RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483521.1

PKN3-202, Transcript of protein kinase N3, humanhuman

TSL 5

Gene PKN3, Length 597 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3-202ENST00000483521 HRCP23327 699 aa27.22■■□□□ 1.95
PKN3-202ENST00000483521 MYO5BQ9ULV0 1848 aa27.22■■□□□ 1.95
PKN3-202ENST00000483521 TRPM2O94759 1503 aa27.21■■□□□ 1.95
PKN3-202ENST00000483521 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP27.21■■□□□ 1.95
PKN3-202ENST00000483521 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
PKN3-202ENST00000483521 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.18■■□□□ 1.94
PKN3-202ENST00000483521 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa27.17■■□□□ 1.94
PKN3-202ENST00000483521 BCANQ96GW7 911 aa27.16■■□□□ 1.94
PKN3-202ENST00000483521 CLTCL1P53675 1640 aa27.12■■□□□ 1.93
PKN3-202ENST00000483521 SLC26A8Q96RN1 970 aa27.11■■□□□ 1.93
PKN3-202ENST00000483521 STRCP1A6NGW2 1772 aa27.1■■□□□ 1.93
PKN3-202ENST00000483521 UBAP1LF5GYI3 381 aa27.1■■□□□ 1.93
PKN3-202ENST00000483521 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
PKN3-202ENST00000483521 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
PKN3-202ENST00000483521 LRRC7Q96NW7 1537 aa27.08■■□□□ 1.93
PKN3-202ENST00000483521 KIF1BO60333 1816 aa27.07■■□□□ 1.92
PKN3-202ENST00000483521 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.07■■□□□ 1.92
PKN3-202ENST00000483521 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.07■■□□□ 1.92
PKN3-202ENST00000483521 KCNA6P17658 529 aa27.05■■□□□ 1.92
PKN3-202ENST00000483521 DIP2AQ14689 1571 aa27.05■■□□□ 1.92
PKN3-202ENST00000483521 TOM1O60784 492 aa27.03■■□□□ 1.92
PKN3-202ENST00000483521 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
PKN3-202ENST00000483521 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
PKN3-202ENST00000483521 TBX22Q9Y458 520 aa27.03■■□□□ 1.92
PKN3-202ENST00000483521 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
PKN3-202ENST00000483521 CLSPNQ9HAW4 1339 aa27.02■■□□□ 1.92
PKN3-202ENST00000483521 NWD1Q149M9 1564 aa27.01■■□□□ 1.92
PKN3-202ENST00000483521 CCDC144AA2RUR9 1427 aa27.01■■□□□ 1.91
PKN3-202ENST00000483521 FOXD1Q16676 465 aa27■■□□□ 1.91
PKN3-202ENST00000483521 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
PKN3-202ENST00000483521 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa26.99■■□□□ 1.91
PKN3-202ENST00000483521 PIK3R4Q99570 1358 aa26.98■■□□□ 1.91
PKN3-202ENST00000483521 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa26.98■■□□□ 1.91
PKN3-202ENST00000483521 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa26.97■■□□□ 1.91
PKN3-202ENST00000483521 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa26.96■■□□□ 1.91
PKN3-202ENST00000483521 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
PKN3-202ENST00000483521 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
PKN3-202ENST00000483521 TMEM94Q12767 1356 aa26.94■■□□□ 1.9
PKN3-202ENST00000483521 VGFO15240 615 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
PKN3-202ENST00000483521 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
PKN3-202ENST00000483521 PIP4K2BP78356 416 aa26.9■■□□□ 1.9
PKN3-202ENST00000483521 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
PKN3-202ENST00000483521 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa26.9■■□□□ 1.9
PKN3-202ENST00000483521 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
PKN3-202ENST00000483521 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.86■■□□□ 1.89
PKN3-202ENST00000483521 ALKQ9UM73 1620 aa26.86■■□□□ 1.89
PKN3-202ENST00000483521 PPLO60437 1756 aa26.84■■□□□ 1.89
PKN3-202ENST00000483521 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa26.84■■□□□ 1.89
PKN3-202ENST00000483521 MSH6P52701 1360 aa26.84■■□□□ 1.89
PKN3-202ENST00000483521 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa26.83■■□□□ 1.89
PKN3-202ENST00000483521 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.83■■□□□ 1.88
PKN3-202ENST00000483521 RGL3Q3MIN7 710 aa26.81■■□□□ 1.88
PKN3-202ENST00000483521 PTPRUQ92729 1446 aa26.8■■□□□ 1.88
PKN3-202ENST00000483521 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
PKN3-202ENST00000483521 METP08581 1390 aa26.79■■□□□ 1.88
PKN3-202ENST00000483521 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
PKN3-202ENST00000483521 C14orf37Q86TY3 774 aa26.77■■□□□ 1.88
PKN3-202ENST00000483521 IFT172Q9UG01 1749 aa26.75■■□□□ 1.87
PKN3-202ENST00000483521 HSPA1LP34931 641 aa26.74■■□□□ 1.87
PKN3-202ENST00000483521 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
PKN3-202ENST00000483521 FAM135BQ49AJ0 1406 aa26.72■■□□□ 1.87
PKN3-202ENST00000483521 C19orf44Q9H6X5 657 aa26.71■■□□□ 1.87
PKN3-202ENST00000483521 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa26.7■■□□□ 1.87
PKN3-202ENST00000483521 PTCH1Q13635 1447 aa26.68■■□□□ 1.86
PKN3-202ENST00000483521 ATF3P18847 181 aa26.68■■□□□ 1.86
PKN3-202ENST00000483521 CADPS2Q86UW7 1296 aa26.68■■□□□ 1.86
PKN3-202ENST00000483521 PIK3C2GO75747 1445 aa26.67■■□□□ 1.86
PKN3-202ENST00000483521 DCCP43146 1447 aa26.67■■□□□ 1.86
PKN3-202ENST00000483521 PRAG1Q86YV5 1406 aa26.67■■□□□ 1.86
PKN3-202ENST00000483521 SLAIN2Q9P270 581 aa26.67■■□□□ 1.86
PKN3-202ENST00000483521 MYOM2P54296 1465 aa26.67■■□□□ 1.86
PKN3-202ENST00000483521 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
PKN3-202ENST00000483521 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa26.63■■□□□ 1.85
PKN3-202ENST00000483521 NRXN1Q9ULB1 1477 aa26.62■■□□□ 1.85
PKN3-202ENST00000483521 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa26.62■■□□□ 1.85
PKN3-202ENST00000483521 STAC3Q96MF2 364 aa26.6■■□□□ 1.85
PKN3-202ENST00000483521 ROBO2Q9HCK4 1378 aa26.59■■□□□ 1.85
PKN3-202ENST00000483521 LAMC1P11047 1609 aa26.59■■□□□ 1.85
PKN3-202ENST00000483521 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.59■■□□□ 1.85
PKN3-202ENST00000483521 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
PKN3-202ENST00000483521 TECPR2O15040 1411 aa26.56■■□□□ 1.84
PKN3-202ENST00000483521 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
PKN3-202ENST00000483521 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.55■■□□□ 1.84
PKN3-202ENST00000483521 NALCNQ8IZF0 1738 aa26.54■■□□□ 1.84
PKN3-202ENST00000483521 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa26.54■■□□□ 1.84
PKN3-202ENST00000483521 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.53■■□□□ 1.84
PKN3-202ENST00000483521 ABCC11Q96J66 1382 aa26.53■■□□□ 1.84
PKN3-202ENST00000483521 KNDC1Q76NI1 1749 aa26.51■■□□□ 1.83
PKN3-202ENST00000483521 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
PKN3-202ENST00000483521 TMEM132EQ6IEE7 984 aa26.51■■□□□ 1.83
PKN3-202ENST00000483521 STK26Q9P289 416 aa26.51■■□□□ 1.83
PKN3-202ENST00000483521 MST1RQ04912 1400 aa26.5■■□□□ 1.83
PKN3-202ENST00000483521 CFAP70Q5T0N1 1121 aa26.49■■□□□ 1.83
PKN3-202ENST00000483521 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.48■■□□□ 1.83
PKN3-202ENST00000483521 PHLPP1O60346 1717 aa26.47■■□□□ 1.83
PKN3-202ENST00000483521 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
PKN3-202ENST00000483521 BRINP3Q76B58 766 aa26.45■■□□□ 1.82
PKN3-202ENST00000483521 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
PKN3-202ENST00000483521 SIRT1Q96EB6 747 aa26.44■■□□□ 1.82
PKN3-202ENST00000483521 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83 ms