RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528201.1

PACSIN3-204, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-204ENST00000528201 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP36.29■■■■□ 3.4
PACSIN3-204ENST00000528201 MYO5BQ9ULV0 1848 aa36.27■■■■□ 3.4
PACSIN3-204ENST00000528201 HFM1A2PYH4 1435 aa36.26■■■■□ 3.4
PACSIN3-204ENST00000528201 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa36.25■■■■□ 3.39
PACSIN3-204ENST00000528201 KCNA6P17658 529 aa36.23■■■■□ 3.39
PACSIN3-204ENST00000528201 HSPA1LP34931 641 aa36.22■■■■□ 3.39
PACSIN3-204ENST00000528201 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP36.22■■■■□ 3.39
PACSIN3-204ENST00000528201 BCANQ96GW7 911 aa36.21■■■■□ 3.39
PACSIN3-204ENST00000528201 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP36.2■■■■□ 3.39
PACSIN3-204ENST00000528201 HDGFP51858 240 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
PACSIN3-204ENST00000528201 TMEM94Q12767 1356 aa36.15■■■■□ 3.38
PACSIN3-204ENST00000528201 DISP3Q9P2K9 1392 aa36.15■■■■□ 3.38
PACSIN3-204ENST00000528201 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP36.15■■■■□ 3.38
PACSIN3-204ENST00000528201 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP36.15■■■■□ 3.38
PACSIN3-204ENST00000528201 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP36.13■■■■□ 3.37
PACSIN3-204ENST00000528201 NWD1Q149M9 1564 aa36.12■■■■□ 3.37
PACSIN3-204ENST00000528201 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa36.12■■■■□ 3.37
PACSIN3-204ENST00000528201 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa36.11■■■■□ 3.37
PACSIN3-204ENST00000528201 TRIM52Q96A61 297 aa36.11■■■■□ 3.37
PACSIN3-204ENST00000528201 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP36.09■■■■□ 3.37
PACSIN3-204ENST00000528201 TBX22Q9Y458 520 aa36.09■■■■□ 3.37
PACSIN3-204ENST00000528201 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP36.07■■■■□ 3.37
PACSIN3-204ENST00000528201 TRPM2O94759 1503 aa36.06■■■■□ 3.36
PACSIN3-204ENST00000528201 CLTCL1P53675 1640 aa36.05■■■■□ 3.36
PACSIN3-204ENST00000528201 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP36.01■■■■□ 3.36
PACSIN3-204ENST00000528201 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP35.98■■■■□ 3.35
PACSIN3-204ENST00000528201 ILDR2Q71H61 639 aa35.98■■■■□ 3.35
PACSIN3-204ENST00000528201 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP35.95■■■■□ 3.35
PACSIN3-204ENST00000528201 DIP2AQ14689 1571 aa35.95■■■■□ 3.35
PACSIN3-204ENST00000528201 PTPRUQ92729 1446 aa35.93■■■■□ 3.34
PACSIN3-204ENST00000528201 FOXD1Q16676 465 aa35.93■■■■□ 3.34
PACSIN3-204ENST00000528201 PIK3R4Q99570 1358 aa35.92■■■■□ 3.34
PACSIN3-204ENST00000528201 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa35.91■■■■□ 3.34
PACSIN3-204ENST00000528201 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa35.91■■■■□ 3.34
PACSIN3-204ENST00000528201 FAM135BQ49AJ0 1406 aa35.9■■■■□ 3.34
PACSIN3-204ENST00000528201 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa35.89■■■■□ 3.34
PACSIN3-204ENST00000528201 MSH6P52701 1360 aa35.88■■■■□ 3.33
PACSIN3-204ENST00000528201 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa35.86■■■■□ 3.33
PACSIN3-204ENST00000528201 METP08581 1390 aa35.84■■■■□ 3.33
PACSIN3-204ENST00000528201 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP35.82■■■■□ 3.32
PACSIN3-204ENST00000528201 MPHOSPH9Q99550 1183 aa35.82■■■■□ 3.32
PACSIN3-204ENST00000528201 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa35.81■■■■□ 3.32
PACSIN3-204ENST00000528201 SLAIN2Q9P270 581 aa35.78■■■■□ 3.32
PACSIN3-204ENST00000528201 KIF1BO60333 1816 aa35.77■■■■□ 3.32
PACSIN3-204ENST00000528201 SETD5Q9C0A6 1442 aa35.76■■■■□ 3.32
PACSIN3-204ENST00000528201 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa35.75■■■■□ 3.31
PACSIN3-204ENST00000528201 C14orf37Q86TY3 774 aa35.75■■■■□ 3.31
PACSIN3-204ENST00000528201 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
PACSIN3-204ENST00000528201 C19orf44Q9H6X5 657 aa35.71■■■■□ 3.31
PACSIN3-204ENST00000528201 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa35.71■■■■□ 3.31
PACSIN3-204ENST00000528201 VGFO15240 615 aaPredicted RBP35.7■■■■□ 3.31
PACSIN3-204ENST00000528201 CCDC144AA2RUR9 1427 aa35.68■■■■□ 3.3
PACSIN3-204ENST00000528201 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa35.66■■■■□ 3.3
PACSIN3-204ENST00000528201 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa35.66■■■■□ 3.3
PACSIN3-204ENST00000528201 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP35.65■■■■□ 3.3
PACSIN3-204ENST00000528201 CADPS2Q86UW7 1296 aa35.64■■■■□ 3.3
PACSIN3-204ENST00000528201 ATF3P18847 181 aa35.63■■■■□ 3.29
PACSIN3-204ENST00000528201 RGL3Q3MIN7 710 aa35.61■■■■□ 3.29
PACSIN3-204ENST00000528201 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP35.59■■■■□ 3.29
PACSIN3-204ENST00000528201 PPLO60437 1756 aa35.59■■■■□ 3.29
PACSIN3-204ENST00000528201 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa35.58■■■■□ 3.29
PACSIN3-204ENST00000528201 SOCS7O14512 581 aa35.57■■■■□ 3.28
PACSIN3-204ENST00000528201 DCCP43146 1447 aa35.57■■■■□ 3.28
PACSIN3-204ENST00000528201 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP35.56■■■■□ 3.28
PACSIN3-204ENST00000528201 ROBO2Q9HCK4 1378 aa35.55■■■■□ 3.28
PACSIN3-204ENST00000528201 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP35.54■■■■□ 3.28
PACSIN3-204ENST00000528201 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa35.53■■■■□ 3.28
PACSIN3-204ENST00000528201 PTCH1Q13635 1447 aa35.52■■■■□ 3.28
PACSIN3-204ENST00000528201 BRINP3Q76B58 766 aa35.52■■■■□ 3.28
PACSIN3-204ENST00000528201 MST1RQ04912 1400 aa35.5■■■■□ 3.27
PACSIN3-204ENST00000528201 PRAG1Q86YV5 1406 aa35.49■■■■□ 3.27
PACSIN3-204ENST00000528201 PHLPP1O60346 1717 aa35.49■■■■□ 3.27
PACSIN3-204ENST00000528201 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa35.49■■■■□ 3.27
PACSIN3-204ENST00000528201 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP35.48■■■■□ 3.27
PACSIN3-204ENST00000528201 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP35.48■■■■□ 3.27
PACSIN3-204ENST00000528201 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP35.45■■■■□ 3.27
PACSIN3-204ENST00000528201 NALCNQ8IZF0 1738 aa35.44■■■■□ 3.26
PACSIN3-204ENST00000528201 JCADQ9P266 1359 aa35.44■■■■□ 3.26
PACSIN3-204ENST00000528201 IFT172Q9UG01 1749 aa35.43■■■■□ 3.26
PACSIN3-204ENST00000528201 PIK3C2GO75747 1445 aa35.41■■■■□ 3.26
PACSIN3-204ENST00000528201 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa35.41■■■■□ 3.26
PACSIN3-204ENST00000528201 HRCP23327 699 aa35.36■■■■□ 3.25
PACSIN3-204ENST00000528201 TMEM132EQ6IEE7 984 aa35.36■■■■□ 3.25
PACSIN3-204ENST00000528201 STK26Q9P289 416 aa35.34■■■■□ 3.25
PACSIN3-204ENST00000528201 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP35.33■■■■□ 3.25
PACSIN3-204ENST00000528201 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP35.33■■■■□ 3.25
PACSIN3-204ENST00000528201 C1orf167Q5SNV9 1468 aa35.33■■■■□ 3.25
PACSIN3-204ENST00000528201 NRXN1Q9ULB1 1477 aa35.32■■■■□ 3.24
PACSIN3-204ENST00000528201 TECPR2O15040 1411 aa35.32■■■■□ 3.24
PACSIN3-204ENST00000528201 LRP6O75581 1613 aa35.29■■■■□ 3.24
PACSIN3-204ENST00000528201 MYOM2P54296 1465 aa35.29■■■■□ 3.24
PACSIN3-204ENST00000528201 ABCC11Q96J66 1382 aa35.28■■■■□ 3.24
PACSIN3-204ENST00000528201 WAPLQ7Z5K2 1190 aa35.28■■■■□ 3.24
PACSIN3-204ENST00000528201 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa35.27■■■■□ 3.24
PACSIN3-204ENST00000528201 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
PACSIN3-204ENST00000528201 CFAP70Q5T0N1 1121 aa35.26■■■■□ 3.24
PACSIN3-204ENST00000528201 POTEAQ6S8J7 498 aa35.26■■■■□ 3.24
PACSIN3-204ENST00000528201 ORAI2Q96SN7 254 aa35.26■■■■□ 3.24
PACSIN3-204ENST00000528201 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa35.26■■■■□ 3.23
PACSIN3-204ENST00000528201 NHSL1Q5SYE7 1610 aa35.24■■■■□ 3.23
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