RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495220.5

ARRDC1-211, Transcript of arrestin domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene ARRDC1, Length 747 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC1-211ENST00000495220 MYO5BQ9ULV0 1848 aa29.48■■■□□ 2.31
ARRDC1-211ENST00000495220 ANKLE2Q86XL3 938 aa29.46■■■□□ 2.31
ARRDC1-211ENST00000495220 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa29.45■■■□□ 2.31
ARRDC1-211ENST00000495220 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
ARRDC1-211ENST00000495220 EID1Q9Y6B2 187 aa29.44■■■□□ 2.3
ARRDC1-211ENST00000495220 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP29.43■■■□□ 2.3
ARRDC1-211ENST00000495220 ZFYVE9O95405 1425 aa29.42■■■□□ 2.3
ARRDC1-211ENST00000495220 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
ARRDC1-211ENST00000495220 TXNDC2Q86VQ3 553 aa29.41■■■□□ 2.3
ARRDC1-211ENST00000495220 RIMS2Q9UQ26 1411 aa29.41■■■□□ 2.3
ARRDC1-211ENST00000495220 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
ARRDC1-211ENST00000495220 SIN3AQ96ST3 1273 aa29.4■■■□□ 2.3
ARRDC1-211ENST00000495220 RGL3Q3MIN7 710 aa29.39■■■□□ 2.3
ARRDC1-211ENST00000495220 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
ARRDC1-211ENST00000495220 LTKP29376 864 aa29.38■■■□□ 2.29
ARRDC1-211ENST00000495220 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa29.35■■■□□ 2.29
ARRDC1-211ENST00000495220 STAC3Q96MF2 364 aa29.35■■■□□ 2.29
ARRDC1-211ENST00000495220 MED14O60244 1454 aa29.35■■■□□ 2.29
ARRDC1-211ENST00000495220 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
ARRDC1-211ENST00000495220 VGFO15240 615 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
ARRDC1-211ENST00000495220 NEUROD1Q13562 356 aa29.34■■■□□ 2.29
ARRDC1-211ENST00000495220 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
ARRDC1-211ENST00000495220 PPLO60437 1756 aa29.31■■■□□ 2.28
ARRDC1-211ENST00000495220 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa29.29■■■□□ 2.28
ARRDC1-211ENST00000495220 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
ARRDC1-211ENST00000495220 IFT172Q9UG01 1749 aa29.28■■■□□ 2.28
ARRDC1-211ENST00000495220 UBAP1LF5GYI3 381 aa29.27■■■□□ 2.28
ARRDC1-211ENST00000495220 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
ARRDC1-211ENST00000495220 DCAF11Q8TEB1 546 aa29.25■■■□□ 2.27
ARRDC1-211ENST00000495220 MYOM2P54296 1465 aa29.24■■■□□ 2.27
ARRDC1-211ENST00000495220 IQGAP1P46940 1657 aa29.23■■■□□ 2.27
ARRDC1-211ENST00000495220 L3MBTL2Q969R5 705 aa29.22■■■□□ 2.27
ARRDC1-211ENST00000495220 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa29.22■■■□□ 2.27
ARRDC1-211ENST00000495220 TONSLQ96HA7 1378 aa29.21■■■□□ 2.27
ARRDC1-211ENST00000495220 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa29.2■■■□□ 2.26
ARRDC1-211ENST00000495220 NRXN1Q9ULB1 1477 aa29.19■■■□□ 2.26
ARRDC1-211ENST00000495220 BCANQ96GW7 911 aa29.19■■■□□ 2.26
ARRDC1-211ENST00000495220 CPS1P31327 1500 aa29.19■■■□□ 2.26
ARRDC1-211ENST00000495220 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa29.18■■■□□ 2.26
ARRDC1-211ENST00000495220 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa29.18■■■□□ 2.26
ARRDC1-211ENST00000495220 DISP3Q9P2K9 1392 aa29.17■■■□□ 2.26
ARRDC1-211ENST00000495220 TBX22Q9Y458 520 aa29.17■■■□□ 2.26
ARRDC1-211ENST00000495220 PIK3C2GO75747 1445 aa29.14■■■□□ 2.26
ARRDC1-211ENST00000495220 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa29.14■■■□□ 2.26
ARRDC1-211ENST00000495220 SLC26A8Q96RN1 970 aa29.13■■■□□ 2.25
ARRDC1-211ENST00000495220 DIP2AQ14689 1571 aa29.13■■■□□ 2.25
ARRDC1-211ENST00000495220 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa29.12■■■□□ 2.25
ARRDC1-211ENST00000495220 TOM1O60784 492 aa29.12■■■□□ 2.25
ARRDC1-211ENST00000495220 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
ARRDC1-211ENST00000495220 PIK3R4Q99570 1358 aa29.08■■■□□ 2.25
ARRDC1-211ENST00000495220 ALKQ9UM73 1620 aa29.08■■■□□ 2.25
ARRDC1-211ENST00000495220 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
ARRDC1-211ENST00000495220 PRAG1Q86YV5 1406 aa29.06■■■□□ 2.24
ARRDC1-211ENST00000495220 LAMC1P11047 1609 aa29.04■■■□□ 2.24
ARRDC1-211ENST00000495220 CFAP70Q5T0N1 1121 aa29.02■■■□□ 2.24
ARRDC1-211ENST00000495220 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
ARRDC1-211ENST00000495220 KCNA6P17658 529 aa29■■■□□ 2.23
ARRDC1-211ENST00000495220 METP08581 1390 aa29■■■□□ 2.23
ARRDC1-211ENST00000495220 PIP4K2BP78356 416 aa28.99■■■□□ 2.23
ARRDC1-211ENST00000495220 ILDR2Q71H61 639 aa28.99■■■□□ 2.23
ARRDC1-211ENST00000495220 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa28.99■■■□□ 2.23
ARRDC1-211ENST00000495220 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
ARRDC1-211ENST00000495220 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
ARRDC1-211ENST00000495220 NBPF8Q3BBV2 869 aa28.95■■■□□ 2.22
ARRDC1-211ENST00000495220 HSPA1LP34931 641 aa28.94■■■□□ 2.22
ARRDC1-211ENST00000495220 NWD1Q149M9 1564 aa28.93■■■□□ 2.22
ARRDC1-211ENST00000495220 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa28.93■■■□□ 2.22
ARRDC1-211ENST00000495220 PTPRUQ92729 1446 aa28.93■■■□□ 2.22
ARRDC1-211ENST00000495220 LRRC7Q96NW7 1537 aa28.92■■■□□ 2.22
ARRDC1-211ENST00000495220 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa28.91■■■□□ 2.22
ARRDC1-211ENST00000495220 TMEM132EQ6IEE7 984 aa28.91■■■□□ 2.22
ARRDC1-211ENST00000495220 ADGRB1O14514 1584 aa28.91■■■□□ 2.22
ARRDC1-211ENST00000495220 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa28.9■■■□□ 2.22
ARRDC1-211ENST00000495220 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
ARRDC1-211ENST00000495220 SOCS7O14512 581 aa28.89■■■□□ 2.22
ARRDC1-211ENST00000495220 ABCC11Q96J66 1382 aa28.88■■■□□ 2.21
ARRDC1-211ENST00000495220 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
ARRDC1-211ENST00000495220 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.88■■■□□ 2.21
ARRDC1-211ENST00000495220 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
ARRDC1-211ENST00000495220 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
ARRDC1-211ENST00000495220 NBPF1Q3BBV0 1214 aa28.87■■■□□ 2.21
ARRDC1-211ENST00000495220 TECPR2O15040 1411 aa28.86■■■□□ 2.21
ARRDC1-211ENST00000495220 RALGAPBQ86X10 1494 aa28.85■■■□□ 2.21
ARRDC1-211ENST00000495220 SIRT1Q96EB6 747 aa28.84■■■□□ 2.21
ARRDC1-211ENST00000495220 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
ARRDC1-211ENST00000495220 GPRASP1Q5JY77 1395 aa28.83■■■□□ 2.21
ARRDC1-211ENST00000495220 STK26Q9P289 416 aa28.82■■■□□ 2.2
ARRDC1-211ENST00000495220 PTCH1Q13635 1447 aa28.82■■■□□ 2.2
ARRDC1-211ENST00000495220 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
ARRDC1-211ENST00000495220 KNDC1Q76NI1 1749 aa28.8■■■□□ 2.2
ARRDC1-211ENST00000495220 DLC1Q96QB1 1528 aa28.79■■■□□ 2.2
ARRDC1-211ENST00000495220 FAM135BQ49AJ0 1406 aa28.78■■■□□ 2.2
ARRDC1-211ENST00000495220 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa28.78■■■□□ 2.2
ARRDC1-211ENST00000495220 ROBO2Q9HCK4 1378 aa28.76■■■□□ 2.2
ARRDC1-211ENST00000495220 TRAK1Q9UPV9 953 aa28.76■■■□□ 2.19
ARRDC1-211ENST00000495220 CARD11Q9BXL7 1154 aa28.75■■■□□ 2.19
ARRDC1-211ENST00000495220 TMEM94Q12767 1356 aa28.74■■■□□ 2.19
ARRDC1-211ENST00000495220 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
ARRDC1-211ENST00000495220 WAPLQ7Z5K2 1190 aa28.69■■■□□ 2.18
ARRDC1-211ENST00000495220 PRAM1Q96QH2 718 aa28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.2 ms