RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478988.2

PDZRN3-AS1-201, PDZRN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PDZRN3-AS1, Length 961 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP8.34□□□□□ -1.07
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ADGRB3O60242 1522 aa8.34□□□□□ -1.08
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 POLA2Q14181 598 aa8.33□□□□□ -1.08
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa8.33□□□□□ -1.08
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa8.32□□□□□ -1.08
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NWD1Q149M9 1564 aa8.31□□□□□ -1.08
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa8.31□□□□□ -1.08
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NOS1P29475 1434 aa8.3□□□□□ -1.08
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 LRRC7Q96NW7 1537 aa8.3□□□□□ -1.08
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ANKLE2Q86XL3 938 aa8.3□□□□□ -1.08
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KANK1Q14678 1352 aa8.29□□□□□ -1.08
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa8.28□□□□□ -1.08
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KIF1BO60333 1816 aa8.27□□□□□ -1.09
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ROCK1Q13464 1354 aa8.27□□□□□ -1.09
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa8.27□□□□□ -1.09
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TMEM2Q9UHN6 1383 aa8.26□□□□□ -1.09
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 UBAP1LF5GYI3 381 aa8.25□□□□□ -1.09
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 DIP2AQ14689 1571 aa8.25□□□□□ -1.09
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 DISP3Q9P2K9 1392 aa8.24□□□□□ -1.09
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ZFYVE9O95405 1425 aa8.24□□□□□ -1.09
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa8.24□□□□□ -1.09
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa8.23□□□□□ -1.09
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 LTKP29376 864 aa8.23□□□□□ -1.09
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CHIC2Q9UKJ5 165 aa8.23□□□□□ -1.09
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TOM1O60784 492 aa8.22□□□□□ -1.09
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SLC52A1Q9NWF4 448 aa8.21□□□□□ -1.1
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CLTCL1P53675 1640 aa8.21□□□□□ -1.1
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PHLPP1O60346 1717 aa8.2□□□□□ -1.1
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PPLO60437 1756 aa8.2□□□□□ -1.1
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 IDI1Q13907 227 aa8.2□□□□□ -1.1
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TXNDC2Q86VQ3 553 aa8.2□□□□□ -1.1
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 EID1Q9Y6B2 187 aa8.2□□□□□ -1.1
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TRPM2O94759 1503 aa8.19□□□□□ -1.1
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa8.19□□□□□ -1.1
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ILDR2Q71H61 639 aa8.19□□□□□ -1.1
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 IFT172Q9UG01 1749 aa8.19□□□□□ -1.1
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa8.19□□□□□ -1.1
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 HSPA1LP34931 641 aa8.18□□□□□ -1.1
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 RIMS2Q9UQ26 1411 aa8.18□□□□□ -1.1
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa8.17□□□□□ -1.1
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SHPRHQ149N8 1683 aa8.17□□□□□ -1.1
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NALCNQ8IZF0 1738 aa8.17□□□□□ -1.1
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SOCS7O14512 581 aa8.16□□□□□ -1.1
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ATXN8OSP0DMR3 200 aa8.16□□□□□ -1.1
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PIP4K2BP78356 416 aa8.16□□□□□ -1.1
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TMEM94Q12767 1356 aa8.16□□□□□ -1.1
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 FAM135BQ49AJ0 1406 aa8.16□□□□□ -1.1
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NHSL1Q5SYE7 1610 aa8.16□□□□□ -1.1
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa8.16□□□□□ -1.1
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 STAG3Q9UJ98 1225 aa8.16□□□□□ -1.1
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa8.15□□□□□ -1.1
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PIK3R4Q99570 1358 aa8.15□□□□□ -1.1
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KCNA6P17658 529 aa8.15□□□□□ -1.1
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NAIPQ13075 1403 aa8.14□□□□□ -1.11
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NUP155O75694 1391 aa8.14□□□□□ -1.11
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 LAMC1P11047 1609 aa8.14□□□□□ -1.11
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 HFM1A2PYH4 1435 aa8.13□□□□□ -1.11
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP8.12□□□□□ -1.11
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SLC26A8Q96RN1 970 aa8.12□□□□□ -1.11
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KNDC1Q76NI1 1749 aa8.12□□□□□ -1.11
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 DCCP43146 1447 aa8.12□□□□□ -1.11
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MSH6P52701 1360 aa8.11□□□□□ -1.11
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 HDGFP51858 240 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TBX22Q9Y458 520 aa8.11□□□□□ -1.11
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PRAG1Q86YV5 1406 aa8.11□□□□□ -1.11
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PTPRUQ92729 1446 aa8.1□□□□□ -1.11
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PLSCR2Q9NRY7 297 aa8.08□□□□□ -1.12
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ITGAEP38570 1179 aa8.07□□□□□ -1.12
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa8.07□□□□□ -1.12
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PTCH1Q13635 1447 aa8.06□□□□□ -1.12
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa8.06□□□□□ -1.12
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa8.05□□□□□ -1.12
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MST1RQ04912 1400 aa8.05□□□□□ -1.12
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SLC24A1O60721 1099 aa8.05□□□□□ -1.12
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 FKBP8Q14318 412 aa8.05□□□□□ -1.12
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 BCANQ96GW7 911 aa8.05□□□□□ -1.12
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