RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510032.5

FAM200B-215, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, human

TSL 2

Gene FAM200B, Length 639 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM200B-215	ENST00000510032	ZFYVE9	O95405	1425 aa		33.21	■■■□□ 2.91
FAM200B-215	ENST00000510032	CLTCL1	P53675	1640 aa		33.2	■■■□□ 2.9
FAM200B-215	ENST00000510032	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	33.18	■■■□□ 2.9
FAM200B-215	ENST00000510032	BCAN	Q96GW7	911 aa		33.18	■■■□□ 2.9
FAM200B-215	ENST00000510032	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		33.17	■■■□□ 2.9
FAM200B-215	ENST00000510032	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		33.16	■■■□□ 2.9
FAM200B-215	ENST00000510032	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		33.15	■■■□□ 2.9
FAM200B-215	ENST00000510032	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		33.14	■■■□□ 2.9
FAM200B-215	ENST00000510032	CPS1	P31327	1500 aa		33.09	■■■□□ 2.89
FAM200B-215	ENST00000510032	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	33.09	■■■□□ 2.89
FAM200B-215	ENST00000510032	KIF1B	O60333	1816 aa		33.09	■■■□□ 2.89
FAM200B-215	ENST00000510032	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	33.08	■■■□□ 2.89
FAM200B-215	ENST00000510032	FBXO41	Q8TF61	875 aa		33.07	■■■□□ 2.88
FAM200B-215	ENST00000510032	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		33.07	■■■□□ 2.88
FAM200B-215	ENST00000510032	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		33.06	■■■□□ 2.88
FAM200B-215	ENST00000510032	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		33.03	■■■□□ 2.88
FAM200B-215	ENST00000510032	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	33.02	■■■□□ 2.88
FAM200B-215	ENST00000510032	TBX22	Q9Y458	520 aa		32.99	■■■□□ 2.87
FAM200B-215	ENST00000510032	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		32.98	■■■□□ 2.87
FAM200B-215	ENST00000510032	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	32.98	■■■□□ 2.87
FAM200B-215	ENST00000510032	KCNA6	P17658	529 aa		32.96	■■■□□ 2.87
FAM200B-215	ENST00000510032	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	32.96	■■■□□ 2.87
FAM200B-215	ENST00000510032	DIP2A	Q14689	1571 aa		32.95	■■■□□ 2.86
FAM200B-215	ENST00000510032	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		32.95	■■■□□ 2.86
FAM200B-215	ENST00000510032	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		32.94	■■■□□ 2.86
FAM200B-215	ENST00000510032	RGL3	Q3MIN7	710 aa		32.93	■■■□□ 2.86
FAM200B-215	ENST00000510032	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		32.93	■■■□□ 2.86
FAM200B-215	ENST00000510032	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		32.9	■■■□□ 2.86
FAM200B-215	ENST00000510032	PIK3R4	Q99570	1358 aa		32.89	■■■□□ 2.86
FAM200B-215	ENST00000510032	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		32.88	■■■□□ 2.85
FAM200B-215	ENST00000510032	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		32.87	■■■□□ 2.85
FAM200B-215	ENST00000510032	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	32.85	■■■□□ 2.85
FAM200B-215	ENST00000510032	NWD1	Q149M9	1564 aa		32.83	■■■□□ 2.85
FAM200B-215	ENST00000510032	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		32.83	■■■□□ 2.85
FAM200B-215	ENST00000510032	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	32.83	■■■□□ 2.85
FAM200B-215	ENST00000510032	PPL	O60437	1756 aa		32.81	■■■□□ 2.84
FAM200B-215	ENST00000510032	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		32.8	■■■□□ 2.84
FAM200B-215	ENST00000510032	TOM1	O60784	492 aa		32.78	■■■□□ 2.84
FAM200B-215	ENST00000510032	TMEM94	Q12767	1356 aa		32.77	■■■□□ 2.84
FAM200B-215	ENST00000510032	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		32.76	■■■□□ 2.83
FAM200B-215	ENST00000510032	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	32.76	■■■□□ 2.83
FAM200B-215	ENST00000510032	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		32.75	■■■□□ 2.83
FAM200B-215	ENST00000510032	MET	P08581	1390 aa		32.74	■■■□□ 2.83
FAM200B-215	ENST00000510032	IFT172	Q9UG01	1749 aa		32.71	■■■□□ 2.83
FAM200B-215	ENST00000510032	ALK	Q9UM73	1620 aa		32.69	■■■□□ 2.82
FAM200B-215	ENST00000510032	PTPRU	Q92729	1446 aa		32.69	■■■□□ 2.82
FAM200B-215	ENST00000510032	MYOM2	P54296	1465 aa		32.68	■■■□□ 2.82
FAM200B-215	ENST00000510032	STAC3	Q96MF2	364 aa		32.68	■■■□□ 2.82
FAM200B-215	ENST00000510032	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		32.68	■■■□□ 2.82
FAM200B-215	ENST00000510032	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
FAM200B-215	ENST00000510032	PIK3C2G	O75747	1445 aa		32.66	■■■□□ 2.82
FAM200B-215	ENST00000510032	C14orf37	Q86TY3	774 aa		32.65	■■■□□ 2.82
FAM200B-215	ENST00000510032	MSH6	P52701	1360 aa		32.64	■■■□□ 2.82
FAM200B-215	ENST00000510032	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	32.64	■■■□□ 2.82
FAM200B-215	ENST00000510032	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	32.63	■■■□□ 2.81
FAM200B-215	ENST00000510032	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		32.63	■■■□□ 2.81
FAM200B-215	ENST00000510032	PIP4K2B	P78356	416 aa		32.62	■■■□□ 2.81
FAM200B-215	ENST00000510032	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	32.62	■■■□□ 2.81
FAM200B-215	ENST00000510032	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		32.61	■■■□□ 2.81
FAM200B-215	ENST00000510032	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	32.61	■■■□□ 2.81
FAM200B-215	ENST00000510032	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		32.59	■■■□□ 2.81
FAM200B-215	ENST00000510032	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
FAM200B-215	ENST00000510032	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	32.57	■■■□□ 2.8
FAM200B-215	ENST00000510032	PTCH1	Q13635	1447 aa		32.55	■■■□□ 2.8
FAM200B-215	ENST00000510032	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		32.55	■■■□□ 2.8
FAM200B-215	ENST00000510032	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		32.54	■■■□□ 2.8
FAM200B-215	ENST00000510032	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		32.53	■■■□□ 2.8
FAM200B-215	ENST00000510032	LAMC1	P11047	1609 aa		32.52	■■■□□ 2.8
FAM200B-215	ENST00000510032	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		32.51	■■■□□ 2.79
FAM200B-215	ENST00000510032	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	32.5	■■■□□ 2.79
FAM200B-215	ENST00000510032	ATF3	P18847	181 aa		32.5	■■■□□ 2.79
FAM200B-215	ENST00000510032	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		32.5	■■■□□ 2.79
FAM200B-215	ENST00000510032	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		32.5	■■■□□ 2.79
FAM200B-215	ENST00000510032	STK26	Q9P289	416 aa		32.49	■■■□□ 2.79
FAM200B-215	ENST00000510032	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		32.48	■■■□□ 2.79
FAM200B-215	ENST00000510032	NEUROD1	Q13562	356 aa		32.48	■■■□□ 2.79
FAM200B-215	ENST00000510032	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		32.48	■■■□□ 2.79
FAM200B-215	ENST00000510032	ABCC11	Q96J66	1382 aa		32.46	■■■□□ 2.79
FAM200B-215	ENST00000510032	DCC	P43146	1447 aa		32.45	■■■□□ 2.79
FAM200B-215	ENST00000510032	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.79
FAM200B-215	ENST00000510032	SLAIN2	Q9P270	581 aa		32.45	■■■□□ 2.79
FAM200B-215	ENST00000510032	TECPR2	O15040	1411 aa		32.44	■■■□□ 2.78
FAM200B-215	ENST00000510032	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		32.44	■■■□□ 2.78
FAM200B-215	ENST00000510032	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		32.43	■■■□□ 2.78
FAM200B-215	ENST00000510032	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		32.42	■■■□□ 2.78
FAM200B-215	ENST00000510032	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	32.4	■■■□□ 2.78
FAM200B-215	ENST00000510032	HSPA1L	P34931	641 aa		32.38	■■■□□ 2.77
FAM200B-215	ENST00000510032	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		32.38	■■■□□ 2.77
FAM200B-215	ENST00000510032	SIRT1	Q96EB6	747 aa		32.38	■■■□□ 2.77
FAM200B-215	ENST00000510032	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		32.35	■■■□□ 2.77
FAM200B-215	ENST00000510032	ADGRB1	O14514	1584 aa		32.33	■■■□□ 2.77
FAM200B-215	ENST00000510032	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		32.32	■■■□□ 2.76
FAM200B-215	ENST00000510032	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		32.31	■■■□□ 2.76
FAM200B-215	ENST00000510032	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		32.29	■■■□□ 2.76
FAM200B-215	ENST00000510032	TONSL	Q96HA7	1378 aa		32.29	■■■□□ 2.76
FAM200B-215	ENST00000510032	DLC1	Q96QB1	1528 aa		32.28	■■■□□ 2.76
FAM200B-215	ENST00000510032	POGK	Q9P215	609 aa		32.28	■■■□□ 2.76
FAM200B-215	ENST00000510032	PRAM1	Q96QH2	718 aa		32.27	■■■□□ 2.76
FAM200B-215	ENST00000510032	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		32.27	■■■□□ 2.76
FAM200B-215	ENST00000510032	MST1R	Q04912	1400 aa		32.26	■■■□□ 2.76

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