RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511587.1

ZBED3-203, Transcript of zinc finger BED-type containing 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene ZBED3, Length 542 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-203ENST00000511587 RIMS2Q9UQ26 1411 aa34.53■■■■□ 3.12
ZBED3-203ENST00000511587 NWD1Q149M9 1564 aa34.53■■■■□ 3.12
ZBED3-203ENST00000511587 SLC26A8Q96RN1 970 aa34.52■■■■□ 3.12
ZBED3-203ENST00000511587 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa34.5■■■■□ 3.11
ZBED3-203ENST00000511587 KCNA6P17658 529 aa34.49■■■■□ 3.11
ZBED3-203ENST00000511587 NAIPQ13075 1403 aa34.47■■■■□ 3.11
ZBED3-203ENST00000511587 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa34.45■■■■□ 3.11
ZBED3-203ENST00000511587 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP34.45■■■■□ 3.1
ZBED3-203ENST00000511587 ILDR2Q71H61 639 aa34.43■■■■□ 3.1
ZBED3-203ENST00000511587 TMEM94Q12767 1356 aa34.43■■■■□ 3.1
ZBED3-203ENST00000511587 HDGFP51858 240 aaKnown RBP34.42■■■■□ 3.1
ZBED3-203ENST00000511587 CHGAP10645 457 aaKnown RBP34.41■■■■□ 3.1
ZBED3-203ENST00000511587 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP34.39■■■■□ 3.1
ZBED3-203ENST00000511587 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP34.39■■■■□ 3.1
ZBED3-203ENST00000511587 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP34.39■■■■□ 3.1
ZBED3-203ENST00000511587 BCANQ96GW7 911 aa34.37■■■■□ 3.09
ZBED3-203ENST00000511587 HFM1A2PYH4 1435 aa34.37■■■■□ 3.09
ZBED3-203ENST00000511587 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa34.37■■■■□ 3.09
ZBED3-203ENST00000511587 DIP2AQ14689 1571 aa34.35■■■■□ 3.09
ZBED3-203ENST00000511587 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP34.35■■■■□ 3.09
ZBED3-203ENST00000511587 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP34.34■■■■□ 3.09
ZBED3-203ENST00000511587 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP34.34■■■■□ 3.09
ZBED3-203ENST00000511587 TBX22Q9Y458 520 aa34.33■■■■□ 3.09
ZBED3-203ENST00000511587 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP34.31■■■■□ 3.08
ZBED3-203ENST00000511587 TRPM2O94759 1503 aa34.3■■■■□ 3.08
ZBED3-203ENST00000511587 CLTCL1P53675 1640 aa34.3■■■■□ 3.08
ZBED3-203ENST00000511587 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP34.29■■■■□ 3.08
ZBED3-203ENST00000511587 FAM135BQ49AJ0 1406 aa34.28■■■■□ 3.08
ZBED3-203ENST00000511587 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa34.25■■■■□ 3.07
ZBED3-203ENST00000511587 PIK3R4Q99570 1358 aa34.24■■■■□ 3.07
ZBED3-203ENST00000511587 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa34.22■■■■□ 3.07
ZBED3-203ENST00000511587 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa34.21■■■■□ 3.07
ZBED3-203ENST00000511587 MSH6P52701 1360 aa34.2■■■■□ 3.07
ZBED3-203ENST00000511587 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa34.19■■■■□ 3.06
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ZBED3-203ENST00000511587 KIF1BO60333 1816 aa34.16■■■■□ 3.06
ZBED3-203ENST00000511587 PTPRUQ92729 1446 aa34.16■■■■□ 3.06
ZBED3-203ENST00000511587 SOCS7O14512 581 aa34.15■■■■□ 3.06
ZBED3-203ENST00000511587 TRIM52Q96A61 297 aa34.14■■■■□ 3.06
ZBED3-203ENST00000511587 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP34.13■■■■□ 3.05
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ZBED3-203ENST00000511587 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
ZBED3-203ENST00000511587 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP34.07■■■■□ 3.05
ZBED3-203ENST00000511587 SLAIN2Q9P270 581 aa34.07■■■■□ 3.04
ZBED3-203ENST00000511587 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa34.07■■■■□ 3.04
ZBED3-203ENST00000511587 METP08581 1390 aa34.03■■■■□ 3.04
ZBED3-203ENST00000511587 C19orf44Q9H6X5 657 aa34■■■■□ 3.03
ZBED3-203ENST00000511587 PHLPP1O60346 1717 aa33.99■■■■□ 3.03
ZBED3-203ENST00000511587 C14orf37Q86TY3 774 aa33.98■■■■□ 3.03
ZBED3-203ENST00000511587 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP33.98■■■■□ 3.03
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ZBED3-203ENST00000511587 CADPS2Q86UW7 1296 aa33.95■■■■□ 3.03
ZBED3-203ENST00000511587 DCCP43146 1447 aa33.95■■■■□ 3.02
ZBED3-203ENST00000511587 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP33.93■■■■□ 3.02
ZBED3-203ENST00000511587 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa33.93■■■■□ 3.02
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ZBED3-203ENST00000511587 VGFO15240 615 aaPredicted RBP33.91■■■■□ 3.02
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ZBED3-203ENST00000511587 CCDC144AA2RUR9 1427 aa33.86■■■■□ 3.01
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ZBED3-203ENST00000511587 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP33.85■■■■□ 3.01
ZBED3-203ENST00000511587 PRAG1Q86YV5 1406 aa33.85■■■■□ 3.01
ZBED3-203ENST00000511587 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa33.85■■■■□ 3.01
ZBED3-203ENST00000511587 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa33.84■■■■□ 3.01
ZBED3-203ENST00000511587 JCADQ9P266 1359 aa33.84■■■■□ 3.01
ZBED3-203ENST00000511587 MST1RQ04912 1400 aa33.83■■■■□ 3.01
ZBED3-203ENST00000511587 PTCH1Q13635 1447 aa33.83■■■■□ 3.01
ZBED3-203ENST00000511587 SETD5Q9C0A6 1442 aa33.82■■■■□ 3
ZBED3-203ENST00000511587 IFT172Q9UG01 1749 aa33.81■■■■□ 3
ZBED3-203ENST00000511587 BRINP3Q76B58 766 aa33.79■■■■□ 3
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ZBED3-203ENST00000511587 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa33.67■■■□□ 2.98
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ZBED3-203ENST00000511587 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP33.56■■■□□ 2.96
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ZBED3-203ENST00000511587 ABCC11Q96J66 1382 aa33.53■■■□□ 2.96
ZBED3-203ENST00000511587 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP33.53■■■□□ 2.96
ZBED3-203ENST00000511587 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP33.5■■■□□ 2.95
ZBED3-203ENST00000511587 TMEM132EQ6IEE7 984 aa33.49■■■□□ 2.95
ZBED3-203ENST00000511587 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP33.48■■■□□ 2.95
ZBED3-203ENST00000511587 ORAI2Q96SN7 254 aa33.48■■■□□ 2.95
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