RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 RIMS2Q9UQ26 1411 aa42.42■■■■■ 4.38
HOXB3-211ENST00000490677 DISP3Q9P2K9 1392 aa42.41■■■■■ 4.38
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HOXB3-211ENST00000490677 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP42.39■■■■■ 4.38
HOXB3-211ENST00000490677 HSPA1LP34931 641 aa42.38■■■■■ 4.37
HOXB3-211ENST00000490677 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP42.37■■■■■ 4.37
HOXB3-211ENST00000490677 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa42.37■■■■■ 4.37
HOXB3-211ENST00000490677 KCNA6P17658 529 aa42.33■■■■■ 4.37
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HOXB3-211ENST00000490677 TMEM94Q12767 1356 aa42.26■■■■■ 4.35
HOXB3-211ENST00000490677 ILDR2Q71H61 639 aa42.24■■■■■ 4.35
HOXB3-211ENST00000490677 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa42.23■■■■■ 4.35
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HOXB3-211ENST00000490677 DIP2AQ14689 1571 aa42.19■■■■■ 4.34
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HOXB3-211ENST00000490677 TBX22Q9Y458 520 aa42.15■■■■■ 4.34
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HOXB3-211ENST00000490677 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa42.05■■■■■ 4.32
HOXB3-211ENST00000490677 PIK3R4Q99570 1358 aa42.03■■■■■ 4.32
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HOXB3-211ENST00000490677 SOCS7O14512 581 aa41.82■■■■■ 4.29
HOXB3-211ENST00000490677 SLAIN2Q9P270 581 aa41.81■■■■■ 4.28
HOXB3-211ENST00000490677 PHLPP1O60346 1717 aa41.8■■■■■ 4.28
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HOXB3-211ENST00000490677 C19orf44Q9H6X5 657 aa41.73■■■■■ 4.27
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HOXB3-211ENST00000490677 ATF3P18847 181 aa41.59■■■■■ 4.25
HOXB3-211ENST00000490677 CCDC144AA2RUR9 1427 aa41.59■■■■■ 4.25
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HOXB3-211ENST00000490677 TMEM132EQ6IEE7 984 aa41.17■■■■■ 4.18
HOXB3-211ENST00000490677 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP41.14■■■■■ 4.18
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HOXB3-211ENST00000490677 ORAI2Q96SN7 254 aa41.13■■■■■ 4.17
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