RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493959.6

SENP6-211, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 3

Gene SENP6, Length 867 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-211ENST00000493959 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP34.26■■■■□ 3.08
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SENP6-211ENST00000493959 RIMS2Q9UQ26 1411 aa34.25■■■■□ 3.07
SENP6-211ENST00000493959 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP34.2■■■■□ 3.07
SENP6-211ENST00000493959 TRIM52Q96A61 297 aa34.2■■■■□ 3.07
SENP6-211ENST00000493959 KCNA6P17658 529 aa34.19■■■■□ 3.06
SENP6-211ENST00000493959 HDGFP51858 240 aaKnown RBP34.19■■■■□ 3.06
SENP6-211ENST00000493959 ALKQ9UM73 1620 aa34.18■■■■□ 3.06
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SENP6-211ENST00000493959 C19orf44Q9H6X5 657 aa33.72■■■□□ 2.99
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SENP6-211ENST00000493959 TMEM132EQ6IEE7 984 aa33.45■■■□□ 2.95
SENP6-211ENST00000493959 STK26Q9P289 416 aa33.45■■■□□ 2.95
SENP6-211ENST00000493959 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP33.45■■■□□ 2.95
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SENP6-211ENST00000493959 NRXN1Q9ULB1 1477 aa33.25■■■□□ 2.91
SENP6-211ENST00000493959 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP33.24■■■□□ 2.91
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SENP6-211ENST00000493959 DCAF11Q8TEB1 546 aa33.23■■■□□ 2.91
SENP6-211ENST00000493959 MYOM2P54296 1465 aa33.22■■■□□ 2.91
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