RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518848.5

HOXA-AS3-201, HOXA cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4

Gene HOXA-AS3, Length 562 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXA-AS3-201ENST00000518848 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
HOXA-AS3-201ENST00000518848 NWD1Q149M9 1564 aa26.25■■□□□ 1.79
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP26.25■■□□□ 1.79
HOXA-AS3-201ENST00000518848 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXA-AS3-201ENST00000518848 TBX22Q9Y458 520 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXA-AS3-201ENST00000518848 RIMS2Q9UQ26 1411 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXA-AS3-201ENST00000518848 BCANQ96GW7 911 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
HOXA-AS3-201ENST00000518848 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.19■■□□□ 1.78
HOXA-AS3-201ENST00000518848 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa26.19■■□□□ 1.78
HOXA-AS3-201ENST00000518848 MSH6P52701 1360 aa26.18■■□□□ 1.78
HOXA-AS3-201ENST00000518848 MYO5BQ9ULV0 1848 aa26.17■■□□□ 1.78
HOXA-AS3-201ENST00000518848 E9PCH4 1651 aa26.17■■□□□ 1.78
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
HOXA-AS3-201ENST00000518848 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
HOXA-AS3-201ENST00000518848 NUP155O75694 1391 aa26.16■■□□□ 1.78
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PIK3R4Q99570 1358 aa26.15■■□□□ 1.78
HOXA-AS3-201ENST00000518848 SLAIN2Q9P270 581 aa26.13■■□□□ 1.77
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa26.12■■□□□ 1.77
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CHGAP10645 457 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
HOXA-AS3-201ENST00000518848 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
HOXA-AS3-201ENST00000518848 DIP2AQ14689 1571 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXA-AS3-201ENST00000518848 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ITGAEP38570 1179 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXA-AS3-201ENST00000518848 C19orf44Q9H6X5 657 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CADPS2Q86UW7 1296 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXA-AS3-201ENST00000518848 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
HOXA-AS3-201ENST00000518848 TRPM2O94759 1503 aa25.99■■□□□ 1.75
HOXA-AS3-201ENST00000518848 JCADQ9P266 1359 aa25.99■■□□□ 1.75
HOXA-AS3-201ENST00000518848 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXA-AS3-201ENST00000518848 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
HOXA-AS3-201ENST00000518848 C14orf37Q86TY3 774 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ATF3P18847 181 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PHLPP1O60346 1717 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXA-AS3-201ENST00000518848 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.95■■□□□ 1.74
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
HOXA-AS3-201ENST00000518848 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.94■■□□□ 1.74
HOXA-AS3-201ENST00000518848 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
HOXA-AS3-201ENST00000518848 DCCP43146 1447 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PTPRUQ92729 1446 aa25.92■■□□□ 1.74
HOXA-AS3-201ENST00000518848 NAIPQ13075 1403 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
HOXA-AS3-201ENST00000518848 POTEAQ6S8J7 498 aa25.9■■□□□ 1.74
HOXA-AS3-201ENST00000518848 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa25.89■■□□□ 1.74
HOXA-AS3-201ENST00000518848 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
HOXA-AS3-201ENST00000518848 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
HOXA-AS3-201ENST00000518848 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa25.88■■□□□ 1.73
HOXA-AS3-201ENST00000518848 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
HOXA-AS3-201ENST00000518848 METP08581 1390 aa25.83■■□□□ 1.73
HOXA-AS3-201ENST00000518848 BRINP3Q76B58 766 aa25.82■■□□□ 1.72
HOXA-AS3-201ENST00000518848 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.82■■□□□ 1.72
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CLTCL1P53675 1640 aa25.81■■□□□ 1.72
HOXA-AS3-201ENST00000518848 HFM1A2PYH4 1435 aa25.81■■□□□ 1.72
HOXA-AS3-201ENST00000518848 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
HOXA-AS3-201ENST00000518848 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.79■■□□□ 1.72
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KIF1BO60333 1816 aa25.79■■□□□ 1.72
HOXA-AS3-201ENST00000518848 SHPRHQ149N8 1683 aa25.78■■□□□ 1.72
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
HOXA-AS3-201ENST00000518848 MST1RQ04912 1400 aa25.76■■□□□ 1.71
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa25.76■■□□□ 1.71
HOXA-AS3-201ENST00000518848 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.74■■□□□ 1.71
HOXA-AS3-201ENST00000518848 TRIM52Q96A61 297 aa25.74■■□□□ 1.71
HOXA-AS3-201ENST00000518848 LRP6O75581 1613 aa25.74■■□□□ 1.71
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa25.73■■□□□ 1.71
HOXA-AS3-201ENST00000518848 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
HOXA-AS3-201ENST00000518848 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.71■■□□□ 1.71
HOXA-AS3-201ENST00000518848 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PTCH1Q13635 1447 aa25.71■■□□□ 1.71
HOXA-AS3-201ENST00000518848 NHSL1Q5SYE7 1610 aa25.68■■□□□ 1.7
HOXA-AS3-201ENST00000518848 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
HOXA-AS3-201ENST00000518848 NALCNQ8IZF0 1738 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXA-AS3-201ENST00000518848 C1orf167Q5SNV9 1468 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ROBO2Q9HCK4 1378 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
HOXA-AS3-201ENST00000518848 LAMC1P11047 1609 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PPLO60437 1756 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXA-AS3-201ENST00000518848 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
HOXA-AS3-201ENST00000518848 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
HOXA-AS3-201ENST00000518848 RXRBP28702 533 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXA-AS3-201ENST00000518848 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PNPLA6Q8IY17 1366 aa25.57■■□□□ 1.68
HOXA-AS3-201ENST00000518848 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXA-AS3-201ENST00000518848 AFF2P51816 1311 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.54■■□□□ 1.68
HOXA-AS3-201ENST00000518848 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
HOXA-AS3-201ENST00000518848 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXA-AS3-201ENST00000518848 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.52■■□□□ 1.68
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ORAI2Q96SN7 254 aa25.51■■□□□ 1.67
HOXA-AS3-201ENST00000518848 TECPR2O15040 1411 aa25.5■■□□□ 1.67
HOXA-AS3-201ENST00000518848 FOXD1Q16676 465 aa25.5■■□□□ 1.67
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXA-AS3-201ENST00000518848 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP25.49■■□□□ 1.67
HOXA-AS3-201ENST00000518848 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms