RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485941.2

NBPF3-211, Transcript of NBPF member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NBPF3, Length 921 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3-211ENST00000485941 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa36.05■■■■□ 3.36
NBPF3-211ENST00000485941 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP36.03■■■■□ 3.36
NBPF3-211ENST00000485941 ROCK1Q13464 1354 aa36.02■■■■□ 3.36
NBPF3-211ENST00000485941 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa36.02■■■■□ 3.36
NBPF3-211ENST00000485941 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP36.02■■■■□ 3.36
NBPF3-211ENST00000485941 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP36.02■■■■□ 3.36
NBPF3-211ENST00000485941 GCC2Q8IWJ2 1684 aa36.02■■■■□ 3.36
NBPF3-211ENST00000485941 MYO5BQ9ULV0 1848 aa36.01■■■■□ 3.36
NBPF3-211ENST00000485941 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP36.01■■■■□ 3.36
NBPF3-211ENST00000485941 RIMS2Q9UQ26 1411 aa36■■■■□ 3.35
NBPF3-211ENST00000485941 E9PCH4 1651 aa35.96■■■■□ 3.35
NBPF3-211ENST00000485941 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP35.94■■■■□ 3.34
NBPF3-211ENST00000485941 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa35.94■■■■□ 3.34
NBPF3-211ENST00000485941 IQGAP3Q86VI3 1631 aa35.93■■■■□ 3.34
NBPF3-211ENST00000485941 TBX22Q9Y458 520 aa35.92■■■■□ 3.34
NBPF3-211ENST00000485941 HDGFP51858 240 aaKnown RBP35.89■■■■□ 3.34
NBPF3-211ENST00000485941 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa35.89■■■■□ 3.34
NBPF3-211ENST00000485941 BCANQ96GW7 911 aa35.88■■■■□ 3.33
NBPF3-211ENST00000485941 MSH6P52701 1360 aa35.86■■■■□ 3.33
NBPF3-211ENST00000485941 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP35.85■■■■□ 3.33
NBPF3-211ENST00000485941 SLAIN2Q9P270 581 aa35.84■■■■□ 3.33
NBPF3-211ENST00000485941 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa35.83■■■■□ 3.33
NBPF3-211ENST00000485941 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP35.83■■■■□ 3.33
NBPF3-211ENST00000485941 NUP155O75694 1391 aa35.81■■■■□ 3.32
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NBPF3-211ENST00000485941 PIK3R4Q99570 1358 aa35.77■■■■□ 3.32
NBPF3-211ENST00000485941 DIP2AQ14689 1571 aa35.77■■■■□ 3.32
NBPF3-211ENST00000485941 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP35.77■■■■□ 3.32
NBPF3-211ENST00000485941 POTEAQ6S8J7 498 aa35.73■■■■□ 3.31
NBPF3-211ENST00000485941 PTPRUQ92729 1446 aa35.71■■■■□ 3.31
NBPF3-211ENST00000485941 ITGAEP38570 1179 aa35.69■■■■□ 3.3
NBPF3-211ENST00000485941 PHLPP1O60346 1717 aa35.69■■■■□ 3.3
NBPF3-211ENST00000485941 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP35.67■■■■□ 3.3
NBPF3-211ENST00000485941 JCADQ9P266 1359 aa35.66■■■■□ 3.3
NBPF3-211ENST00000485941 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.66■■■■□ 3.3
NBPF3-211ENST00000485941 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP35.66■■■■□ 3.3
NBPF3-211ENST00000485941 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa35.65■■■■□ 3.3
NBPF3-211ENST00000485941 C19orf44Q9H6X5 657 aa35.65■■■■□ 3.3
NBPF3-211ENST00000485941 TRPM2O94759 1503 aa35.64■■■■□ 3.3
NBPF3-211ENST00000485941 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa35.62■■■■□ 3.29
NBPF3-211ENST00000485941 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa35.6■■■■□ 3.29
NBPF3-211ENST00000485941 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa35.6■■■■□ 3.29
NBPF3-211ENST00000485941 CADPS2Q86UW7 1296 aa35.6■■■■□ 3.29
NBPF3-211ENST00000485941 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP35.57■■■■□ 3.29
NBPF3-211ENST00000485941 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP35.57■■■■□ 3.28
NBPF3-211ENST00000485941 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP35.56■■■■□ 3.28
NBPF3-211ENST00000485941 C14orf37Q86TY3 774 aa35.54■■■■□ 3.28
NBPF3-211ENST00000485941 LRP6O75581 1613 aa35.53■■■■□ 3.28
NBPF3-211ENST00000485941 ATF3P18847 181 aa35.52■■■■□ 3.28
NBPF3-211ENST00000485941 METP08581 1390 aa35.51■■■■□ 3.28
NBPF3-211ENST00000485941 NAIPQ13075 1403 aa35.51■■■■□ 3.28
NBPF3-211ENST00000485941 DCCP43146 1447 aa35.5■■■■□ 3.27
NBPF3-211ENST00000485941 BRINP3Q76B58 766 aa35.49■■■■□ 3.27
NBPF3-211ENST00000485941 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa35.49■■■■□ 3.27
NBPF3-211ENST00000485941 CLTCL1P53675 1640 aa35.49■■■■□ 3.27
NBPF3-211ENST00000485941 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa35.47■■■■□ 3.27
NBPF3-211ENST00000485941 SHPRHQ149N8 1683 aa35.44■■■■□ 3.26
NBPF3-211ENST00000485941 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP35.43■■■■□ 3.26
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NBPF3-211ENST00000485941 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa35.38■■■■□ 3.25
NBPF3-211ENST00000485941 SETD5Q9C0A6 1442 aa35.35■■■■□ 3.25
NBPF3-211ENST00000485941 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa35.34■■■■□ 3.25
NBPF3-211ENST00000485941 HFM1A2PYH4 1435 aa35.32■■■■□ 3.25
NBPF3-211ENST00000485941 NHSL1Q5SYE7 1610 aa35.32■■■■□ 3.25
NBPF3-211ENST00000485941 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP35.32■■■■□ 3.24
NBPF3-211ENST00000485941 KIF1BO60333 1816 aa35.31■■■■□ 3.24
NBPF3-211ENST00000485941 NALCNQ8IZF0 1738 aa35.29■■■■□ 3.24
NBPF3-211ENST00000485941 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP35.28■■■■□ 3.24
NBPF3-211ENST00000485941 PRAG1Q86YV5 1406 aa35.26■■■■□ 3.24
NBPF3-211ENST00000485941 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP35.24■■■■□ 3.23
NBPF3-211ENST00000485941 PTCH1Q13635 1447 aa35.23■■■■□ 3.23
NBPF3-211ENST00000485941 VGFO15240 615 aaPredicted RBP35.22■■■■□ 3.23
NBPF3-211ENST00000485941 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP35.21■■■■□ 3.23
NBPF3-211ENST00000485941 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa35.21■■■■□ 3.23
NBPF3-211ENST00000485941 ROBO2Q9HCK4 1378 aa35.21■■■■□ 3.23
NBPF3-211ENST00000485941 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP35.2■■■■□ 3.23
NBPF3-211ENST00000485941 C1orf167Q5SNV9 1468 aa35.2■■■■□ 3.23
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NBPF3-211ENST00000485941 LAMC1P11047 1609 aa35.17■■■■□ 3.22
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NBPF3-211ENST00000485941 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP35.17■■■■□ 3.22
NBPF3-211ENST00000485941 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP35.17■■■■□ 3.22
NBPF3-211ENST00000485941 PNPLA6Q8IY17 1366 aa35.16■■■■□ 3.22
NBPF3-211ENST00000485941 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP35.16■■■■□ 3.22
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NBPF3-211ENST00000485941 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP35.11■■■■□ 3.21
NBPF3-211ENST00000485941 RXRBP28702 533 aa35.1■■■■□ 3.21
NBPF3-211ENST00000485941 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP35.1■■■■□ 3.21
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NBPF3-211ENST00000485941 ORAI2Q96SN7 254 aa35.07■■■■□ 3.2
NBPF3-211ENST00000485941 FOXD1Q16676 465 aa35.05■■■■□ 3.2
NBPF3-211ENST00000485941 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa35.02■■■■□ 3.2
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NBPF3-211ENST00000485941 C8orf37Q96NL8 207 aa34.98■■■■□ 3.19
NBPF3-211ENST00000485941 TECPR2O15040 1411 aa34.96■■■■□ 3.19
NBPF3-211ENST00000485941 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP34.95■■■■□ 3.19
NBPF3-211ENST00000485941 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa34.95■■■■□ 3.18
NBPF3-211ENST00000485941 CCDC144AA2RUR9 1427 aa34.93■■■■□ 3.18
NBPF3-211ENST00000485941 IFT172Q9UG01 1749 aa34.92■■■■□ 3.18
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