RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521825.1

TSNARE1-207, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene TSNARE1, Length 346 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-207ENST00000521825 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
TSNARE1-207ENST00000521825 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa26.62■■□□□ 1.85
TSNARE1-207ENST00000521825 HDGFP51858 240 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
TSNARE1-207ENST00000521825 SLC26A8Q96RN1 970 aa26.62■■□□□ 1.85
TSNARE1-207ENST00000521825 KIF1BO60333 1816 aa26.61■■□□□ 1.85
TSNARE1-207ENST00000521825 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.61■■□□□ 1.85
TSNARE1-207ENST00000521825 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP26.59■■□□□ 1.85
TSNARE1-207ENST00000521825 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
TSNARE1-207ENST00000521825 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
TSNARE1-207ENST00000521825 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
TSNARE1-207ENST00000521825 NWD1Q149M9 1564 aa26.56■■□□□ 1.84
TSNARE1-207ENST00000521825 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
TSNARE1-207ENST00000521825 ALKQ9UM73 1620 aa26.56■■□□□ 1.84
TSNARE1-207ENST00000521825 BCANQ96GW7 911 aa26.55■■□□□ 1.84
TSNARE1-207ENST00000521825 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
TSNARE1-207ENST00000521825 KCNA6P17658 529 aa26.54■■□□□ 1.84
TSNARE1-207ENST00000521825 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.54■■□□□ 1.84
TSNARE1-207ENST00000521825 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa26.52■■□□□ 1.84
TSNARE1-207ENST00000521825 TOM1O60784 492 aa26.51■■□□□ 1.83
TSNARE1-207ENST00000521825 DIP2AQ14689 1571 aa26.5■■□□□ 1.83
TSNARE1-207ENST00000521825 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa26.5■■□□□ 1.83
TSNARE1-207ENST00000521825 TBX22Q9Y458 520 aa26.5■■□□□ 1.83
TSNARE1-207ENST00000521825 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa26.5■■□□□ 1.83
TSNARE1-207ENST00000521825 FOXD1Q16676 465 aa26.49■■□□□ 1.83
TSNARE1-207ENST00000521825 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.49■■□□□ 1.83
TSNARE1-207ENST00000521825 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
TSNARE1-207ENST00000521825 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
TSNARE1-207ENST00000521825 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.83
TSNARE1-207ENST00000521825 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa26.45■■□□□ 1.82
TSNARE1-207ENST00000521825 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.45■■□□□ 1.82
TSNARE1-207ENST00000521825 PIP4K2BP78356 416 aa26.44■■□□□ 1.82
TSNARE1-207ENST00000521825 TMEM94Q12767 1356 aa26.44■■□□□ 1.82
TSNARE1-207ENST00000521825 PPLO60437 1756 aa26.41■■□□□ 1.82
TSNARE1-207ENST00000521825 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
TSNARE1-207ENST00000521825 PIK3R4Q99570 1358 aa26.41■■□□□ 1.82
TSNARE1-207ENST00000521825 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
TSNARE1-207ENST00000521825 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
TSNARE1-207ENST00000521825 PTPRUQ92729 1446 aa26.37■■□□□ 1.81
TSNARE1-207ENST00000521825 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.36■■□□□ 1.81
TSNARE1-207ENST00000521825 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa26.35■■□□□ 1.81
TSNARE1-207ENST00000521825 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
TSNARE1-207ENST00000521825 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
TSNARE1-207ENST00000521825 IFT172Q9UG01 1749 aa26.33■■□□□ 1.81
TSNARE1-207ENST00000521825 HSPA1LP34931 641 aa26.32■■□□□ 1.8
TSNARE1-207ENST00000521825 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.31■■□□□ 1.8
TSNARE1-207ENST00000521825 METP08581 1390 aa26.31■■□□□ 1.8
TSNARE1-207ENST00000521825 VGFO15240 615 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
TSNARE1-207ENST00000521825 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa26.3■■□□□ 1.8
TSNARE1-207ENST00000521825 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa26.3■■□□□ 1.8
TSNARE1-207ENST00000521825 HRCP23327 699 aa26.29■■□□□ 1.8
TSNARE1-207ENST00000521825 MSH6P52701 1360 aa26.28■■□□□ 1.8
TSNARE1-207ENST00000521825 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
TSNARE1-207ENST00000521825 FAM135BQ49AJ0 1406 aa26.24■■□□□ 1.79
TSNARE1-207ENST00000521825 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa26.24■■□□□ 1.79
TSNARE1-207ENST00000521825 RGL3Q3MIN7 710 aa26.23■■□□□ 1.79
TSNARE1-207ENST00000521825 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa26.19■■□□□ 1.78
TSNARE1-207ENST00000521825 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.19■■□□□ 1.78
TSNARE1-207ENST00000521825 C14orf37Q86TY3 774 aa26.17■■□□□ 1.78
TSNARE1-207ENST00000521825 C19orf44Q9H6X5 657 aa26.17■■□□□ 1.78
TSNARE1-207ENST00000521825 SLAIN2Q9P270 581 aa26.17■■□□□ 1.78
TSNARE1-207ENST00000521825 NALCNQ8IZF0 1738 aa26.14■■□□□ 1.78
TSNARE1-207ENST00000521825 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.14■■□□□ 1.78
TSNARE1-207ENST00000521825 PRAG1Q86YV5 1406 aa26.13■■□□□ 1.77
TSNARE1-207ENST00000521825 CADPS2Q86UW7 1296 aa26.12■■□□□ 1.77
TSNARE1-207ENST00000521825 PIK3C2GO75747 1445 aa26.12■■□□□ 1.77
TSNARE1-207ENST00000521825 PTCH1Q13635 1447 aa26.12■■□□□ 1.77
TSNARE1-207ENST00000521825 DCCP43146 1447 aa26.11■■□□□ 1.77
TSNARE1-207ENST00000521825 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
TSNARE1-207ENST00000521825 ATF3P18847 181 aa26.09■■□□□ 1.77
TSNARE1-207ENST00000521825 MYOM2P54296 1465 aa26.09■■□□□ 1.77
TSNARE1-207ENST00000521825 NRXN1Q9ULB1 1477 aa26.09■■□□□ 1.77
TSNARE1-207ENST00000521825 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa26.09■■□□□ 1.77
TSNARE1-207ENST00000521825 ROBO2Q9HCK4 1378 aa26.08■■□□□ 1.77
TSNARE1-207ENST00000521825 PHLPP1O60346 1717 aa26.08■■□□□ 1.77
TSNARE1-207ENST00000521825 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa26.08■■□□□ 1.77
TSNARE1-207ENST00000521825 KNDC1Q76NI1 1749 aa26.05■■□□□ 1.76
TSNARE1-207ENST00000521825 LAMC1P11047 1609 aa26.03■■□□□ 1.76
TSNARE1-207ENST00000521825 MST1RQ04912 1400 aa26.03■■□□□ 1.76
TSNARE1-207ENST00000521825 TECPR2O15040 1411 aa26.01■■□□□ 1.75
TSNARE1-207ENST00000521825 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
TSNARE1-207ENST00000521825 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
TSNARE1-207ENST00000521825 TMEM132EQ6IEE7 984 aa26■■□□□ 1.75
TSNARE1-207ENST00000521825 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
TSNARE1-207ENST00000521825 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
TSNARE1-207ENST00000521825 BRINP3Q76B58 766 aa25.98■■□□□ 1.75
TSNARE1-207ENST00000521825 ABCC11Q96J66 1382 aa25.97■■□□□ 1.75
TSNARE1-207ENST00000521825 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
TSNARE1-207ENST00000521825 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.96■■□□□ 1.75
TSNARE1-207ENST00000521825 ILDR2Q71H61 639 aa25.96■■□□□ 1.75
TSNARE1-207ENST00000521825 STK26Q9P289 416 aa25.96■■□□□ 1.75
TSNARE1-207ENST00000521825 NHSL1Q5SYE7 1610 aa25.95■■□□□ 1.74
TSNARE1-207ENST00000521825 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
TSNARE1-207ENST00000521825 DCAF11Q8TEB1 546 aa25.94■■□□□ 1.74
TSNARE1-207ENST00000521825 C1orf167Q5SNV9 1468 aa25.92■■□□□ 1.74
TSNARE1-207ENST00000521825 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa25.92■■□□□ 1.74
TSNARE1-207ENST00000521825 WAPLQ7Z5K2 1190 aa25.92■■□□□ 1.74
TSNARE1-207ENST00000521825 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.91■■□□□ 1.74
TSNARE1-207ENST00000521825 STAC3Q96MF2 364 aa25.9■■□□□ 1.74
TSNARE1-207ENST00000521825 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa25.9■■□□□ 1.74
TSNARE1-207ENST00000521825 ADGRB1O14514 1584 aa25.9■■□□□ 1.74
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