RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480665.1

TNS1-216, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 2

Gene TNS1, Length 758 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-216ENST00000480665 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
TNS1-216ENST00000480665 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.36■■□□□ 1.33
TNS1-216ENST00000480665 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
TNS1-216ENST00000480665 STAG3Q9UJ98 1225 aa23.34■■□□□ 1.33
TNS1-216ENST00000480665 RIMS2Q9UQ26 1411 aa23.33■■□□□ 1.33
TNS1-216ENST00000480665 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa23.33■■□□□ 1.33
TNS1-216ENST00000480665 KCNA6P17658 529 aa23.33■■□□□ 1.33
TNS1-216ENST00000480665 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
TNS1-216ENST00000480665 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
TNS1-216ENST00000480665 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa23.32■■□□□ 1.32
TNS1-216ENST00000480665 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa23.32■■□□□ 1.32
TNS1-216ENST00000480665 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
TNS1-216ENST00000480665 FAM135BQ49AJ0 1406 aa23.29■■□□□ 1.32
TNS1-216ENST00000480665 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa23.29■■□□□ 1.32
TNS1-216ENST00000480665 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.26■■□□□ 1.31
TNS1-216ENST00000480665 NUP155O75694 1391 aa23.24■■□□□ 1.31
TNS1-216ENST00000480665 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
TNS1-216ENST00000480665 DIP2AQ14689 1571 aa23.23■■□□□ 1.31
TNS1-216ENST00000480665 ITGAEP38570 1179 aa23.21■■□□□ 1.31
TNS1-216ENST00000480665 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
TNS1-216ENST00000480665 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
TNS1-216ENST00000480665 PTPRUQ92729 1446 aa23.21■■□□□ 1.31
TNS1-216ENST00000480665 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
TNS1-216ENST00000480665 CLTCL1P53675 1640 aa23.19■■□□□ 1.3
TNS1-216ENST00000480665 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
TNS1-216ENST00000480665 NAIPQ13075 1403 aa23.17■■□□□ 1.3
TNS1-216ENST00000480665 TBX22Q9Y458 520 aa23.17■■□□□ 1.3
TNS1-216ENST00000480665 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
TNS1-216ENST00000480665 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa23.16■■□□□ 1.3
TNS1-216ENST00000480665 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
TNS1-216ENST00000480665 TRPM2O94759 1503 aa23.13■■□□□ 1.29
TNS1-216ENST00000480665 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa23.13■■□□□ 1.29
TNS1-216ENST00000480665 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
TNS1-216ENST00000480665 PHLPP1O60346 1717 aa23.13■■□□□ 1.29
TNS1-216ENST00000480665 MSH6P52701 1360 aa23.13■■□□□ 1.29
TNS1-216ENST00000480665 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
TNS1-216ENST00000480665 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.1■■□□□ 1.29
TNS1-216ENST00000480665 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP23.1■■□□□ 1.29
TNS1-216ENST00000480665 BCANQ96GW7 911 aa23.1■■□□□ 1.29
TNS1-216ENST00000480665 PIK3R4Q99570 1358 aa23.1■■□□□ 1.29
TNS1-216ENST00000480665 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
TNS1-216ENST00000480665 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
TNS1-216ENST00000480665 SLAIN2Q9P270 581 aa23.07■■□□□ 1.28
TNS1-216ENST00000480665 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
TNS1-216ENST00000480665 METP08581 1390 aa23.05■■□□□ 1.28
TNS1-216ENST00000480665 LRP6O75581 1613 aa23.04■■□□□ 1.28
TNS1-216ENST00000480665 HFM1A2PYH4 1435 aa23.04■■□□□ 1.28
TNS1-216ENST00000480665 HDGFP51858 240 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
TNS1-216ENST00000480665 NALCNQ8IZF0 1738 aa23.02■■□□□ 1.28
TNS1-216ENST00000480665 POTEAQ6S8J7 498 aa23.01■■□□□ 1.27
TNS1-216ENST00000480665 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa23.01■■□□□ 1.27
TNS1-216ENST00000480665 KIF1BO60333 1816 aa23.01■■□□□ 1.27
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TNS1-216ENST00000480665 JCADQ9P266 1359 aa22.97■■□□□ 1.27
TNS1-216ENST00000480665 DCCP43146 1447 aa22.97■■□□□ 1.27
TNS1-216ENST00000480665 MST1RQ04912 1400 aa22.97■■□□□ 1.27
TNS1-216ENST00000480665 NHSL1Q5SYE7 1610 aa22.97■■□□□ 1.27
TNS1-216ENST00000480665 C19orf44Q9H6X5 657 aa22.96■■□□□ 1.27
TNS1-216ENST00000480665 PPLO60437 1756 aa22.95■■□□□ 1.26
TNS1-216ENST00000480665 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.95■■□□□ 1.26
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TNS1-216ENST00000480665 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.91■■□□□ 1.26
TNS1-216ENST00000480665 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.91■■□□□ 1.26
TNS1-216ENST00000480665 CADPS2Q86UW7 1296 aa22.91■■□□□ 1.26
TNS1-216ENST00000480665 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
TNS1-216ENST00000480665 C14orf37Q86TY3 774 aa22.88■■□□□ 1.25
TNS1-216ENST00000480665 PTCH1Q13635 1447 aa22.87■■□□□ 1.25
TNS1-216ENST00000480665 IFT172Q9UG01 1749 aa22.87■■□□□ 1.25
TNS1-216ENST00000480665 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.87■■□□□ 1.25
TNS1-216ENST00000480665 LAMC1P11047 1609 aa22.86■■□□□ 1.25
TNS1-216ENST00000480665 ATF3P18847 181 aa22.86■■□□□ 1.25
TNS1-216ENST00000480665 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.84■■□□□ 1.25
TNS1-216ENST00000480665 FOXD1Q16676 465 aa22.84■■□□□ 1.25
TNS1-216ENST00000480665 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.82■■□□□ 1.24
TNS1-216ENST00000480665 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.82■■□□□ 1.24
TNS1-216ENST00000480665 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
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TNS1-216ENST00000480665 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
TNS1-216ENST00000480665 C1orf167Q5SNV9 1468 aa22.79■■□□□ 1.24
TNS1-216ENST00000480665 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.76■■□□□ 1.23
TNS1-216ENST00000480665 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.75■■□□□ 1.23
TNS1-216ENST00000480665 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.75■■□□□ 1.23
TNS1-216ENST00000480665 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.73■■□□□ 1.23
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TNS1-216ENST00000480665 TECPR2O15040 1411 aa22.71■■□□□ 1.23
TNS1-216ENST00000480665 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.7■■□□□ 1.22
TNS1-216ENST00000480665 PIK3C2GO75747 1445 aa22.69■■□□□ 1.22
TNS1-216ENST00000480665 ORAI2Q96SN7 254 aa22.69■■□□□ 1.22
TNS1-216ENST00000480665 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.68■■□□□ 1.22
TNS1-216ENST00000480665 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
TNS1-216ENST00000480665 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
TNS1-216ENST00000480665 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
TNS1-216ENST00000480665 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
TNS1-216ENST00000480665 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
TNS1-216ENST00000480665 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.66■■□□□ 1.22
TNS1-216ENST00000480665 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.65■■□□□ 1.22
TNS1-216ENST00000480665 PXDNQ92626 1479 aa22.64■■□□□ 1.21
TNS1-216ENST00000480665 AFF2P51816 1311 aa22.63■■□□□ 1.21
TNS1-216ENST00000480665 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
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