RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509677.5

SH3BP2-214, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 1,087 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-214ENST00000509677 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa26.93■■□□□ 1.9
SH3BP2-214ENST00000509677 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.92■■□□□ 1.9
SH3BP2-214ENST00000509677 EID1Q9Y6B2 187 aa26.91■■□□□ 1.9
SH3BP2-214ENST00000509677 TRPM2O94759 1503 aa26.9■■□□□ 1.9
SH3BP2-214ENST00000509677 LTKP29376 864 aa26.9■■□□□ 1.9
SH3BP2-214ENST00000509677 HSPA1LP34931 641 aa26.9■■□□□ 1.9
SH3BP2-214ENST00000509677 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.89■■□□□ 1.9
SH3BP2-214ENST00000509677 SLIT1O75093 1534 aa26.88■■□□□ 1.89
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SH3BP2-214ENST00000509677 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
SH3BP2-214ENST00000509677 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
SH3BP2-214ENST00000509677 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa26.86■■□□□ 1.89
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SH3BP2-214ENST00000509677 CLTCL1P53675 1640 aa26.84■■□□□ 1.89
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SH3BP2-214ENST00000509677 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
SH3BP2-214ENST00000509677 RIMS2Q9UQ26 1411 aa26.82■■□□□ 1.88
SH3BP2-214ENST00000509677 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
SH3BP2-214ENST00000509677 HDGFP51858 240 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
SH3BP2-214ENST00000509677 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
SH3BP2-214ENST00000509677 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.8■■□□□ 1.88
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SH3BP2-214ENST00000509677 MYO5BQ9ULV0 1848 aa26.78■■□□□ 1.88
SH3BP2-214ENST00000509677 LRRC7Q96NW7 1537 aa26.77■■□□□ 1.88
SH3BP2-214ENST00000509677 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP26.77■■□□□ 1.88
SH3BP2-214ENST00000509677 BCANQ96GW7 911 aa26.77■■□□□ 1.88
SH3BP2-214ENST00000509677 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.72■■□□□ 1.87
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SH3BP2-214ENST00000509677 SLC26A8Q96RN1 970 aa26.7■■□□□ 1.86
SH3BP2-214ENST00000509677 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.69■■□□□ 1.86
SH3BP2-214ENST00000509677 KIF1BO60333 1816 aa26.69■■□□□ 1.86
SH3BP2-214ENST00000509677 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa26.69■■□□□ 1.86
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SH3BP2-214ENST00000509677 NWD1Q149M9 1564 aa26.52■■□□□ 1.84
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SH3BP2-214ENST00000509677 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa26.5■■□□□ 1.83
SH3BP2-214ENST00000509677 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa26.5■■□□□ 1.83
SH3BP2-214ENST00000509677 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
SH3BP2-214ENST00000509677 PPLO60437 1756 aa26.48■■□□□ 1.83
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SH3BP2-214ENST00000509677 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.47■■□□□ 1.83
SH3BP2-214ENST00000509677 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa26.47■■□□□ 1.83
SH3BP2-214ENST00000509677 NEUROD1Q13562 356 aa26.45■■□□□ 1.82
SH3BP2-214ENST00000509677 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.45■■□□□ 1.82
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SH3BP2-214ENST00000509677 MYOM2P54296 1465 aa26.39■■□□□ 1.82
SH3BP2-214ENST00000509677 PIK3C2GO75747 1445 aa26.39■■□□□ 1.81
SH3BP2-214ENST00000509677 FAM135BQ49AJ0 1406 aa26.39■■□□□ 1.81
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SH3BP2-214ENST00000509677 NRXN1Q9ULB1 1477 aa26.35■■□□□ 1.81
SH3BP2-214ENST00000509677 CFAP70Q5T0N1 1121 aa26.34■■□□□ 1.81
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SH3BP2-214ENST00000509677 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
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SH3BP2-214ENST00000509677 C14orf37Q86TY3 774 aa26.3■■□□□ 1.8
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SH3BP2-214ENST00000509677 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
SH3BP2-214ENST00000509677 MSH6P52701 1360 aa26.3■■□□□ 1.8
SH3BP2-214ENST00000509677 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
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SH3BP2-214ENST00000509677 ROBO2Q9HCK4 1378 aa26.24■■□□□ 1.79
SH3BP2-214ENST00000509677 SLAIN2Q9P270 581 aa26.23■■□□□ 1.79
SH3BP2-214ENST00000509677 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
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SH3BP2-214ENST00000509677 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2-214ENST00000509677 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2-214ENST00000509677 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
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SH3BP2-214ENST00000509677 POTEAQ6S8J7 498 aa26.2■■□□□ 1.78
SH3BP2-214ENST00000509677 PRAG1Q86YV5 1406 aa26.2■■□□□ 1.78
SH3BP2-214ENST00000509677 ABCC11Q96J66 1382 aa26.2■■□□□ 1.78
SH3BP2-214ENST00000509677 LAMC1P11047 1609 aa26.19■■□□□ 1.78
SH3BP2-214ENST00000509677 C19orf44Q9H6X5 657 aa26.19■■□□□ 1.78
SH3BP2-214ENST00000509677 WAPLQ7Z5K2 1190 aa26.16■■□□□ 1.78
SH3BP2-214ENST00000509677 TECPR2O15040 1411 aa26.15■■□□□ 1.78
SH3BP2-214ENST00000509677 ATF3P18847 181 aa26.15■■□□□ 1.78
SH3BP2-214ENST00000509677 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.14■■□□□ 1.78
SH3BP2-214ENST00000509677 TRAK1Q9UPV9 953 aa26.14■■□□□ 1.78
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