RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495040.1

PLXNA3-208, Transcript of plexin A3, humanhuman

TSL 5

Gene PLXNA3, Length 421 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA3-208ENST00000495040 NAIPQ13075 1403 aa40.33■■■■■ 4.05
PLXNA3-208ENST00000495040 BCANQ96GW7 911 aa40.31■■■■■ 4.04
PLXNA3-208ENST00000495040 ALKQ9UM73 1620 aa40.3■■■■■ 4.04
PLXNA3-208ENST00000495040 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP40.29■■■■■ 4.04
PLXNA3-208ENST00000495040 KCNA6P17658 529 aa40.29■■■■■ 4.04
PLXNA3-208ENST00000495040 DISP3Q9P2K9 1392 aa40.28■■■■■ 4.04
PLXNA3-208ENST00000495040 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa40.28■■■■■ 4.04
PLXNA3-208ENST00000495040 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP40.27■■■■■ 4.04
PLXNA3-208ENST00000495040 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP40.26■■■■■ 4.03
PLXNA3-208ENST00000495040 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa40.23■■■■■ 4.03
PLXNA3-208ENST00000495040 HSPA1LP34931 641 aa40.23■■■■■ 4.03
PLXNA3-208ENST00000495040 HFM1A2PYH4 1435 aa40.22■■■■■ 4.03
PLXNA3-208ENST00000495040 NWD1Q149M9 1564 aa40.18■■■■■ 4.02
PLXNA3-208ENST00000495040 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP40.17■■■■■ 4.02
PLXNA3-208ENST00000495040 TMEM94Q12767 1356 aa40.16■■■■■ 4.02
PLXNA3-208ENST00000495040 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP40.15■■■■■ 4.02
PLXNA3-208ENST00000495040 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP40.15■■■■■ 4.02
PLXNA3-208ENST00000495040 TBX22Q9Y458 520 aa40.14■■■■■ 4.02
PLXNA3-208ENST00000495040 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP40.12■■■■■ 4.01
PLXNA3-208ENST00000495040 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP40.12■■■■■ 4.01
PLXNA3-208ENST00000495040 TRIM52Q96A61 297 aa40.1■■■■■ 4.01
PLXNA3-208ENST00000495040 DIP2AQ14689 1571 aa40.06■■■■■ 4
PLXNA3-208ENST00000495040 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa40.06■■■■■ 4
PLXNA3-208ENST00000495040 TRPM2O94759 1503 aa40.06■■■■■ 4
PLXNA3-208ENST00000495040 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP40.02■■■■■ 4
PLXNA3-208ENST00000495040 CLTCL1P53675 1640 aa40.02■■■■■ 4
PLXNA3-208ENST00000495040 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP40.01■■■■■ 4
PLXNA3-208ENST00000495040 PIK3R4Q99570 1358 aa40■■■■□ 3.99
PLXNA3-208ENST00000495040 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP39.98■■■■□ 3.99
PLXNA3-208ENST00000495040 KIF1BO60333 1816 aa39.97■■■■□ 3.99
PLXNA3-208ENST00000495040 MSH6P52701 1360 aa39.96■■■■□ 3.99
PLXNA3-208ENST00000495040 FAM135BQ49AJ0 1406 aa39.95■■■■□ 3.99
PLXNA3-208ENST00000495040 ILDR2Q71H61 639 aa39.95■■■■□ 3.99
PLXNA3-208ENST00000495040 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa39.91■■■■□ 3.98
PLXNA3-208ENST00000495040 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa39.89■■■■□ 3.98
PLXNA3-208ENST00000495040 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP39.89■■■■□ 3.98
PLXNA3-208ENST00000495040 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa39.87■■■■□ 3.97
PLXNA3-208ENST00000495040 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa39.87■■■■□ 3.97
PLXNA3-208ENST00000495040 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa39.84■■■■□ 3.97
PLXNA3-208ENST00000495040 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa39.83■■■■□ 3.97
PLXNA3-208ENST00000495040 PTPRUQ92729 1446 aa39.82■■■■□ 3.96
PLXNA3-208ENST00000495040 C14orf37Q86TY3 774 aa39.8■■■■□ 3.96
PLXNA3-208ENST00000495040 SLAIN2Q9P270 581 aa39.8■■■■□ 3.96
PLXNA3-208ENST00000495040 C19orf44Q9H6X5 657 aa39.75■■■■□ 3.95
PLXNA3-208ENST00000495040 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa39.74■■■■□ 3.95
PLXNA3-208ENST00000495040 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP39.74■■■■□ 3.95
PLXNA3-208ENST00000495040 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP39.74■■■■□ 3.95
PLXNA3-208ENST00000495040 VGFO15240 615 aaPredicted RBP39.73■■■■□ 3.95
PLXNA3-208ENST00000495040 FOXD1Q16676 465 aa39.73■■■■□ 3.95
PLXNA3-208ENST00000495040 MPHOSPH9Q99550 1183 aa39.73■■■■□ 3.95
PLXNA3-208ENST00000495040 METP08581 1390 aa39.72■■■■□ 3.95
PLXNA3-208ENST00000495040 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP39.71■■■■□ 3.95
PLXNA3-208ENST00000495040 CADPS2Q86UW7 1296 aa39.7■■■■□ 3.95
PLXNA3-208ENST00000495040 SOCS7O14512 581 aa39.68■■■■□ 3.94
PLXNA3-208ENST00000495040 ATF3P18847 181 aa39.68■■■■□ 3.94
PLXNA3-208ENST00000495040 SETD5Q9C0A6 1442 aa39.67■■■■□ 3.94
PLXNA3-208ENST00000495040 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP39.66■■■■□ 3.94
PLXNA3-208ENST00000495040 CCDC144AA2RUR9 1427 aa39.65■■■■□ 3.94
PLXNA3-208ENST00000495040 PPLO60437 1756 aa39.64■■■■□ 3.94
PLXNA3-208ENST00000495040 PHLPP1O60346 1717 aa39.6■■■■□ 3.93
PLXNA3-208ENST00000495040 DCCP43146 1447 aa39.59■■■■□ 3.93
PLXNA3-208ENST00000495040 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP39.57■■■■□ 3.92
PLXNA3-208ENST00000495040 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa39.52■■■■□ 3.92
PLXNA3-208ENST00000495040 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa39.5■■■■□ 3.91
PLXNA3-208ENST00000495040 RGL3Q3MIN7 710 aa39.5■■■■□ 3.91
PLXNA3-208ENST00000495040 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa39.48■■■■□ 3.91
PLXNA3-208ENST00000495040 PTCH1Q13635 1447 aa39.48■■■■□ 3.91
PLXNA3-208ENST00000495040 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP39.47■■■■□ 3.91
PLXNA3-208ENST00000495040 JCADQ9P266 1359 aa39.46■■■■□ 3.91
PLXNA3-208ENST00000495040 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa39.46■■■■□ 3.91
PLXNA3-208ENST00000495040 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP39.45■■■■□ 3.91
PLXNA3-208ENST00000495040 IFT172Q9UG01 1749 aa39.44■■■■□ 3.9
PLXNA3-208ENST00000495040 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa39.43■■■■□ 3.9
PLXNA3-208ENST00000495040 PRAG1Q86YV5 1406 aa39.43■■■■□ 3.9
PLXNA3-208ENST00000495040 BRINP3Q76B58 766 aa39.43■■■■□ 3.9
PLXNA3-208ENST00000495040 NALCNQ8IZF0 1738 aa39.43■■■■□ 3.9
PLXNA3-208ENST00000495040 MST1RQ04912 1400 aa39.42■■■■□ 3.9
PLXNA3-208ENST00000495040 ROBO2Q9HCK4 1378 aa39.4■■■■□ 3.9
PLXNA3-208ENST00000495040 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP39.36■■■■□ 3.89
PLXNA3-208ENST00000495040 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa39.35■■■■□ 3.89
PLXNA3-208ENST00000495040 HRCP23327 699 aa39.29■■■■□ 3.88
PLXNA3-208ENST00000495040 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa39.29■■■■□ 3.88
PLXNA3-208ENST00000495040 PIK3C2GO75747 1445 aa39.29■■■■□ 3.88
PLXNA3-208ENST00000495040 SHPRHQ149N8 1683 aa39.27■■■■□ 3.88
PLXNA3-208ENST00000495040 NHSL1Q5SYE7 1610 aa39.27■■■■□ 3.88
PLXNA3-208ENST00000495040 C1orf167Q5SNV9 1468 aa39.25■■■■□ 3.87
PLXNA3-208ENST00000495040 TECPR2O15040 1411 aa39.23■■■■□ 3.87
PLXNA3-208ENST00000495040 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP39.22■■■■□ 3.87
PLXNA3-208ENST00000495040 STK26Q9P289 416 aa39.21■■■■□ 3.87
PLXNA3-208ENST00000495040 MYOM2P54296 1465 aa39.19■■■■□ 3.86
PLXNA3-208ENST00000495040 TMEM132EQ6IEE7 984 aa39.19■■■■□ 3.86
PLXNA3-208ENST00000495040 ABCC11Q96J66 1382 aa39.19■■■■□ 3.86
PLXNA3-208ENST00000495040 NRXN1Q9ULB1 1477 aa39.17■■■■□ 3.86
PLXNA3-208ENST00000495040 KNDC1Q76NI1 1749 aa39.17■■■■□ 3.86
PLXNA3-208ENST00000495040 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP39.17■■■■□ 3.86
PLXNA3-208ENST00000495040 LRP6O75581 1613 aa39.16■■■■□ 3.86
PLXNA3-208ENST00000495040 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP39.16■■■■□ 3.86
PLXNA3-208ENST00000495040 POTEAQ6S8J7 498 aa39.15■■■■□ 3.86
PLXNA3-208ENST00000495040 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa39.14■■■■□ 3.86
PLXNA3-208ENST00000495040 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP39.14■■■■□ 3.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 149.2 ms