RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.39■■□□□ 1.66
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BCANQ96GW7 911 aa25.38■■□□□ 1.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PIP4K2BP78356 416 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.35■■□□□ 1.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TBX22Q9Y458 520 aa25.33■■□□□ 1.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRIM52Q96A61 297 aa25.31■■□□□ 1.64
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ALKQ9UM73 1620 aa25.3■■□□□ 1.64
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HSPA1LP34931 641 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM94Q12767 1356 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NWD1Q149M9 1564 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRPM2O94759 1503 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PIK3R4Q99570 1358 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DIP2AQ14689 1571 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CLTCL1P53675 1640 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.14■■□□□ 1.62
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MSH6P52701 1360 aa25.14■■□□□ 1.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KIF1BO60333 1816 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLAIN2Q9P270 581 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PTPRUQ92729 1446 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FOXD1Q16676 465 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C19orf44Q9H6X5 657 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ILDR2Q71H61 639 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C14orf37Q86TY3 774 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 METP08581 1390 aa25.03■■□□□ 1.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CADPS2Q86UW7 1296 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ATF3P18847 181 aa24.99■■□□□ 1.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa24.97■■□□□ 1.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HRCP23327 699 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.93■■□□□ 1.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RGL3Q3MIN7 710 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DCCP43146 1447 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PPLO60437 1756 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SOCS7O14512 581 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PTCH1Q13635 1447 aa24.85■■□□□ 1.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BRINP3Q76B58 766 aa24.83■■□□□ 1.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PHLPP1O60346 1717 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXC-AS3-202ENST00000513165 JCADQ9P266 1359 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MST1RQ04912 1400 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IFT172Q9UG01 1749 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
HOXC-AS3-202ENST00000513165 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PIK3C2GO75747 1445 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NALCNQ8IZF0 1738 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ABCC11Q96J66 1382 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.72■■□□□ 1.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TECPR2O15040 1411 aa24.72■■□□□ 1.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM132EQ6IEE7 984 aa24.71■■□□□ 1.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C1orf167Q5SNV9 1468 aa24.7■■□□□ 1.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NRXN1Q9ULB1 1477 aa24.7■■□□□ 1.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SIRT1Q96EB6 747 aa24.7■■□□□ 1.54
HOXC-AS3-202ENST00000513165 STK26Q9P289 416 aa24.7■■□□□ 1.54
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MYOM2P54296 1465 aa24.7■■□□□ 1.54
HOXC-AS3-202ENST00000513165 STAC3Q96MF2 364 aa24.69■■□□□ 1.54
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
HOXC-AS3-202ENST00000513165 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.67■■□□□ 1.54
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CFAP70Q5T0N1 1121 aa24.66■■□□□ 1.54
HOXC-AS3-202ENST00000513165 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NHSL1Q5SYE7 1610 aa24.64■■□□□ 1.54
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