RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491269.1

C3orf18-211, Transcript of chromosome 3 open reading frame 18, humanhuman

TSL 4

Gene C3orf18, Length 531 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf18-211ENST00000491269 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa31.65■■■□□ 2.66
C3orf18-211ENST00000491269 ZFYVE9O95405 1425 aa31.65■■■□□ 2.66
C3orf18-211ENST00000491269 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP31.63■■■□□ 2.65
C3orf18-211ENST00000491269 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP31.63■■■□□ 2.65
C3orf18-211ENST00000491269 HDGFP51858 240 aaKnown RBP31.57■■■□□ 2.64
C3orf18-211ENST00000491269 LRRC7Q96NW7 1537 aa31.56■■■□□ 2.64
C3orf18-211ENST00000491269 FOXD1Q16676 465 aa31.56■■■□□ 2.64
C3orf18-211ENST00000491269 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa31.55■■■□□ 2.64
C3orf18-211ENST00000491269 CLTCL1P53675 1640 aa31.54■■■□□ 2.64
C3orf18-211ENST00000491269 TRPM2O94759 1503 aa31.54■■■□□ 2.64
C3orf18-211ENST00000491269 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP31.53■■■□□ 2.64
C3orf18-211ENST00000491269 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP31.53■■■□□ 2.64
C3orf18-211ENST00000491269 SETD5Q9C0A6 1442 aa31.5■■■□□ 2.63
C3orf18-211ENST00000491269 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
C3orf18-211ENST00000491269 KCNA6P17658 529 aa31.48■■■□□ 2.63
C3orf18-211ENST00000491269 PIP4K2BP78356 416 aa31.48■■■□□ 2.63
C3orf18-211ENST00000491269 MPHOSPH9Q99550 1183 aa31.47■■■□□ 2.63
C3orf18-211ENST00000491269 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP31.46■■■□□ 2.63
C3orf18-211ENST00000491269 TOM1O60784 492 aa31.45■■■□□ 2.63
C3orf18-211ENST00000491269 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa31.43■■■□□ 2.62
C3orf18-211ENST00000491269 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa31.42■■■□□ 2.62
C3orf18-211ENST00000491269 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP31.41■■■□□ 2.62
C3orf18-211ENST00000491269 TBX22Q9Y458 520 aa31.4■■■□□ 2.62
C3orf18-211ENST00000491269 KIF1BO60333 1816 aa31.4■■■□□ 2.62
C3orf18-211ENST00000491269 ALKQ9UM73 1620 aa31.39■■■□□ 2.62
C3orf18-211ENST00000491269 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP31.39■■■□□ 2.62
C3orf18-211ENST00000491269 TMEM94Q12767 1356 aa31.39■■■□□ 2.62
C3orf18-211ENST00000491269 NWD1Q149M9 1564 aa31.36■■■□□ 2.61
C3orf18-211ENST00000491269 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa31.35■■■□□ 2.61
C3orf18-211ENST00000491269 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
C3orf18-211ENST00000491269 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP31.31■■■□□ 2.6
C3orf18-211ENST00000491269 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa31.31■■■□□ 2.6
C3orf18-211ENST00000491269 DIP2AQ14689 1571 aa31.3■■■□□ 2.6
C3orf18-211ENST00000491269 CCDC144AA2RUR9 1427 aa31.3■■■□□ 2.6
C3orf18-211ENST00000491269 HSPA1LP34931 641 aa31.29■■■□□ 2.6
C3orf18-211ENST00000491269 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa31.27■■■□□ 2.6
C3orf18-211ENST00000491269 PTPRUQ92729 1446 aa31.27■■■□□ 2.6
C3orf18-211ENST00000491269 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP31.26■■■□□ 2.6
C3orf18-211ENST00000491269 RGL3Q3MIN7 710 aa31.26■■■□□ 2.59
C3orf18-211ENST00000491269 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa31.25■■■□□ 2.59
C3orf18-211ENST00000491269 PIK3R4Q99570 1358 aa31.24■■■□□ 2.59
C3orf18-211ENST00000491269 METP08581 1390 aa31.23■■■□□ 2.59
C3orf18-211ENST00000491269 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa31.22■■■□□ 2.59
C3orf18-211ENST00000491269 VGFO15240 615 aaPredicted RBP31.21■■■□□ 2.59
C3orf18-211ENST00000491269 C14orf37Q86TY3 774 aa31.19■■■□□ 2.58
C3orf18-211ENST00000491269 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa31.18■■■□□ 2.58
C3orf18-211ENST00000491269 MSH6P52701 1360 aa31.17■■■□□ 2.58
C3orf18-211ENST00000491269 PPLO60437 1756 aa31.17■■■□□ 2.58
C3orf18-211ENST00000491269 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa31.13■■■□□ 2.57
C3orf18-211ENST00000491269 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
C3orf18-211ENST00000491269 HRCP23327 699 aa31.11■■■□□ 2.57
C3orf18-211ENST00000491269 DISP3Q9P2K9 1392 aa31.07■■■□□ 2.56
C3orf18-211ENST00000491269 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP31.07■■■□□ 2.56
C3orf18-211ENST00000491269 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa31.07■■■□□ 2.56
C3orf18-211ENST00000491269 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa31.06■■■□□ 2.56
C3orf18-211ENST00000491269 SLAIN2Q9P270 581 aa31.06■■■□□ 2.56
C3orf18-211ENST00000491269 FAM135BQ49AJ0 1406 aa31.06■■■□□ 2.56
C3orf18-211ENST00000491269 C19orf44Q9H6X5 657 aa31.05■■■□□ 2.56
C3orf18-211ENST00000491269 IFT172Q9UG01 1749 aa31.04■■■□□ 2.56
C3orf18-211ENST00000491269 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP31.04■■■□□ 2.56
C3orf18-211ENST00000491269 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa31.03■■■□□ 2.56
C3orf18-211ENST00000491269 ATF3P18847 181 aa31.01■■■□□ 2.55
C3orf18-211ENST00000491269 CADPS2Q86UW7 1296 aa30.98■■■□□ 2.55
C3orf18-211ENST00000491269 ROBO2Q9HCK4 1378 aa30.97■■■□□ 2.55
C3orf18-211ENST00000491269 TMEM132EQ6IEE7 984 aa30.95■■■□□ 2.55
C3orf18-211ENST00000491269 PIK3C2GO75747 1445 aa30.94■■■□□ 2.54
C3orf18-211ENST00000491269 STK26Q9P289 416 aa30.94■■■□□ 2.54
C3orf18-211ENST00000491269 PTCH1Q13635 1447 aa30.91■■■□□ 2.54
C3orf18-211ENST00000491269 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa30.9■■■□□ 2.54
C3orf18-211ENST00000491269 NALCNQ8IZF0 1738 aa30.9■■■□□ 2.54
C3orf18-211ENST00000491269 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa30.89■■■□□ 2.54
C3orf18-211ENST00000491269 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa30.89■■■□□ 2.54
C3orf18-211ENST00000491269 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP30.88■■■□□ 2.53
C3orf18-211ENST00000491269 CFAP70Q5T0N1 1121 aa30.88■■■□□ 2.53
C3orf18-211ENST00000491269 DCCP43146 1447 aa30.87■■■□□ 2.53
C3orf18-211ENST00000491269 MYOM2P54296 1465 aa30.87■■■□□ 2.53
C3orf18-211ENST00000491269 NRXN1Q9ULB1 1477 aa30.86■■■□□ 2.53
C3orf18-211ENST00000491269 DCAF11Q8TEB1 546 aa30.85■■■□□ 2.53
C3orf18-211ENST00000491269 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP30.85■■■□□ 2.53
C3orf18-211ENST00000491269 MST1RQ04912 1400 aa30.84■■■□□ 2.53
C3orf18-211ENST00000491269 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
C3orf18-211ENST00000491269 BRINP3Q76B58 766 aa30.84■■■□□ 2.53
C3orf18-211ENST00000491269 PHLPP1O60346 1717 aa30.84■■■□□ 2.53
C3orf18-211ENST00000491269 PRAG1Q86YV5 1406 aa30.83■■■□□ 2.53
C3orf18-211ENST00000491269 ILDR2Q71H61 639 aa30.83■■■□□ 2.53
C3orf18-211ENST00000491269 WAPLQ7Z5K2 1190 aa30.83■■■□□ 2.53
C3orf18-211ENST00000491269 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP30.8■■■□□ 2.52
C3orf18-211ENST00000491269 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP30.79■■■□□ 2.52
C3orf18-211ENST00000491269 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa30.79■■■□□ 2.52
C3orf18-211ENST00000491269 ABCC11Q96J66 1382 aa30.78■■■□□ 2.52
C3orf18-211ENST00000491269 TECPR2O15040 1411 aa30.77■■■□□ 2.52
C3orf18-211ENST00000491269 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP30.75■■■□□ 2.51
C3orf18-211ENST00000491269 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP30.74■■■□□ 2.51
C3orf18-211ENST00000491269 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP30.73■■■□□ 2.51
C3orf18-211ENST00000491269 C1orf167Q5SNV9 1468 aa30.73■■■□□ 2.51
C3orf18-211ENST00000491269 KNDC1Q76NI1 1749 aa30.73■■■□□ 2.51
C3orf18-211ENST00000491269 LAMC1P11047 1609 aa30.73■■■□□ 2.51
C3orf18-211ENST00000491269 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP30.73■■■□□ 2.51
C3orf18-211ENST00000491269 ORAI2Q96SN7 254 aa30.7■■■□□ 2.51
C3orf18-211ENST00000491269 JCADQ9P266 1359 aa30.69■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms