RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503051.1

USP46-AS1-201, USP46 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene USP46-AS1, Length 1,048 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZFYVE9O95405 1425 aa28.86■■■□□ 2.21
USP46-AS1-201ENST00000503051 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
USP46-AS1-201ENST00000503051 TOM1O60784 492 aa28.84■■■□□ 2.21
USP46-AS1-201ENST00000503051 HDGFP51858 240 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
USP46-AS1-201ENST00000503051 KIF1BO60333 1816 aa28.83■■■□□ 2.21
USP46-AS1-201ENST00000503051 TRIM52Q96A61 297 aa28.81■■■□□ 2.2
USP46-AS1-201ENST00000503051 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa28.8■■■□□ 2.2
USP46-AS1-201ENST00000503051 PIP4K2BP78356 416 aa28.8■■■□□ 2.2
USP46-AS1-201ENST00000503051 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.8■■■□□ 2.2
USP46-AS1-201ENST00000503051 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
USP46-AS1-201ENST00000503051 CLTCL1P53675 1640 aa28.79■■■□□ 2.2
USP46-AS1-201ENST00000503051 TRPM2O94759 1503 aa28.79■■■□□ 2.2
USP46-AS1-201ENST00000503051 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP28.78■■■□□ 2.2
USP46-AS1-201ENST00000503051 NWD1Q149M9 1564 aa28.78■■■□□ 2.2
USP46-AS1-201ENST00000503051 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
USP46-AS1-201ENST00000503051 DIP2AQ14689 1571 aa28.75■■■□□ 2.19
USP46-AS1-201ENST00000503051 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
USP46-AS1-201ENST00000503051 ALKQ9UM73 1620 aa28.72■■■□□ 2.19
USP46-AS1-201ENST00000503051 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
USP46-AS1-201ENST00000503051 KCNA6P17658 529 aa28.71■■■□□ 2.19
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
USP46-AS1-201ENST00000503051 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
USP46-AS1-201ENST00000503051 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.68■■■□□ 2.18
USP46-AS1-201ENST00000503051 TMEM94Q12767 1356 aa28.66■■■□□ 2.18
USP46-AS1-201ENST00000503051 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
USP46-AS1-201ENST00000503051 DISP3Q9P2K9 1392 aa28.62■■■□□ 2.17
USP46-AS1-201ENST00000503051 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa28.62■■■□□ 2.17
USP46-AS1-201ENST00000503051 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa28.62■■■□□ 2.17
USP46-AS1-201ENST00000503051 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa28.61■■■□□ 2.17
USP46-AS1-201ENST00000503051 HSPA1LP34931 641 aa28.61■■■□□ 2.17
USP46-AS1-201ENST00000503051 TBX22Q9Y458 520 aa28.61■■■□□ 2.17
USP46-AS1-201ENST00000503051 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa28.6■■■□□ 2.17
USP46-AS1-201ENST00000503051 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.6■■■□□ 2.17
USP46-AS1-201ENST00000503051 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
USP46-AS1-201ENST00000503051 MSH6P52701 1360 aa28.56■■■□□ 2.16
USP46-AS1-201ENST00000503051 PIK3R4Q99570 1358 aa28.56■■■□□ 2.16
USP46-AS1-201ENST00000503051 PPLO60437 1756 aa28.55■■■□□ 2.16
USP46-AS1-201ENST00000503051 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa28.52■■■□□ 2.16
USP46-AS1-201ENST00000503051 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
USP46-AS1-201ENST00000503051 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
USP46-AS1-201ENST00000503051 FOXD1Q16676 465 aa28.5■■■□□ 2.15
USP46-AS1-201ENST00000503051 C14orf37Q86TY3 774 aa28.5■■■□□ 2.15
USP46-AS1-201ENST00000503051 CCDC144AA2RUR9 1427 aa28.5■■■□□ 2.15
USP46-AS1-201ENST00000503051 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.48■■■□□ 2.15
USP46-AS1-201ENST00000503051 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
USP46-AS1-201ENST00000503051 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
USP46-AS1-201ENST00000503051 PTPRUQ92729 1446 aa28.45■■■□□ 2.15
USP46-AS1-201ENST00000503051 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa28.45■■■□□ 2.15
USP46-AS1-201ENST00000503051 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
USP46-AS1-201ENST00000503051 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa28.44■■■□□ 2.14
USP46-AS1-201ENST00000503051 FAM135BQ49AJ0 1406 aa28.43■■■□□ 2.14
USP46-AS1-201ENST00000503051 IFT172Q9UG01 1749 aa28.42■■■□□ 2.14
USP46-AS1-201ENST00000503051 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa28.42■■■□□ 2.14
USP46-AS1-201ENST00000503051 VGFO15240 615 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
USP46-AS1-201ENST00000503051 PHLPP1O60346 1717 aa28.4■■■□□ 2.14
USP46-AS1-201ENST00000503051 METP08581 1390 aa28.39■■■□□ 2.14
USP46-AS1-201ENST00000503051 HRCP23327 699 aa28.38■■■□□ 2.13
USP46-AS1-201ENST00000503051 ATF3P18847 181 aa28.34■■■□□ 2.13
USP46-AS1-201ENST00000503051 SLAIN2Q9P270 581 aa28.34■■■□□ 2.13
USP46-AS1-201ENST00000503051 NALCNQ8IZF0 1738 aa28.34■■■□□ 2.13
USP46-AS1-201ENST00000503051 CADPS2Q86UW7 1296 aa28.33■■■□□ 2.13
USP46-AS1-201ENST00000503051 C19orf44Q9H6X5 657 aa28.33■■■□□ 2.13
USP46-AS1-201ENST00000503051 RGL3Q3MIN7 710 aa28.32■■■□□ 2.12
USP46-AS1-201ENST00000503051 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa28.32■■■□□ 2.12
USP46-AS1-201ENST00000503051 DCCP43146 1447 aa28.3■■■□□ 2.12
USP46-AS1-201ENST00000503051 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.28■■■□□ 2.12
USP46-AS1-201ENST00000503051 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
USP46-AS1-201ENST00000503051 PTCH1Q13635 1447 aa28.26■■■□□ 2.12
USP46-AS1-201ENST00000503051 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa28.26■■■□□ 2.12
USP46-AS1-201ENST00000503051 ILDR2Q71H61 639 aa28.26■■■□□ 2.11
USP46-AS1-201ENST00000503051 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
USP46-AS1-201ENST00000503051 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa28.22■■■□□ 2.11
USP46-AS1-201ENST00000503051 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
USP46-AS1-201ENST00000503051 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
USP46-AS1-201ENST00000503051 LAMC1P11047 1609 aa28.2■■■□□ 2.1
USP46-AS1-201ENST00000503051 KNDC1Q76NI1 1749 aa28.2■■■□□ 2.1
USP46-AS1-201ENST00000503051 PRAG1Q86YV5 1406 aa28.18■■■□□ 2.1
USP46-AS1-201ENST00000503051 ROBO2Q9HCK4 1378 aa28.18■■■□□ 2.1
USP46-AS1-201ENST00000503051 PIK3C2GO75747 1445 aa28.18■■■□□ 2.1
USP46-AS1-201ENST00000503051 MST1RQ04912 1400 aa28.18■■■□□ 2.1
USP46-AS1-201ENST00000503051 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa28.17■■■□□ 2.1
USP46-AS1-201ENST00000503051 MYOM2P54296 1465 aa28.15■■■□□ 2.1
USP46-AS1-201ENST00000503051 NHSL1Q5SYE7 1610 aa28.15■■■□□ 2.1
USP46-AS1-201ENST00000503051 JCADQ9P266 1359 aa28.14■■■□□ 2.1
USP46-AS1-201ENST00000503051 SHPRHQ149N8 1683 aa28.13■■■□□ 2.09
USP46-AS1-201ENST00000503051 BRINP3Q76B58 766 aa28.12■■■□□ 2.09
USP46-AS1-201ENST00000503051 STK26Q9P289 416 aa28.08■■■□□ 2.09
USP46-AS1-201ENST00000503051 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
USP46-AS1-201ENST00000503051 NRXN1Q9ULB1 1477 aa28.08■■■□□ 2.09
USP46-AS1-201ENST00000503051 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa28.07■■■□□ 2.08
USP46-AS1-201ENST00000503051 TECPR2O15040 1411 aa28.07■■■□□ 2.08
USP46-AS1-201ENST00000503051 SOCS7O14512 581 aa28.05■■■□□ 2.08
USP46-AS1-201ENST00000503051 C1orf167Q5SNV9 1468 aa28.05■■■□□ 2.08
USP46-AS1-201ENST00000503051 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
USP46-AS1-201ENST00000503051 TMEM132EQ6IEE7 984 aa28.04■■■□□ 2.08
USP46-AS1-201ENST00000503051 ABCC11Q96J66 1382 aa28.01■■■□□ 2.07
USP46-AS1-201ENST00000503051 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa27.99■■■□□ 2.07
USP46-AS1-201ENST00000503051 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
USP46-AS1-201ENST00000503051 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
USP46-AS1-201ENST00000503051 FMN2Q9NZ56 1722 aa27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms