RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496187.5

CCZ1B-213, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, human

TSL 2

Gene CCZ1B, Length 631 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCZ1B-213	ENST00000496187	TOM1	O60784	492 aa		41.06	■■■■■ 4.16
CCZ1B-213	ENST00000496187	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		41.04	■■■■■ 4.16
CCZ1B-213	ENST00000496187	ZFYVE9	O95405	1425 aa		41.03	■■■■■ 4.16
CCZ1B-213	ENST00000496187	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		40.99	■■■■■ 4.15
CCZ1B-213	ENST00000496187	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		40.99	■■■■■ 4.15
CCZ1B-213	ENST00000496187	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		40.99	■■■■■ 4.15
CCZ1B-213	ENST00000496187	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	40.95	■■■■■ 4.15
CCZ1B-213	ENST00000496187	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	40.93	■■■■■ 4.14
CCZ1B-213	ENST00000496187	KCNA6	P17658	529 aa		40.92	■■■■■ 4.14
CCZ1B-213	ENST00000496187	TRPM2	O94759	1503 aa		40.92	■■■■■ 4.14
CCZ1B-213	ENST00000496187	PIP4K2B	P78356	416 aa		40.89	■■■■■ 4.14
CCZ1B-213	ENST00000496187	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	40.89	■■■■■ 4.14
CCZ1B-213	ENST00000496187	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	40.87	■■■■■ 4.13
CCZ1B-213	ENST00000496187	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	40.85	■■■■■ 4.13
CCZ1B-213	ENST00000496187	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	40.84	■■■■■ 4.13
CCZ1B-213	ENST00000496187	CLTCL1	P53675	1640 aa		40.82	■■■■■ 4.13
CCZ1B-213	ENST00000496187	KIF1B	O60333	1816 aa		40.82	■■■■■ 4.13
CCZ1B-213	ENST00000496187	TBX22	Q9Y458	520 aa		40.81	■■■■■ 4.12
CCZ1B-213	ENST00000496187	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	40.81	■■■■■ 4.12
CCZ1B-213	ENST00000496187	DIP2A	Q14689	1571 aa		40.81	■■■■■ 4.12
CCZ1B-213	ENST00000496187	NWD1	Q149M9	1564 aa		40.8	■■■■■ 4.12
CCZ1B-213	ENST00000496187	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	40.8	■■■■■ 4.12
CCZ1B-213	ENST00000496187	TMEM94	Q12767	1356 aa		40.74	■■■■■ 4.11
CCZ1B-213	ENST00000496187	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	40.74	■■■■■ 4.11
CCZ1B-213	ENST00000496187	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	40.73	■■■■■ 4.11
CCZ1B-213	ENST00000496187	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		40.72	■■■■■ 4.11
CCZ1B-213	ENST00000496187	PIK3R4	Q99570	1358 aa		40.72	■■■■■ 4.11
CCZ1B-213	ENST00000496187	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		40.71	■■■■■ 4.11
CCZ1B-213	ENST00000496187	ALK	Q9UM73	1620 aa		40.67	■■■■■ 4.1
CCZ1B-213	ENST00000496187	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		40.67	■■■■■ 4.1
CCZ1B-213	ENST00000496187	HSPA1L	P34931	641 aa		40.63	■■■■■ 4.09
CCZ1B-213	ENST00000496187	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		40.63	■■■■■ 4.09
CCZ1B-213	ENST00000496187	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		40.62	■■■■■ 4.09
CCZ1B-213	ENST00000496187	MSH6	P52701	1360 aa		40.62	■■■■■ 4.09
CCZ1B-213	ENST00000496187	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		40.6	■■■■■ 4.09
CCZ1B-213	ENST00000496187	FOXD1	Q16676	465 aa		40.59	■■■■■ 4.09
CCZ1B-213	ENST00000496187	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		40.59	■■■■■ 4.09
CCZ1B-213	ENST00000496187	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	40.58	■■■■■ 4.09
CCZ1B-213	ENST00000496187	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	40.58	■■■■■ 4.09
CCZ1B-213	ENST00000496187	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		40.56	■■■■■ 4.08
CCZ1B-213	ENST00000496187	C14orf37	Q86TY3	774 aa		40.55	■■■■■ 4.08
CCZ1B-213	ENST00000496187	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		40.55	■■■■■ 4.08
CCZ1B-213	ENST00000496187	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		40.54	■■■■■ 4.08
CCZ1B-213	ENST00000496187	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		40.53	■■■■■ 4.08
CCZ1B-213	ENST00000496187	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		40.52	■■■■■ 4.08
CCZ1B-213	ENST00000496187	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		40.46	■■■■■ 4.07
CCZ1B-213	ENST00000496187	PPL	O60437	1756 aa		40.44	■■■■■ 4.06
CCZ1B-213	ENST00000496187	PTPRU	Q92729	1446 aa		40.43	■■■■■ 4.06
CCZ1B-213	ENST00000496187	MET	P08581	1390 aa		40.41	■■■■■ 4.06
CCZ1B-213	ENST00000496187	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	40.4	■■■■■ 4.06
CCZ1B-213	ENST00000496187	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		40.39	■■■■■ 4.06
CCZ1B-213	ENST00000496187	SLAIN2	Q9P270	581 aa		40.38	■■■■■ 4.05
CCZ1B-213	ENST00000496187	ATF3	P18847	181 aa		40.37	■■■■■ 4.05
CCZ1B-213	ENST00000496187	RGL3	Q3MIN7	710 aa		40.37	■■■■■ 4.05
CCZ1B-213	ENST00000496187	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		40.37	■■■■■ 4.05
CCZ1B-213	ENST00000496187	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		40.37	■■■■■ 4.05
CCZ1B-213	ENST00000496187	HRC	P23327	699 aa		40.34	■■■■■ 4.05
CCZ1B-213	ENST00000496187	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		40.34	■■■■■ 4.05
CCZ1B-213	ENST00000496187	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		40.33	■■■■■ 4.05
CCZ1B-213	ENST00000496187	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	40.31	■■■■■ 4.04
CCZ1B-213	ENST00000496187	DCC	P43146	1447 aa		40.26	■■■■■ 4.04
CCZ1B-213	ENST00000496187	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	40.25	■■■■■ 4.03
CCZ1B-213	ENST00000496187	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	40.25	■■■■■ 4.03
CCZ1B-213	ENST00000496187	IFT172	Q9UG01	1749 aa		40.24	■■■■■ 4.03
CCZ1B-213	ENST00000496187	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		40.2	■■■■■ 4.03
CCZ1B-213	ENST00000496187	PTCH1	Q13635	1447 aa		40.2	■■■■■ 4.03
CCZ1B-213	ENST00000496187	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		40.16	■■■■■ 4.02
CCZ1B-213	ENST00000496187	PHLPP1	O60346	1717 aa		40.16	■■■■■ 4.02
CCZ1B-213	ENST00000496187	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	40.14	■■■■■ 4.02
CCZ1B-213	ENST00000496187	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		40.13	■■■■■ 4.01
CCZ1B-213	ENST00000496187	PIK3C2G	O75747	1445 aa		40.1	■■■■■ 4.01
CCZ1B-213	ENST00000496187	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		40.09	■■■■■ 4.01
CCZ1B-213	ENST00000496187	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		40.08	■■■■■ 4.01
CCZ1B-213	ENST00000496187	MYOM2	P54296	1465 aa		40.07	■■■■■ 4
CCZ1B-213	ENST00000496187	MST1R	Q04912	1400 aa		40.03	■■■■■ 4
CCZ1B-213	ENST00000496187	ILDR2	Q71H61	639 aa		40.02	■■■■■ 4
CCZ1B-213	ENST00000496187	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	40.02	■■■■■ 4
CCZ1B-213	ENST00000496187	BRINP3	Q76B58	766 aa		40.01	■■■■■ 4
CCZ1B-213	ENST00000496187	LAMC1	P11047	1609 aa		40.01	■■■■■ 4
CCZ1B-213	ENST00000496187	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	40	■■■■□ 3.99
CCZ1B-213	ENST00000496187	JCAD	Q9P266	1359 aa		40	■■■■□ 3.99
CCZ1B-213	ENST00000496187	STK26	Q9P289	416 aa		40	■■■■□ 3.99
CCZ1B-213	ENST00000496187	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		39.98	■■■■□ 3.99
CCZ1B-213	ENST00000496187	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		39.97	■■■■□ 3.99
CCZ1B-213	ENST00000496187	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	39.97	■■■■□ 3.99
CCZ1B-213	ENST00000496187	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	39.96	■■■■□ 3.99
CCZ1B-213	ENST00000496187	TECPR2	O15040	1411 aa		39.96	■■■■□ 3.99
CCZ1B-213	ENST00000496187	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		39.95	■■■■□ 3.99
CCZ1B-213	ENST00000496187	ABCC11	Q96J66	1382 aa		39.95	■■■■□ 3.99
CCZ1B-213	ENST00000496187	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		39.94	■■■■□ 3.98
CCZ1B-213	ENST00000496187	STAC3	Q96MF2	364 aa		39.94	■■■■□ 3.98
CCZ1B-213	ENST00000496187	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	39.91	■■■■□ 3.98
CCZ1B-213	ENST00000496187	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	39.91	■■■■□ 3.98
CCZ1B-213	ENST00000496187	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		39.88	■■■■□ 3.98
CCZ1B-213	ENST00000496187	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		39.88	■■■■□ 3.97
CCZ1B-213	ENST00000496187	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		39.88	■■■■□ 3.97
CCZ1B-213	ENST00000496187	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		39.86	■■■■□ 3.97
CCZ1B-213	ENST00000496187	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		39.85	■■■■□ 3.97
CCZ1B-213	ENST00000496187	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		39.84	■■■■□ 3.97
CCZ1B-213	ENST00000496187	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		39.84	■■■■□ 3.97

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