RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510780.5

RASGEF1B-208, Transcript of RasGEF domain family member 1B, human

TSL 3 BASIC

Gene RASGEF1B, Length 539 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RASGEF1B-208	ENST00000510780	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	33.91	■■■■□ 3.02
RASGEF1B-208	ENST00000510780	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	33.9	■■■■□ 3.02
RASGEF1B-208	ENST00000510780		E9PCH4	1651 aa		33.9	■■■■□ 3.02
RASGEF1B-208	ENST00000510780	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		33.9	■■■■□ 3.02
RASGEF1B-208	ENST00000510780	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	33.89	■■■■□ 3.02
RASGEF1B-208	ENST00000510780	ZFYVE9	O95405	1425 aa		33.87	■■■■□ 3.01
RASGEF1B-208	ENST00000510780	NWD1	Q149M9	1564 aa		33.87	■■■■□ 3.01
RASGEF1B-208	ENST00000510780	ITGAE	P38570	1179 aa		33.86	■■■■□ 3.01
RASGEF1B-208	ENST00000510780	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		33.85	■■■■□ 3.01
RASGEF1B-208	ENST00000510780	ROCK1	Q13464	1354 aa		33.84	■■■■□ 3.01
RASGEF1B-208	ENST00000510780	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	33.83	■■■■□ 3.01
RASGEF1B-208	ENST00000510780	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		33.82	■■■■□ 3
RASGEF1B-208	ENST00000510780	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	33.81	■■■■□ 3
RASGEF1B-208	ENST00000510780	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		33.81	■■■■□ 3
RASGEF1B-208	ENST00000510780	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	33.81	■■■■□ 3
RASGEF1B-208	ENST00000510780	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		33.8	■■■■□ 3
RASGEF1B-208	ENST00000510780	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		33.8	■■■■□ 3
RASGEF1B-208	ENST00000510780	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	33.8	■■■■□ 3
RASGEF1B-208	ENST00000510780	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	33.79	■■■■□ 3
RASGEF1B-208	ENST00000510780	NUP155	O75694	1391 aa		33.74	■■■□□ 2.99
RASGEF1B-208	ENST00000510780	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	33.72	■■■□□ 2.99
RASGEF1B-208	ENST00000510780	MSH6	P52701	1360 aa		33.71	■■■□□ 2.99
RASGEF1B-208	ENST00000510780	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	33.68	■■■□□ 2.98
RASGEF1B-208	ENST00000510780	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	33.67	■■■□□ 2.98
RASGEF1B-208	ENST00000510780	TBX22	Q9Y458	520 aa		33.67	■■■□□ 2.98
RASGEF1B-208	ENST00000510780	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		33.67	■■■□□ 2.98
RASGEF1B-208	ENST00000510780	SLAIN2	Q9P270	581 aa		33.63	■■■□□ 2.97
RASGEF1B-208	ENST00000510780	PHLPP1	O60346	1717 aa		33.62	■■■□□ 2.97
RASGEF1B-208	ENST00000510780	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		33.6	■■■□□ 2.97
RASGEF1B-208	ENST00000510780	DIP2A	Q14689	1571 aa		33.59	■■■□□ 2.97
RASGEF1B-208	ENST00000510780	C14orf37	Q86TY3	774 aa		33.56	■■■□□ 2.96
RASGEF1B-208	ENST00000510780	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	33.54	■■■□□ 2.96
RASGEF1B-208	ENST00000510780	TRPM2	O94759	1503 aa		33.53	■■■□□ 2.96
RASGEF1B-208	ENST00000510780	PTPRU	Q92729	1446 aa		33.53	■■■□□ 2.96
RASGEF1B-208	ENST00000510780	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		33.51	■■■□□ 2.96
RASGEF1B-208	ENST00000510780	PIK3R4	Q99570	1358 aa		33.5	■■■□□ 2.95
RASGEF1B-208	ENST00000510780	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		33.5	■■■□□ 2.95
RASGEF1B-208	ENST00000510780	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		33.49	■■■□□ 2.95
RASGEF1B-208	ENST00000510780	POTEA	Q6S8J7	498 aa		33.48	■■■□□ 2.95
RASGEF1B-208	ENST00000510780	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	33.48	■■■□□ 2.95
RASGEF1B-208	ENST00000510780	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	33.46	■■■□□ 2.95
RASGEF1B-208	ENST00000510780	CLTCL1	P53675	1640 aa		33.46	■■■□□ 2.95
RASGEF1B-208	ENST00000510780	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	33.45	■■■□□ 2.95
RASGEF1B-208	ENST00000510780	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		33.44	■■■□□ 2.94
RASGEF1B-208	ENST00000510780	JCAD	Q9P266	1359 aa		33.44	■■■□□ 2.94
RASGEF1B-208	ENST00000510780	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		33.43	■■■□□ 2.94
RASGEF1B-208	ENST00000510780	ATF3	P18847	181 aa		33.42	■■■□□ 2.94
RASGEF1B-208	ENST00000510780	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	33.42	■■■□□ 2.94
RASGEF1B-208	ENST00000510780	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		33.41	■■■□□ 2.94
RASGEF1B-208	ENST00000510780	NAIP	Q13075	1403 aa		33.41	■■■□□ 2.94
RASGEF1B-208	ENST00000510780	MET	P08581	1390 aa		33.37	■■■□□ 2.93
RASGEF1B-208	ENST00000510780	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		33.37	■■■□□ 2.93
RASGEF1B-208	ENST00000510780	KIF1B	O60333	1816 aa		33.36	■■■□□ 2.93
RASGEF1B-208	ENST00000510780	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	33.35	■■■□□ 2.93
RASGEF1B-208	ENST00000510780	LRP6	O75581	1613 aa		33.34	■■■□□ 2.93
RASGEF1B-208	ENST00000510780	BRINP3	Q76B58	766 aa		33.31	■■■□□ 2.92
RASGEF1B-208	ENST00000510780	TRIM52	Q96A61	297 aa		33.29	■■■□□ 2.92
RASGEF1B-208	ENST00000510780	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	33.28	■■■□□ 2.92
RASGEF1B-208	ENST00000510780	SHPRH	Q149N8	1683 aa		33.28	■■■□□ 2.92
RASGEF1B-208	ENST00000510780	DCC	P43146	1447 aa		33.26	■■■□□ 2.91
RASGEF1B-208	ENST00000510780	MST1R	Q04912	1400 aa		33.25	■■■□□ 2.91
RASGEF1B-208	ENST00000510780	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		33.25	■■■□□ 2.91
RASGEF1B-208	ENST00000510780	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		33.24	■■■□□ 2.91
RASGEF1B-208	ENST00000510780	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		33.24	■■■□□ 2.91
RASGEF1B-208	ENST00000510780	HFM1	A2PYH4	1435 aa		33.23	■■■□□ 2.91
RASGEF1B-208	ENST00000510780	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	33.22	■■■□□ 2.91
RASGEF1B-208	ENST00000510780	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		33.19	■■■□□ 2.9
RASGEF1B-208	ENST00000510780	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		33.18	■■■□□ 2.9
RASGEF1B-208	ENST00000510780	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	33.17	■■■□□ 2.9
RASGEF1B-208	ENST00000510780	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	33.17	■■■□□ 2.9
RASGEF1B-208	ENST00000510780	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	33.17	■■■□□ 2.9
RASGEF1B-208	ENST00000510780	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	33.17	■■■□□ 2.9
RASGEF1B-208	ENST00000510780	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	33.16	■■■□□ 2.9
RASGEF1B-208	ENST00000510780	FOXD1	Q16676	465 aa		33.13	■■■□□ 2.89
RASGEF1B-208	ENST00000510780	PPL	O60437	1756 aa		33.13	■■■□□ 2.89
RASGEF1B-208	ENST00000510780	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	33.11	■■■□□ 2.89
RASGEF1B-208	ENST00000510780	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		33.1	■■■□□ 2.89
RASGEF1B-208	ENST00000510780	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		33.09	■■■□□ 2.89
RASGEF1B-208	ENST00000510780	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	33.08	■■■□□ 2.89
RASGEF1B-208	ENST00000510780	PTCH1	Q13635	1447 aa		33.06	■■■□□ 2.88
RASGEF1B-208	ENST00000510780	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		33.05	■■■□□ 2.88
RASGEF1B-208	ENST00000510780	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		33.04	■■■□□ 2.88
RASGEF1B-208	ENST00000510780	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	33.03	■■■□□ 2.88
RASGEF1B-208	ENST00000510780	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		33	■■■□□ 2.87
RASGEF1B-208	ENST00000510780	ORAI2	Q96SN7	254 aa		32.99	■■■□□ 2.87
RASGEF1B-208	ENST00000510780	AFF2	P51816	1311 aa		32.99	■■■□□ 2.87
RASGEF1B-208	ENST00000510780	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		32.96	■■■□□ 2.87
RASGEF1B-208	ENST00000510780	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		32.95	■■■□□ 2.87
RASGEF1B-208	ENST00000510780	RGL3	Q3MIN7	710 aa		32.95	■■■□□ 2.87
RASGEF1B-208	ENST00000510780	RXRB	P28702	533 aa		32.94	■■■□□ 2.86
RASGEF1B-208	ENST00000510780	LAMC1	P11047	1609 aa		32.94	■■■□□ 2.86
RASGEF1B-208	ENST00000510780	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		32.94	■■■□□ 2.86
RASGEF1B-208	ENST00000510780	C8orf37	Q96NL8	207 aa		32.93	■■■□□ 2.86
RASGEF1B-208	ENST00000510780	IFT172	Q9UG01	1749 aa		32.91	■■■□□ 2.86
RASGEF1B-208	ENST00000510780	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		32.91	■■■□□ 2.86
RASGEF1B-208	ENST00000510780	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		32.89	■■■□□ 2.86
RASGEF1B-208	ENST00000510780	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	32.87	■■■□□ 2.85
RASGEF1B-208	ENST00000510780	ADAMTS2	O95450	1211 aa		32.87	■■■□□ 2.85
RASGEF1B-208	ENST00000510780	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	32.87	■■■□□ 2.85
RASGEF1B-208	ENST00000510780	STK26	Q9P289	416 aa		32.87	■■■□□ 2.85

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