST00000538020 WAPLQ7Z5K2 1190 aa16.67■□□□□ 0.26
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