RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491842.1

MEGF6-206, Transcript of multiple EGF like domains 6, humanhuman

TSL 5

Gene MEGF6, Length 743 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEGF6-206ENST00000491842 IQGAP1P46940 1657 aa28.3■■■□□ 2.12
MEGF6-206ENST00000491842 RIMS2Q9UQ26 1411 aa28.3■■■□□ 2.12
MEGF6-206ENST00000491842 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
MEGF6-206ENST00000491842 CERKQ8TCT0 537 aa28.28■■■□□ 2.12
MEGF6-206ENST00000491842 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
MEGF6-206ENST00000491842 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
MEGF6-206ENST00000491842 KIF1BO60333 1816 aa28.26■■■□□ 2.11
MEGF6-206ENST00000491842 CLTCL1P53675 1640 aa28.25■■■□□ 2.11
MEGF6-206ENST00000491842 CCDC144AA2RUR9 1427 aa28.25■■■□□ 2.11
MEGF6-206ENST00000491842 ZFYVE9O95405 1425 aa28.2■■■□□ 2.11
MEGF6-206ENST00000491842 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.2■■■□□ 2.1
MEGF6-206ENST00000491842 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa28.17■■■□□ 2.1
MEGF6-206ENST00000491842 RGL3Q3MIN7 710 aa28.16■■■□□ 2.1
MEGF6-206ENST00000491842 LTBP4Q8N2S1 1624 aa28.14■■■□□ 2.1
MEGF6-206ENST00000491842 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa28.13■■■□□ 2.09
MEGF6-206ENST00000491842 VGFO15240 615 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
MEGF6-206ENST00000491842 CPS1P31327 1500 aa28.1■■■□□ 2.09
MEGF6-206ENST00000491842 FBXO41Q8TF61 875 aa28.1■■■□□ 2.09
MEGF6-206ENST00000491842 TBX22Q9Y458 520 aa28.08■■■□□ 2.09
MEGF6-206ENST00000491842 KCNA6P17658 529 aa28.06■■■□□ 2.08
MEGF6-206ENST00000491842 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa28.04■■■□□ 2.08
MEGF6-206ENST00000491842 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.04■■■□□ 2.08
MEGF6-206ENST00000491842 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.02■■■□□ 2.08
MEGF6-206ENST00000491842 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
MEGF6-206ENST00000491842 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
MEGF6-206ENST00000491842 DIP2AQ14689 1571 aa27.99■■■□□ 2.07
MEGF6-206ENST00000491842 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa27.99■■■□□ 2.07
MEGF6-206ENST00000491842 UBAP1LF5GYI3 381 aa27.98■■■□□ 2.07
MEGF6-206ENST00000491842 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa27.98■■■□□ 2.07
MEGF6-206ENST00000491842 STRCP1A6NGW2 1772 aa27.96■■■□□ 2.07
MEGF6-206ENST00000491842 PIK3R4Q99570 1358 aa27.96■■■□□ 2.07
MEGF6-206ENST00000491842 PPLO60437 1756 aa27.96■■■□□ 2.07
MEGF6-206ENST00000491842 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa27.94■■■□□ 2.06
MEGF6-206ENST00000491842 LRRC7Q96NW7 1537 aa27.93■■■□□ 2.06
MEGF6-206ENST00000491842 TOM1O60784 492 aa27.93■■■□□ 2.06
MEGF6-206ENST00000491842 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa27.92■■■□□ 2.06
MEGF6-206ENST00000491842 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
MEGF6-206ENST00000491842 C14orf37Q86TY3 774 aa27.91■■■□□ 2.06
MEGF6-206ENST00000491842 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa27.91■■■□□ 2.06
MEGF6-206ENST00000491842 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
MEGF6-206ENST00000491842 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.9■■■□□ 2.06
MEGF6-206ENST00000491842 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa27.89■■■□□ 2.06
MEGF6-206ENST00000491842 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.05
MEGF6-206ENST00000491842 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
MEGF6-206ENST00000491842 TMEM94Q12767 1356 aa27.87■■■□□ 2.05
MEGF6-206ENST00000491842 DCAF11Q8TEB1 546 aa27.87■■■□□ 2.05
MEGF6-206ENST00000491842 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa27.87■■■□□ 2.05
MEGF6-206ENST00000491842 NWD1Q149M9 1564 aa27.86■■■□□ 2.05
MEGF6-206ENST00000491842 METP08581 1390 aa27.86■■■□□ 2.05
MEGF6-206ENST00000491842 PIP4K2BP78356 416 aa27.84■■■□□ 2.05
MEGF6-206ENST00000491842 IFT172Q9UG01 1749 aa27.84■■■□□ 2.05
MEGF6-206ENST00000491842 ALKQ9UM73 1620 aa27.83■■■□□ 2.05
MEGF6-206ENST00000491842 NEUROD1Q13562 356 aa27.82■■■□□ 2.04
MEGF6-206ENST00000491842 STAC3Q96MF2 364 aa27.82■■■□□ 2.04
MEGF6-206ENST00000491842 MSH6P52701 1360 aa27.81■■■□□ 2.04
MEGF6-206ENST00000491842 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
MEGF6-206ENST00000491842 PTPRUQ92729 1446 aa27.8■■■□□ 2.04
MEGF6-206ENST00000491842 MYOM2P54296 1465 aa27.77■■■□□ 2.04
MEGF6-206ENST00000491842 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.77■■■□□ 2.04
MEGF6-206ENST00000491842 STK26Q9P289 416 aa27.76■■■□□ 2.03
MEGF6-206ENST00000491842 PIK3C2GO75747 1445 aa27.75■■■□□ 2.03
MEGF6-206ENST00000491842 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
MEGF6-206ENST00000491842 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
MEGF6-206ENST00000491842 CFAP70Q5T0N1 1121 aa27.74■■■□□ 2.03
MEGF6-206ENST00000491842 TMEM132EQ6IEE7 984 aa27.74■■■□□ 2.03
MEGF6-206ENST00000491842 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa27.74■■■□□ 2.03
MEGF6-206ENST00000491842 ATF3P18847 181 aa27.73■■■□□ 2.03
MEGF6-206ENST00000491842 C19orf44Q9H6X5 657 aa27.72■■■□□ 2.03
MEGF6-206ENST00000491842 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.03
MEGF6-206ENST00000491842 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.03
MEGF6-206ENST00000491842 CADPS2Q86UW7 1296 aa27.68■■■□□ 2.02
MEGF6-206ENST00000491842 NRXN1Q9ULB1 1477 aa27.68■■■□□ 2.02
MEGF6-206ENST00000491842 LAMC1P11047 1609 aa27.66■■■□□ 2.02
MEGF6-206ENST00000491842 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
MEGF6-206ENST00000491842 L3MBTL2Q969R5 705 aa27.64■■■□□ 2.02
MEGF6-206ENST00000491842 PTCH1Q13635 1447 aa27.64■■■□□ 2.02
MEGF6-206ENST00000491842 SLAIN2Q9P270 581 aa27.63■■■□□ 2.01
MEGF6-206ENST00000491842 ROBO2Q9HCK4 1378 aa27.62■■■□□ 2.01
MEGF6-206ENST00000491842 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
MEGF6-206ENST00000491842 ABCC11Q96J66 1382 aa27.6■■■□□ 2.01
MEGF6-206ENST00000491842 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
MEGF6-206ENST00000491842 TONSLQ96HA7 1378 aa27.59■■■□□ 2.01
MEGF6-206ENST00000491842 WAPLQ7Z5K2 1190 aa27.58■■■□□ 2.01
MEGF6-206ENST00000491842 POGKQ9P215 609 aa27.58■■■□□ 2.01
MEGF6-206ENST00000491842 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa27.57■■■□□ 2
MEGF6-206ENST00000491842 HSPA1LP34931 641 aa27.56■■■□□ 2
MEGF6-206ENST00000491842 TRAK1Q9UPV9 953 aa27.56■■■□□ 2
MEGF6-206ENST00000491842 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa27.56■■■□□ 2
MEGF6-206ENST00000491842 SIRT1Q96EB6 747 aa27.55■■■□□ 2
MEGF6-206ENST00000491842 DCCP43146 1447 aa27.54■■■□□ 2
MEGF6-206ENST00000491842 PRAG1Q86YV5 1406 aa27.54■■■□□ 2
MEGF6-206ENST00000491842 TECPR2O15040 1411 aa27.53■■■□□ 2
MEGF6-206ENST00000491842 FAM135BQ49AJ0 1406 aa27.53■■■□□ 2
MEGF6-206ENST00000491842 KNDC1Q76NI1 1749 aa27.53■■■□□ 2
MEGF6-206ENST00000491842 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP27.52■■■□□ 2
MEGF6-206ENST00000491842 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
MEGF6-206ENST00000491842 PRAM1Q96QH2 718 aa27.51■■□□□ 1.99
MEGF6-206ENST00000491842 NALCNQ8IZF0 1738 aa27.49■■□□□ 1.99
MEGF6-206ENST00000491842 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa27.48■■□□□ 1.99
MEGF6-206ENST00000491842 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.5 ms