RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528426.5

CHID1-212, Transcript of chitinase domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene CHID1, Length 991 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHID1-212ENST00000528426 TRPM2O94759 1503 aa42.62■■■■■ 4.41
CHID1-212ENST00000528426 HRCP23327 699 aa42.61■■■■■ 4.41
CHID1-212ENST00000528426 CPS1P31327 1500 aa42.61■■■■■ 4.41
CHID1-212ENST00000528426 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa42.6■■■■■ 4.41
CHID1-212ENST00000528426 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP42.58■■■■■ 4.41
CHID1-212ENST00000528426 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa42.57■■■■■ 4.41
CHID1-212ENST00000528426 MYO5BQ9ULV0 1848 aa42.55■■■■■ 4.4
CHID1-212ENST00000528426 BCANQ96GW7 911 aa42.52■■■■■ 4.4
CHID1-212ENST00000528426 SLC26A8Q96RN1 970 aa42.52■■■■■ 4.4
CHID1-212ENST00000528426 FOXD1Q16676 465 aa42.51■■■■■ 4.4
CHID1-212ENST00000528426 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP42.49■■■■■ 4.39
CHID1-212ENST00000528426 CLTCL1P53675 1640 aa42.49■■■■■ 4.39
CHID1-212ENST00000528426 TBX22Q9Y458 520 aa42.46■■■■■ 4.39
CHID1-212ENST00000528426 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP42.45■■■■■ 4.39
CHID1-212ENST00000528426 KCNA6P17658 529 aa42.44■■■■■ 4.38
CHID1-212ENST00000528426 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa42.37■■■■■ 4.37
CHID1-212ENST00000528426 CCDC144AA2RUR9 1427 aa42.37■■■■■ 4.37
CHID1-212ENST00000528426 LRRC7Q96NW7 1537 aa42.36■■■■■ 4.37
CHID1-212ENST00000528426 STRCP1A6NGW2 1772 aa42.34■■■■■ 4.37
CHID1-212ENST00000528426 UBAP1LF5GYI3 381 aa42.34■■■■■ 4.37
CHID1-212ENST00000528426 KIF1BO60333 1816 aa42.34■■■■■ 4.37
CHID1-212ENST00000528426 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa42.33■■■■■ 4.37
CHID1-212ENST00000528426 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP42.32■■■■■ 4.37
CHID1-212ENST00000528426 VGFO15240 615 aaPredicted RBP42.3■■■■■ 4.36
CHID1-212ENST00000528426 PIK3R4Q99570 1358 aa42.29■■■■■ 4.36
CHID1-212ENST00000528426 TOM1O60784 492 aa42.28■■■■■ 4.36
CHID1-212ENST00000528426 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa42.27■■■■■ 4.36
CHID1-212ENST00000528426 DIP2AQ14689 1571 aa42.25■■■■■ 4.35
CHID1-212ENST00000528426 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP42.22■■■■■ 4.35
CHID1-212ENST00000528426 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa42.2■■■■■ 4.35
CHID1-212ENST00000528426 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa42.2■■■■■ 4.35
CHID1-212ENST00000528426 NWD1Q149M9 1564 aa42.19■■■■■ 4.34
CHID1-212ENST00000528426 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP42.19■■■■■ 4.34
CHID1-212ENST00000528426 TMEM94Q12767 1356 aa42.16■■■■■ 4.34
CHID1-212ENST00000528426 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa42.15■■■■■ 4.34
CHID1-212ENST00000528426 RGL3Q3MIN7 710 aa42.15■■■■■ 4.34
CHID1-212ENST00000528426 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP42.13■■■■■ 4.34
CHID1-212ENST00000528426 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa42.11■■■■■ 4.33
CHID1-212ENST00000528426 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa42.1■■■■■ 4.33
CHID1-212ENST00000528426 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa42.06■■■■■ 4.32
CHID1-212ENST00000528426 METP08581 1390 aa42.05■■■■■ 4.32
CHID1-212ENST00000528426 PTPRUQ92729 1446 aa42.04■■■■■ 4.32
CHID1-212ENST00000528426 PIP4K2BP78356 416 aa42.03■■■■■ 4.32
CHID1-212ENST00000528426 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP42.03■■■■■ 4.32
CHID1-212ENST00000528426 PPLO60437 1756 aa42.01■■■■■ 4.32
CHID1-212ENST00000528426 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP42.01■■■■■ 4.32
CHID1-212ENST00000528426 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa41.99■■■■■ 4.31
CHID1-212ENST00000528426 ALKQ9UM73 1620 aa41.99■■■■■ 4.31
CHID1-212ENST00000528426 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP41.99■■■■■ 4.31
CHID1-212ENST00000528426 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP41.97■■■■■ 4.31
CHID1-212ENST00000528426 MSH6P52701 1360 aa41.95■■■■■ 4.31
CHID1-212ENST00000528426 C19orf44Q9H6X5 657 aa41.9■■■■■ 4.3
CHID1-212ENST00000528426 STAC3Q96MF2 364 aa41.87■■■■■ 4.29
CHID1-212ENST00000528426 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP41.86■■■■■ 4.29
CHID1-212ENST00000528426 C14orf37Q86TY3 774 aa41.86■■■■■ 4.29
CHID1-212ENST00000528426 IFT172Q9UG01 1749 aa41.86■■■■■ 4.29
CHID1-212ENST00000528426 PIK3C2GO75747 1445 aa41.84■■■■■ 4.29
CHID1-212ENST00000528426 FAM135BQ49AJ0 1406 aa41.82■■■■■ 4.29
CHID1-212ENST00000528426 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP41.81■■■■■ 4.28
CHID1-212ENST00000528426 MYOM2P54296 1465 aa41.81■■■■■ 4.28
CHID1-212ENST00000528426 HSPA1LP34931 641 aa41.81■■■■■ 4.28
CHID1-212ENST00000528426 PRAG1Q86YV5 1406 aa41.8■■■■■ 4.28
CHID1-212ENST00000528426 CADPS2Q86UW7 1296 aa41.8■■■■■ 4.28
CHID1-212ENST00000528426 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP41.8■■■■■ 4.28
CHID1-212ENST00000528426 SLAIN2Q9P270 581 aa41.8■■■■■ 4.28
CHID1-212ENST00000528426 NRXN1Q9ULB1 1477 aa41.79■■■■■ 4.28
CHID1-212ENST00000528426 ATF3P18847 181 aa41.76■■■■■ 4.28
CHID1-212ENST00000528426 PTCH1Q13635 1447 aa41.76■■■■■ 4.28
CHID1-212ENST00000528426 DCAF11Q8TEB1 546 aa41.74■■■■■ 4.27
CHID1-212ENST00000528426 ROBO2Q9HCK4 1378 aa41.71■■■■■ 4.27
CHID1-212ENST00000528426 DCCP43146 1447 aa41.7■■■■■ 4.27
CHID1-212ENST00000528426 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP41.68■■■■■ 4.26
CHID1-212ENST00000528426 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP41.68■■■■■ 4.26
CHID1-212ENST00000528426 ABCC11Q96J66 1382 aa41.68■■■■■ 4.26
CHID1-212ENST00000528426 CFAP70Q5T0N1 1121 aa41.68■■■■■ 4.26
CHID1-212ENST00000528426 TMEM132EQ6IEE7 984 aa41.68■■■■■ 4.26
CHID1-212ENST00000528426 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa41.68■■■■■ 4.26
CHID1-212ENST00000528426 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP41.66■■■■■ 4.26
CHID1-212ENST00000528426 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa41.64■■■■■ 4.26
CHID1-212ENST00000528426 TECPR2O15040 1411 aa41.63■■■■■ 4.26
CHID1-212ENST00000528426 SIRT1Q96EB6 747 aa41.63■■■■■ 4.25
CHID1-212ENST00000528426 STK26Q9P289 416 aa41.62■■■■■ 4.25
CHID1-212ENST00000528426 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP41.59■■■■■ 4.25
CHID1-212ENST00000528426 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa41.58■■■■■ 4.25
CHID1-212ENST00000528426 LAMC1P11047 1609 aa41.55■■■■■ 4.24
CHID1-212ENST00000528426 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa41.54■■■■■ 4.24
CHID1-212ENST00000528426 WAPLQ7Z5K2 1190 aa41.51■■■■■ 4.24
CHID1-212ENST00000528426 SIN3AQ96ST3 1273 aa41.49■■■■■ 4.23
CHID1-212ENST00000528426 MST1RQ04912 1400 aa41.49■■■■■ 4.23
CHID1-212ENST00000528426 BRINP3Q76B58 766 aa41.46■■■■■ 4.23
CHID1-212ENST00000528426 KNDC1Q76NI1 1749 aa41.44■■■■■ 4.22
CHID1-212ENST00000528426 NALCNQ8IZF0 1738 aa41.44■■■■■ 4.22
CHID1-212ENST00000528426 ADGRB1O14514 1584 aa41.42■■■■■ 4.22
CHID1-212ENST00000528426 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa41.4■■■■■ 4.22
CHID1-212ENST00000528426 L3MBTL2Q969R5 705 aa41.4■■■■■ 4.22
CHID1-212ENST00000528426 NEUROD1Q13562 356 aa41.39■■■■■ 4.22
CHID1-212ENST00000528426 C1orf167Q5SNV9 1468 aa41.36■■■■■ 4.21
CHID1-212ENST00000528426 DLC1Q96QB1 1528 aa41.36■■■■■ 4.21
CHID1-212ENST00000528426 PRAM1Q96QH2 718 aa41.35■■■■■ 4.21
CHID1-212ENST00000528426 TRAK1Q9UPV9 953 aa41.33■■■■■ 4.21
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