RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507538.1

RASGEF1B-205, Transcript of RasGEF domain family member 1B, humanhuman

TSL 3

Gene RASGEF1B, Length 691 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1B-205ENST00000507538 HDGFP51858 240 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
RASGEF1B-205ENST00000507538 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP26.48■■□□□ 1.83
RASGEF1B-205ENST00000507538 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
RASGEF1B-205ENST00000507538 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
RASGEF1B-205ENST00000507538 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.46■■□□□ 1.83
RASGEF1B-205ENST00000507538 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa26.44■■□□□ 1.82
RASGEF1B-205ENST00000507538 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
RASGEF1B-205ENST00000507538 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
RASGEF1B-205ENST00000507538 KIF1BO60333 1816 aa26.42■■□□□ 1.82
RASGEF1B-205ENST00000507538 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.42■■□□□ 1.82
RASGEF1B-205ENST00000507538 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa26.4■■□□□ 1.82
RASGEF1B-205ENST00000507538 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.39■■□□□ 1.82
RASGEF1B-205ENST00000507538 BCANQ96GW7 911 aa26.38■■□□□ 1.81
RASGEF1B-205ENST00000507538 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa26.38■■□□□ 1.81
RASGEF1B-205ENST00000507538 SLC26A8Q96RN1 970 aa26.36■■□□□ 1.81
RASGEF1B-205ENST00000507538 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
RASGEF1B-205ENST00000507538 RGL3Q3MIN7 710 aa26.33■■□□□ 1.81
RASGEF1B-205ENST00000507538 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa26.32■■□□□ 1.8
RASGEF1B-205ENST00000507538 CERKQ8TCT0 537 aa26.32■■□□□ 1.8
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RASGEF1B-205ENST00000507538 CPS1P31327 1500 aa26.29■■□□□ 1.8
RASGEF1B-205ENST00000507538 TBX22Q9Y458 520 aa26.29■■□□□ 1.8
RASGEF1B-205ENST00000507538 DIP2AQ14689 1571 aa26.29■■□□□ 1.8
RASGEF1B-205ENST00000507538 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa26.26■■□□□ 1.79
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RASGEF1B-205ENST00000507538 KCNA6P17658 529 aa26.23■■□□□ 1.79
RASGEF1B-205ENST00000507538 NWD1Q149M9 1564 aa26.21■■□□□ 1.79
RASGEF1B-205ENST00000507538 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa26.21■■□□□ 1.79
RASGEF1B-205ENST00000507538 STRCP1A6NGW2 1772 aa26.21■■□□□ 1.79
RASGEF1B-205ENST00000507538 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.21■■□□□ 1.79
RASGEF1B-205ENST00000507538 PIK3R4Q99570 1358 aa26.2■■□□□ 1.79
RASGEF1B-205ENST00000507538 IFT172Q9UG01 1749 aa26.2■■□□□ 1.79
RASGEF1B-205ENST00000507538 MYOM2P54296 1465 aa26.19■■□□□ 1.78
RASGEF1B-205ENST00000507538 LRRC7Q96NW7 1537 aa26.18■■□□□ 1.78
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RASGEF1B-205ENST00000507538 METP08581 1390 aa26.17■■□□□ 1.78
RASGEF1B-205ENST00000507538 PIK3C2GO75747 1445 aa26.16■■□□□ 1.78
RASGEF1B-205ENST00000507538 NRXN1Q9ULB1 1477 aa26.16■■□□□ 1.78
RASGEF1B-205ENST00000507538 PTPRUQ92729 1446 aa26.14■■□□□ 1.78
RASGEF1B-205ENST00000507538 ALKQ9UM73 1620 aa26.14■■□□□ 1.78
RASGEF1B-205ENST00000507538 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.12■■□□□ 1.77
RASGEF1B-205ENST00000507538 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.11■■□□□ 1.77
RASGEF1B-205ENST00000507538 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa26.11■■□□□ 1.77
RASGEF1B-205ENST00000507538 TMEM94Q12767 1356 aa26.1■■□□□ 1.77
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RASGEF1B-205ENST00000507538 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
RASGEF1B-205ENST00000507538 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
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RASGEF1B-205ENST00000507538 STAC3Q96MF2 364 aa26.09■■□□□ 1.77
RASGEF1B-205ENST00000507538 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.08■■□□□ 1.77
RASGEF1B-205ENST00000507538 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.76
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RASGEF1B-205ENST00000507538 PTCH1Q13635 1447 aa26■■□□□ 1.75
RASGEF1B-205ENST00000507538 L3MBTL2Q969R5 705 aa26■■□□□ 1.75
RASGEF1B-205ENST00000507538 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.99■■□□□ 1.75
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RASGEF1B-205ENST00000507538 TECPR2O15040 1411 aa25.96■■□□□ 1.75
RASGEF1B-205ENST00000507538 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
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RASGEF1B-205ENST00000507538 WAPLQ7Z5K2 1190 aa25.83■■□□□ 1.73
RASGEF1B-205ENST00000507538 CADPS2Q86UW7 1296 aa25.83■■□□□ 1.73
RASGEF1B-205ENST00000507538 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa25.83■■□□□ 1.72
RASGEF1B-205ENST00000507538 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
RASGEF1B-205ENST00000507538 NALCNQ8IZF0 1738 aa25.81■■□□□ 1.72
RASGEF1B-205ENST00000507538 NBPF1Q3BBV0 1214 aa25.8■■□□□ 1.72
RASGEF1B-205ENST00000507538 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.8■■□□□ 1.72
RASGEF1B-205ENST00000507538 PRAM1Q96QH2 718 aa25.78■■□□□ 1.72
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